Eukariotik mRNA Sequencing-NGS
Fitur
● Penangkapan poli mRNA sebelum persiapan perpustakaan
● Persiapan pustaka mRNA directional opsional untuk memungkinkan mendapatkan data sekuensing spesifik untai
● Analisis bioinformatik ekspresi gen dan struktur transkrip
Keuntungan
●Keahlian yang luas: Tim kami telah memproses lebih dari 600.000 sampel di BMKGENE, mencakup beragam jenis sampel seperti kultur sel, jaringan, dan cairan tubuh. Kami membawa banyak pengalaman untuk setiap proyek dan telah berhasil menyelesaikan lebih dari 100.000 proyek mRNA-seq di berbagai domain penelitian.
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahap, dari sampel dan persiapan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten, meyakinkan Anda bahwa proyek Anda ada di tangan yang andal.
●Anotasi komprehensif: Kami menggunakan beberapa database untuk secara fungsional membuat anotasi gen yang diekspresikan secara berbeda (DEG) dan melakukan analisis pengayaan yang sesuai. Pendekatan komprehensif ini memberikan wawasan tentang proses seluler dan molekuler yang mendasari respons transkriptome, memastikan Anda sepenuhnya mendapat informasi tentang hasil proyek Anda.
●Dukungan pasca-penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Persyaratan dan pengiriman sampel
| Perpustakaan | Strategi Sequencing | Data direkomendasikan | Kontrol kualitas |
| Poly A diperkaya | Illumina PE150 Dnbseq-t7 | 6 -10 GB | Q30 ≥85% |
Persyaratan Sampel:
Nukleotida:
| Conc. (Ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas | |
| Perpustakaan Standar | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2.5 Kontaminasi protein atau tidak ada protein atau DNA yang ditunjukkan pada gel. | Untuk tanaman: rin ≥4.0; Untuk hewan: rin ≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian terbatas atau tidak ada |
| Perpustakaan Directional | ≥ 10 | ≥ 0,2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2.5 Kontaminasi protein atau tidak ada protein atau DNA yang ditunjukkan pada gel. | Untuk tanaman: rin ≥4.0; Untuk hewan: rin ≥4.5; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian terbatas atau tidak ada |
● Tanaman:
Root, batang atau kelopak: 450 mg
Daun atau biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
●Hewan:
Jantung atau usus: 300 mg
Viscera atau Brain: 240 mg
Otot: 450 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1G
● Arthropoda:
Serangga: 6g
Crustacea: 300 mg
● Darah utuh: 1 tabung
● Sel: 106 sel
Pengiriman sampel yang disarankan
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (timah tidak disarankan)
Label sampel: grup+replikasi misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung Tabel RNA: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya RNASTABLE®) dan dikirim dalam suhu kamar.
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Bioinformatika
Eukariotik Alur kerja analisis sekuensing mRNA
Bioinformatika
ØKontrol kualitas data mentah
ØPenyelarasan genom referensi
ØAnalisis Struktur Transkrip
ØKuantifikasi Ekspresi
ØAnalisis ekspresi diferensial
ØFungsi anotasi dan pengayaan
Penyelarasan genom referensi
Saturasi data
Korelasi sampel dan penilaian ulangan biologis
Gen yang diekspresikan secara berbeda (DEG)
Anotasi fungsional DEG
Pengayaan fungsional DEG
Jelajahi kemajuan yang difasilitasi oleh layanan sekuensing eukariotik NGS mRNA BMKGENE melalui koleksi publikasi yang dikuratori.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan dan triclocarban melemahkan kapasitas penciuman ikan mas dengan membatasi pengakuan bau, mengganggu transduksi sinyal penciuman, dan mengganggu pemrosesan informasi penciuman', penelitian air, 233, hal. 119736. Doi: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus membajak p11 manusia untuk mengarahkan kembali fagosom yang mengandung jamur ke jalur non-degradatif', host sel & mikroba, 31 (3), hlm. 373-388.E10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) Faktor transkripsi TCP yang terlibat dalam pengembangan tunas ma bambu (Dendrocalamus latiflorus munro) ', perbatasan dalam ilmu tanaman, 13, hal. 884443. Doi: 10.3389/fpls.2022.884443/Bibtex.
Wen, X. et al. (2022) 'Genom krisan lavandulifolium dan mekanisme molekuler yang mendasari beragam jenis kapitulum', penelitian hortikultura, 9. doi: 10.1093/jam/uhab022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Nanoreaktor kaskade untuk meningkatkan terapi sonodinamik pada kanker kolorektal melalui augment ROS sinergis dan penyumbatan autophagy', nano hari ini, 49, hal. 101798. Doi: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
