Perpustakaan Pra-Buatan Illumina
Fitur
●Platform:Illumina Novaseq 6000 dan Novaseq X Plus
●Mode Sequencing:PE150 dan PE250
●Kontrol kualitas perpustakaan sebelum diurutkan
●Sequencing Data QC dan pengiriman:Pengiriman laporan QC dan data mentah dalam format FastQ setelah demultiplexing dan penyaringan Q30 membaca
Keuntungan Layanan
●Fleksibilitas layanan pengurutan:Pelanggan dapat memilih untuk mengurutkan dengan jalur, sel aliran, atau dengan jumlah data yang diperlukan (sekuensing jalur parsial).
●Pengalaman luas pada platform pengurutan Illumina:dengan ribuan proyek tertutup dengan berbagai spesies.
●Pengiriman laporan QC Sequencing:dengan metrik kualitas, akurasi data dan kinerja keseluruhan dari proyek sekuensing.
●Proses Sequencing Matang:dengan waktu belokan yang singkat.
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan persyaratan QC yang ketat untuk menjamin pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
Platform sampel
| Platform | Sel aliran | Mode sekuensing | Satuan | Output yang diperkirakan |
| Novaseq x | 10b (8 jalur) | PE150 | Jalur tunggal Jalur parsial | 375GB / LANE |
| 25b (8 jalur) | PE150 | Jalur tunggal Jalur parsial | 1000 GB/jalur | |
| Novaseq 6000 | Sel aliran SP (2 jalur) | PE250 | Sel aliran Jalur tunggal Jalur parsial | 325-400 m Baca / Lane |
| Sel aliran S4 (4 jalur) | PE150 | Sel aliran Jalur tunggal Jalur parsial | ~ 800 GB / jalur |
Persyaratan sampel
| Jumlah Data (x) | Konsentrasi (qPCR/nM) | Volume | |
| Sequencing jalur parsial
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μl |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μl | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μl | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μl | |
| Sequencing jalur | Per jalur | ≥ 1,5 nm / kumpulan perpustakaan | ≥ 25 μl / kumpulan pustaka |
Selain konsentrasi dan jumlah total, pola puncak yang sesuai juga diperlukan.
Catatan: Pengurutan jalur perpustakaan keanekaragaman rendah membutuhkan phix spike-in untuk memastikan panggilan dasar yang kuat.
Kami merekomendasikan untuk mengirimkan perpustakaan pra-pelopor sebagai sampel. Jika Anda memerlukan bmkgene untuk melakukan pengumpulan perpustakaan, silakan merujuk ke
Persyaratan perpustakaan untuk sekuensing jalur parsial.
Ukuran perpustakaan (peta puncak)
Puncak utama harus dalam 300-450 bp.
Perpustakaan harus memiliki puncak utama tunggal, tidak ada kontaminasi adaptor dan tidak ada dimer primer.
Harap hubungi kami jika sampel Anda tidak memenuhi persyaratan material awal.
Alur kerja layanan
Kontrol Kualitas Perpustakaan
Sekuensing
Kontrol Kualitas Data
Pengiriman Proyek
Laporan QC Perpustakaan
Laporan tentang kualitas perpustakaan disediakan sebelum diurutkan, menilai jumlah perpustakaan, dan fragmentasi.
Sequencing QC Report
Tabel 1. Statistik tentang pengurutan data.
| ID sampel | BMKID | Bacaan mentah | Data mentah (BP) | Bacaan bersih (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Gambar 1. Distribusi kualitas di sepanjang bacaan di setiap sampel
Gambar 2. Distribusi konten dasar
Gambar 3. Distribusi konten baca dalam data pengurutan
