Գենոմի էվոլյուցիա, պանգենոմ
Ինչ է Pan-Genome:
Կուտակված ապացույցները ցույց են տալիս, որ տեսակների տարբեր շտամների միջեւ տարբերությունը կարող է հսկայական լինել: Մեկ միայնակ գենոմը բավական է, որ մեկ տեսակների գենետիկ տեղեկատվության ամբողջ պատկերը ձեռք բերելու համար: Pan-Genome ուսումնասիրության նպատակը տեսակների ավելի ընդգրկուն գենոմիկական գծապատկեր ձեռք բերելն է եւ տեղադրում է հատկությունների եւ գենետիկական կոդերի միջեւ փոխհարաբերությունները `իրականացնելով բազմաթիվ շտամների գենոմ դե Նովո ժողով, ինչը թույլ է տալիս տարբեր լարում:
Pan-Genome ուսումնասիրության միտումները
Գծապատկեր 1 Pan-Genome- ի հրապարակված հետազոտական թերթերի միտումները:
Նշում. Գծապատկերում ներկայացված է «Pan-Genome» - ը որպես հիմնական բառը որոնելու բնության, բջջային եւ գիտությունների շարքային ամսագրերում հրապարակված հոդվածների վերնագրերը որոնելու համար
ա. Բազմաթիվ նմուշներից կարդում են տեղեկանքը եւ չկատարվածները հավաքվում են վեպի հյուսվածքների: Այս վեպի այս վեպի հաշվարկները ավելացնելով հղման սկզբնական հաջորդականության, կարող է կառուցվել Pangenome տեղեկանք: Դիսպանսելի մարզերը որոշվում են `հիմնվելով քարտեզագրման վրա, որը կարդում է Pangenome:
բ. De Novo Mexctions- ի գենոմների «Նովո» ժողովը թույլ է տալիս բոլոր գենոմի հավասարեցումը մոտեցումներին հայտնաբերել թմրամիջոցների հեռանկարային շրջանները:
գ. Pan-genome գրաֆիկը կարող է կառուցվել բոլոր գենոմի հավասարեցումներից կամ դե Նովոյի գրաֆիկի հավաքից, որն արդյունավետորեն պահպանում է դիսպանսելի շրջանների տարբերակ տեղեկատվությունը որպես գծապատկերների միջոցով եզակի ուղիներ:
Ինչպես կառուցել Pan-Genome:
Գծապատկեր 2 Համահայկական մոտեցումների համեմատությունը1
ա. Բազմաթիվ նմուշներից կարդում են տեղեկանքը եւ չկատարվածները հավաքվում են վեպի հյուսվածքների: Այս վեպի այս վեպի հաշվարկները ավելացնելով հղման սկզբնական հաջորդականության, կարող է կառուցվել Pangenome տեղեկանք: Դիսպանսելի մարզերը որոշվում են `հիմնվելով քարտեզագրման վրա, որը կարդում է Pangenome:
բ. De Novo Mexctions- ի գենոմների «Նովո» ժողովը թույլ է տալիս բոլոր գենոմի հավասարեցումը մոտեցումներին հայտնաբերել թմրամիջոցների հեռանկարային շրջանները:
գ. Pan-genome գրաֆիկը կարող է կառուցվել բոլոր գենոմի հավասարեցումներից կամ դե Նովոյի գրաֆիկի հավաքից, որն արդյունավետորեն պահպանում է դիսպանսելի շրջանների տարբերակ տեղեկատվությունը որպես գծապատկերների միջոցով եզակի ուղիներ:
Վերջերս հրապարակված Pan-genanes
● Բռնաբարության տապան2
● Լոլատո տապան 3
● բրինձ Pan -genomeԵրեք
● Արեւածաղկի Pan-Genome5
Soybean Pan-Genome 6
● բրինձ Pan-GenomeՀա
● Գարու Pan-GenomeՀա
