CIRCRNA Sequencing-Illumina
Fitur
● Penipisan rRNA diikuti oleh persiapan perpustakaan terarah, memungkinkan data sekuensing spesifik untai.
● Alur kerja bioinformatik memungkinkan prediksi circRNA dan kuantifikasi ekspresi
Keuntungan Layanan
●Perpustakaan RNA yang lebih komprehensif:Kami menggunakan penipisan rRNA alih-alih penipisan RNA linier dalam persiapan pra-perpustakaan kami, memastikan bahwa data sekuensing tidak hanya mencakup circRNA tetapi juga mRNA dan lncRNA, memungkinkan analisis bersama dari kumpulan data ini
●Analisis Opsional Jaringan RNA endogen (CERNA) kompetitif: Memberikan wawasan yang lebih dalam tentang mekanisme pengaturan seluler
●Keahlian yang luas: Dengan rekam jejak memproses lebih dari 20.000 sampel di BMKGENE, mencakup beragam jenis sampel dan proyek lncRNA, tim kami membawa banyak pengalaman untuk setiap proyek.
●Kontrol kualitas yang ketat: Kami menerapkan titik kontrol inti di semua tahap, dari sampel dan persiapan perpustakaan hingga pengurutan dan bioinformatika. Pemantauan yang cermat ini memastikan pengiriman hasil berkualitas tinggi secara konsisten.
● Dukungan pasca-penjualan: Komitmen kami melampaui penyelesaian proyek dengan periode layanan setelah penjualan 3 bulan. Selama waktu ini, kami menawarkan tindak lanjut proyek, bantuan pemecahan masalah, dan sesi tanya jawab untuk menangani setiap pertanyaan yang terkait dengan hasilnya.
Persyaratan dan pengiriman sampel
| Perpustakaan | Platform | Data yang disarankan | Data QC |
| rRNA menipiskan perpustakaan directional | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30 ≥85% |
Persyaratan Sampel:
Nukleotida:
| Conc. (Ng/μl) | Jumlah (μg) | Kemurnian | Integritas |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0,5-2.5 Kontaminasi protein atau tidak ada protein atau DNA yang ditunjukkan pada gel. | Rin≥6.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; ketinggian terbatas atau tidak ada |
● Tanaman:
Root, batang atau kelopak: 450 mg
Daun atau biji: 300 mg
Buah: 1.2 g
● Hewan:
Jantung atau usus: 450 mg
Viscera atau Brain: 240 mg
Otot: 600 mg
Tulang, Rambut atau Kulit: 1.5g
● Arthropoda:
Serangga: 9g
Crustacea: 450 mg
● Darah utuh:2 tabung
● Sel: 106 sel
● Serum dan plasma: 6 ml
Pengiriman sampel yang disarankan
Wadah: 2 ml tabung centrifuge (timah tidak disarankan)
Label sampel: grup+replikasi misalnya A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pengiriman:
1. Es kering: Sampel perlu dikemas dalam kantong dan dikubur dalam es kering.
2. Tabung RNASTABLE: Sampel RNA dapat dikeringkan dalam tabung stabilisasi RNA (misalnya, RNASTABLE®) dan dikirim pada suhu kamar.
Aliran kerja layanan
Desain Eksperimen
Pengiriman sampel
Ekstraksi RNA
Konstruksi Perpustakaan
Sekuensing
Analisis Data
Layanan setelah penjualan
Bioinformatika
Prediksi circrna: distribusi kromosom
Circrnas yang diekspresikan secara berbeda - plot gunung berapi
Circrnas yang diekspresikan secara berbeda - pengelompokan hierarkis
Pengayaan fungsional gen inang circrna
Jelajahi kemajuan penelitian yang difasilitasi oleh layanan sekuensing circRNA BMKGENE melalui kumpulan publikasi yang dikuratori.
Wang, X. et al. (2021) 'CPSF4 mengatur pembentukan circRNA dan pembungkaman gen yang dimediasi microRNA pada karsinoma hepatoseluler', Oncogene 2021 40:25, 40 (25), hlm. 4338-4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. ; doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/angka/6.
Y, H. et al. (2023) 'CPSF3 memodulasi keseimbangan transkrip melingkar dan linier dalam karsinoma hepatoseluler'. doi: 10.21203/rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) 'Evaluasi komprehensif sircrnas dalam kardiomiopati sirotik sebelum dan sesudah transplantasi hati', imunofarmakologi internasional, 114, hal. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
