Exclusive Agency for Korea

Masuk BMKCloud

Produk

DNA/RNA Sequencing -PACBIO Sequencer

Pacbio Sequencing Platform adalah platform sekuensing membaca panjang, yang juga dikenal sebagai salah satu teknologi sekuensing generasi ketiga (TGS). Teknologi inti, single-molekul real-time (SMRT), memberdayakan generasi membaca dengan panjang basis kilo. Pada dasar "sequencing-by-sintesis", resolusi nukleotida tunggal dicapai oleh waveguide nol-mode (ZMW), di mana hanya volume terbatas di bagian bawah (situs sintesis molekul), diterangi. Selain itu, sekuensing SMRT sebagian besar menghindari bias spesifik urutan dalam sistem NGS, di mana sebagian besar langkah amplifikasi PCR tidak diperlukan dalam proses konstruksi perpustakaan.

Platform: Sekuel II, Revio

Hubungi kami

Detail Layanan

Hasil demo

Fitur

Dua mode sekuensing pada sequencer PACBIO: Continuous Long Read (CLR) dan Circular Consensus Read (CCS)

Mode sekuensing

Ukuran perpustakaan

Data TeoritisHasil (per sel)

Single-baseKetepatan

Aplikasi

Clr

20kb, 30kb, dll.

80 GB hingga 130 GB

Kira -kira. 85%

De novo, Panggilan sv, dll.

CCS

15-20 kb

14 hingga 40 GB/sel (Sekuel II)

70 hingga 110 GB/sel (REVIO)

Tergantung pada sampel

Kira -kira. 99%

De novo, Panggilan snp/indel/sv, iso-seq,

Perbandingan kinerja dan fitur Revio dan Sekuel II

Ketentuan	Sistem Sekuel II	Sistem Revio	Meningkatkan
Kepadatan yang lebih tinggi	8 juta ZMW	25 juta ZMW	3x
Tahap independen	1	4	4x
Waktu lari yang lebih pendek	30 jam	24 jam	1.25x
30x genom manusia hifi / tahun	88	1.300	15x secara keseluruhan

Keuntungan Layanan

● Lebih dari 8 tahun pengalaman pada platform sequencing Pacbio dengan ribuan proyek tertutup dengan berbagai spesies.

● Dilengkapi dengan platform sekuensing PACBIO terbaru, Revio untuk menjamin throughput sekuensing yang cukup.

● Waktu belokan yang lebih cepat, hasil data yang lebih tinggi dan data yang lebih akurat.

● Berkontribusi dalam ratusan publikasi berbasis Pacbio berdampak tinggi.

Persyaratan sampel

Jenis sampel

Jumlah

Konsentrasi （QUBIT®）

Volume

Kemurnian

Yang lain

DNA genomik

Bergantung pada persyaratan data

≥50 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.2;
OD260/230 = 1.8-2.5 ；
Bersihkan puncak pada 260 nm,Tidak ada kontaminasi

Konsentrasi perlu diukur dengan qubit dan qubit/nanopore = 0,8-2.5

Total RNA

≥1.2μg

≥120 ng/μl

≥15μl

OD260/280 = 1.7-2.5;
OD260/230 = 0,5-2,5 ；Tidak ada kontaminasi

Nilai RIN ≥7.5

5≥28S/18S≥1

Alur kerja layanan

Persiapan sampel

Konstruksi Perpustakaan

Sekuensing

Analisis Data

Pengiriman Proyek

Sebelumnya: Produsen OEM Layanan Sequencing MRNA-Long Non-Coding Sequencing-Illumina-Biomarker

Berikutnya: Perpustakaan Pra-Buatan Illumina

1. Hasil data di rumah

Data yang dihasilkan dari 63 sel CCS (dari 26 spesies)

DATA-Pacbio-ccs-15 kb	Rata-rata	Max	Min	Median
Yield - Subreads (GB)	421.12	544.27	221.38	426.58
Yiled - CCS (GB)	25.93	38.59	10.86	25.43
Polimerase N50	145.651	175.430	118.118	144.689
Subreads N50	17.509	23.924	12.485	17.584
CCS N50	14.490	19.034	9.876	14.747
Rata-rata-polimerase	67.995	89.379	49.664	66.433
Panjang Panjang Rata-rata	15.866	21.036	11.657	16.012
Panjang rata-rata-ccs	14.489	19.074	8.575	14.655

Data yang dihasilkan dari 16 sel CLR (dari 76 spesies)

Data-Pacbio-CLR-30KB	Rata-rata	Max	Min	Median
Yield - Subreads (GB)	142.20	291.40	50.55	142.49
Polimerase N50	39.456	121.191	15.389	35.231
Subreads N50	28.490	41.012	14.430	29.063
Rata-rata-polimerase	22.063	48.886	8.747	21.555
Panjang Panjang Rata-rata	17.720	27.225	8.293	17.779

2.Data QC - DemoStatistik tentang hasil data

Mencicipi	CCS membaca num	Total CCS Base (BP)	CCS membaca N50 (BP)	CCS rata -rata panjang (bp)	CCS Longest Read (BP)	Subreads Base (BP)	Tingkat CCS (%)
PB_BMKXXX	3.444.159	54.164.122.586	15.728	15.726	36.110	863.326.330.465	6.27