T2T Գենոմի ժողով, անվճար անվճար գենոմ
1stԵրկու բրնձի գենոմներ1
Վերնագիր. Xian / Indica Rice- ի համար GAP-Free Reference Genomes- ի հավաքումը եւ վավերացումը բացահայտում են բույսերի ցենտրոմի ճարտարապետության պատկերացումները
Doi:https://do.org/10.1101/2020.12.24.424073
Տեղադրված է, 2021 հունվարի:
Ինստիտուտ, Huazhong գյուղատնտեսական համալսարան, Չինաստան
Նյութեր
O. Sativa Xian / IndicaԲրնձի սորտեր «Ժենշան 97 (ZS97) եւ 'Minghui 63 (MH63)
Կիսապայմանագրային ռազմավարություն
NGS- ն կարդում է + Hifi- ն կարդում է + CLR Reads + Bionano + Hi-C
Տվյալներ.
ZS97: 8.34 GB (~ 23x) HIFI- ն կարդում է + 48.39 GB (~ 131x) CLR Reads + 25 GB (~ 69x) NGS + 2 Bionano IRYS բջիջներ
MH63: 37.88 GB (~ 103x) HIFI- ն կարդում է + 48.97 GB (~ 132x) CLR Reads + 28 GB (~ 76x) NGS + 2 Bionano IRYS բջիջներ
Գծապատկեր 1 Բրինձի երկու բաց խաղ (MH63 եւ ZS97)
2ndԲանանի գենոմ2
Վերնագիր. Telomere-to-telomere բանանի անկայուն քրոմոսոմներ, օգտագործելով Nanopore Sequencing
Doi:https://do.org/10.1101/2021.04.16.440017
Տեղադրված է, 2021-ի ապրիլի 17-ը:
Ինստիտուտ. Ֆրանսիայի Ունիվերսալե Փարիզ-Սակլայ
Նյութեր
Կրկնակի հապլոիդMusa acuminataսպվուխմալագկաններՈգելDh-pahang)
Կիսապաշտպանության ռազմավարություն եւ տվյալներ.
Hiseq2500 PE250 ռեժիմ + Minion / Propetion (93 GB, ~ 200X) + օպտիկական քարտեզ (DLE-1 + BSPQ1)
Աղյուսակ 1 Մուսա ակումաթայի (DH-Pahang) Գենոմի հավաքույթների համեմատություն
Գծապատկեր 2 Մուսա նրբագեղության ճարտարապետության համեմատություն
3rdPhaeodactlum Tricornutum Genome3
Վերնագիր. Telomere-to-telomere Genome ժողովP
Haeodactylum Tricornutum
Doi:https://do.org/10.1101/2021.05.04.442596
Հրապարակված Ժամը, մայիսի 04, 2021
Ինստիտուտ, Արեւմտյան համալսարան, Կանադա
Նյութեր
Phaeodactylum Tricornutum(Մշակույթի հավաքածու ALGAE եւ PROTOZOA CCAP 1055/1)
Կիսապաշտպանության ռազմավարություն եւ տվյալներ.
1 Oxford Nanopore Minion Flow Cell + A 2 × 75 զույգի միջին ելք Nextseq 550 Run
Գծապատկեր 3 Telomere-telomere GenaMe հավաքման համար
4thHuman CHM13 Գենոմ4
Վերնագիր. Մարդու գենոմի ամբողջական հաջորդականությունը
Doi:https://do.org/10.1101/2021.05.26.24.445798
Հրապարակված Ժամը, մայիսի 27, 2021
Ինստիտուտ. Առողջապահության ազգային ինստիտուտներ (NIH), ԱՄՆ
Նյութեր. Cell Line CHM13
Կիսապաշտպանության ռազմավարություն եւ տվյալներ.
30 PacBio Circular Consulation Sequencing (HiFi), 120 × Oxford Nanopore Ultra-Loft Read Sequencing, 100 × Illumina PCR-Free Sequencing (ILMN), 70 × Illumina / Arima Genomics, Bionano Օպտիկական քարտեզներ, Bionano օպտիկական քարտեզներ, եւ strand-seq
Աղյուսակ 2 GRCH38 եւ T2T-CHM13 մարդկային գենոմի հավաքների համեմատություն
Տեղեկանք
1.Sergey Nurk et al. Մարդկային գենոմի ամբողջական հաջորդականությունը: Biorxiv 2021.05.26.445798; Doi:https://do.org/10.1101/2021.05.26.24.445798
2. Caroline Belser et al. Telomere-to-telomere բանանի անկայուն քրոմոսոմներ `օգտագործելով Nanopore Sequencing: Biorxiv 2021.04.16.440017; Doi:https://do.org/10.1101/2021.04.16.440017
3.Daniel J. Giguere et al. Telomere-to-telomere Genome Genome ժողովը Tricornutum. Biorxiv 2021.05.04.442596; Doi:https://do.org/10.1101/2021.05.04.442596
4.JIa-Ming երգ եւ al. Xian / Indica Rice- ի համար GAP- ի անվճար տեղեկատուի հավաքումը եւ վավերացումը բացահայտում են բույսերի ցենտրոմի ճարտարապետության պատկերացումները: Biorxiv 2020.12.24.424073; Doi:https://do.org/10.1101/2020.12.24.424073
Ժամանակը `Jan-06-2022