● Whe որենի Pan-GenomeՀա
● sorghum pan-genome10 տարեկան
● Phytoplankton Pan-Genome11
Տեղեկանք
1: Bayer PE, Golicz AA, Scheben A, Batley J, Edward D. Plant Pan-Genanomes- ը նոր տեղեկանք է: Նատ բույսեր: 2020; 6 (8), 914-920: DOI: 10.1038 / S41477-020-0733-0
2-ը: Երգը JM, Guan Z, Hu J, et al. Ութ բարձրորակ գենոմներ բացահայտում են Pan-genome ճարտարապետությունը եւ էկզորամետրերի տարբերակումը Brassica Napus- ի: Նատ բույսեր: 2020; 6 (1), 34-45: DOI: 10.1038 / S41477-019-0577-7
3. Gao L, Gonda I, Sun H, et al. Լոլիկի Pan-Genome- ը բացահայտում է նոր գեները եւ մրգերի համը կարգավորող հազվագյուտ ալլե: NAT GENET. 2019; 51 (6), 1044-1051: DOI: 10.1038 / S41588-019-0410-2
4. Zhao Q, Feng Q, Lu H, al. Pan-Genome վերլուծությունը կարեւորում է մշակված եւ վայրի բրնձի մեջ գենոմիկական տատանումների աստիճանը [հրապարակված ուղղումը հայտնվում է NAT Genet- ում: 2018 օգոստ. 50 (8): 1196]: NAT GENET: 2018; 50 (2), 278-284: DOI: 10.1038 / S41588-018-0041-Z
5. Hübner S, Bercovich N, Todesco M, et al. Արեւածաղկի Pan-Genome վերլուծությունը ցույց է տալիս, որ հիբրիդացումը փոխեց գենի բովանդակությունը եւ հիվանդության դիմադրությունը: Նատ բույսեր: 2019; 5 (1), 54-62: DOI: 10.1038 / S41477-018-0329-0
6. Liu Y, DU H, LI P, et al. Վայրի եւ մշակված սոյայի պանոմեն: Բջիջ: 2020; 182 (1), 162-176.E13: DOI: 10.1016 / J.Cell.2020.05.023
7. Qin p, lu h, du h, et al. 33 գենետիկորեն բազմազան բրինձի հասանելիության թավայի վերլուծությունը բացահայտում է թաքնված գենոմիկական տատանումները [տպագրվել է առցանց տպագիր, 2021 թ. Բջիջ: 2021; S0092-8674 (21) 00581-X: DOI: 10.1016 / J.Cell.2021.04.046
8. JayaKodi m, padmarasu s, haberer g, et al. Գարու Pan-Genome- ը բացահայտում է մուտացիայի բուծման թաքնված ժառանգությունը: Բնություն: 2020; 588 (7837): 284-289: DOI: 10.1038 / S41586-020-2947-8
9. Walkowiak s, gao l, monat c, et al. Cheat որենի բազմակի գենոմները բացահայտում են գլոբալ տատանում ժամանակակից բուծման մեջ: Բնություն: 2020; 588 (7837): 277-283: DOI: 10.1038 / S41586-020-2961-X
10. Tao Y, Luo H, Xu J, et al. Մշակված եւ վայրի մաղձի համահիմնադիրի մեջ լայնածավալ տատանում [տպագրվել է առցանց տպագիր, 2021 թ. Նատ բույսեր: 2021; 10.1038 / S41477-021-00925-X: DOI: 10.1038 / S41477-021-00925-X
11: Երկրպագու x, qiu h, han w, al. Phytoplankton Pangenome- ը բացահայտում է բազմազան պրոկարիային հորիզոնական գեների փոխանցում բազմազան գործառույթների փոխանցում: SCI խորհուրդը: 2020; 6 (18). EABA0111: Հրապարակվել է 2020 ապրիլի 29-ին: DOI: 10.1126 / SCIADV.ABA0111
Ժամանակը `Jan-04-2022