lingkaranRNA

Circular RNA (circRNAs) adalah RNA non-coding yang membentuk struktur melingkar dan memiliki banyak peran pengaturan, termasuk bersaing dengan miRNA untuk gen target dan pengikatan protein. Pipa circRNA BMKCloud dirancang untuk analisis perpustakaan rRNA yang habis dengan genom referensi yang dianotasi dengan baik dan berkualitas tinggi. Analisis dimulai dengan pemangkasan baca dan kontrol kualitas, diikuti dengan penyelarasan baca ke genom referensi dan prediksi sirkRNA baru, ditambah dengan identifikasi sirkRNA yang diketahui dari database. Target miRNA dan host circRNA yang sesuai kemudian diidentifikasi. Analisis ekspresi diferensial mengungkapkan circRNA yang diekspresikan secara berbeda, dan inang yang sesuai diberi anotasi secara fungsional untuk mengekstraksi fungsi biologis yang diperkaya.