● RNA նմուշի վերամշակում Ներառված է RRNA- ի ոչնչացումը, որին հաջորդում է Ուղղորդված RNA գրադարանի պատրաստումը:
● Bioinformatical վերլուծություն `հիմնված հղման գենոմի հավասարեցման վրա
● Վերլուծում է գեների արտահայտությունը եւ DEG- ները, բայց նաեւ տառադարձող կառուցվածքը եւ SRNA վերլուծությունը
●Կրիչ որակի վերահսկումՄենք իրականացնում ենք հիմնական հսկողության կետերը բոլոր փուլերում, նմուշից եւ գրադարանային պատրաստումից մինչեւ հաջորդականացում եւ բիոինֆորմատիկա: Այս մանրակրկիտ մոնիտորինգը ապահովում է հետեւողականորեն բարձրորակ արդյունքների առաքում:
●Շերտի հատուկ հաջորդականության տվյալներRNA գրադարանի պատրաստման շնորհիվ ուղղորդված լինել, հնարավորություն տալով նույնականացնել հակամենետիկ գրառումները:
●Ամբողջական վերլուծություն, որը հարմարեցված է prokaryot- ի տառադարձողներինBioinformatic խողովակաշարը ներառում է ոչ միայն գեների արտահայտման ոչ միայն վերլուծություն, այլեւ պատճենների կառուցվածքի վերլուծություն, ներառյալ օպերաների, utrs- ի եւ խթանման նույնականացում: Այն ներառում է նաեւ SRNA- ների վերլուծություն, մասնավորապես `երկրորդական կառուցվածքի եւ թիրախների կանխատեսում եւ կանխատեսում:
●Հետադարձ կապի աջակցությունՄեր հանձնառությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս 3 ամսվա վաճառքի ծառայության ժամանակահատվածով: Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք նախագծի հետեւում, խնդիրներ ցուցաբերել, եւ Q & A դասընթացներ `արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում անդրադառնալու համար:
Գրադարան | Կիսապայմանագրային ռազմավարություն | Առաջարկվող տվյալները | Որակի հսկողություն |
Rrna Downleted ուղղորդական գրադարան | Illumina PE150 | 1-2 գբ | Q30≥85% |
Conc. (NG / μL) | Գումարը (մկգ) | Մաքրություն | Ամբողջություն |
≥ 50 | ≥ 1 | OD260 / 280 = 1.8-2.0 OD260 / 230 = 1.0-2.5 Սահմանափակ կամ ոչ սպիտակուցային կամ ԴՆԹ-ի աղտոտում, որը ցուցադրվում է գելի վրա: | Rin≥6.5 |
Բեռնարկղ. 2 ML կենտրոնացվող խողովակ (անագի փայլաթիթեղը խորհուրդ չի տրվում)
Նմուշի պիտակավորում. Խումբ + վերարտադրող, օրինակ, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Առաքում.
1. Չոր սառույց. Նմուշները պետք է փաթեթավորվեն պայուսակների մեջ եւ թաղվեն չոր սառույցի մեջ:
2: Rnastable Tubes. RNA նմուշները կարող են չորանալ RNA կայունացման խողովակի մեջ (օրինակ, rnastable®) եւ առաքվել սենյակային ջերմաստիճանում:
Ներառում է հետեւյալ վերլուծությունը.
● Հումքի որակի հսկողություն
● Հավասարեցումը հղման գենոմին
● Գրադարանի որակի գնահատում. RNA մասնատման պատահականություն, Տեղադրեք չափը եւ հաջորդականությունը հագեցվածությունը
● կանխատեսված կոդավորման գեների ֆունկցիոնալ ծանոթագրությունը
● Արտահայտման վերլուծություն. Կապի եւ հիմնական բաղադրիչի վերլուծություն (PCA)
● Դիֆերենցիալ գեն արտահայտություն (DEGS)
● Գործառույթային ծանոթագրություն եւ DEGS- ի հարստացում
● SRNA վերլուծություն. Կանխատեսում, ծանոթագրություն, թիրախ եւ երկրորդային կառուցվածքի կանխատեսում
● Դրոշրատիպի կառուցվածքի վերլուծություն. Օպերաներ, մեկնարկային եւ ավարտական դիրքեր, չմշակված տարածաշրջան (UTS), խթանող եւ POP / Indel վերլուծություն
Հանգստության հագեցույց
Կոդավորման գեների ֆունկցիոնալ ծանոթագրությունը
Նմուշների միջեւ կապ
Դիֆերենցիալ արտահայտված գեներ (DEGS) վերլուծություն
Ֆունկցիոնալ հարստացման վերլուծություն
SRNA ծանոթագրություն
Ուսումնասիրեք BMKGene- ի Nanopore- ի ամբողջ երկարությամբ MRNNA- ի հաջորդ երկար երկարության ծառայություններից, այս ցուցադրված հրապարակման մեջ:
Guan, cp et al. (2018) «Biofilm- ի ձեւավորման համաշխարհային տառադարձող փոփոխությունները, որոնք արձագանքում են Sophorea Alopecuroides- ի ընդհանուր ալկալոիդներին»,Մանրէաբանության լեհերեն ամսագիր, 67 (2), էջ. 223: DOI: 10.21307 / PJM-2018-024: