mRNA-seq (NGS) – De novo

mRNA հաջորդականությունը թույլ է տալիս պրոֆիլավորել բոլոր mRNA տառադարձումները բջիջներում հատուկ պայմաններում և լայնորեն կիրառվող տեխնոլոգիա է տարբեր հետազոտական ​​ոլորտներում: BMKCloud De novo mRNA-seq խողովակաշարը նախագծված է վերլուծելու poly-A հարստացված հաջորդականության գրադարանները, երբ տեղեկատու գենոմը հասանելի չէ: Խողովակաշարը սկսվում է որակի հսկողությամբ, որին հաջորդում էde novoսղագրության հավաքում և unigene հավաքածուի ընտրություն: Միգենի կառուցվածքի վերլուծությունը կանխատեսում է կոդավորման հաջորդականությունը (CDS) և պարզ հաջորդականության կրկնությունները (SSR): Հետագայում, դիֆերենցիալ էքսպրեսիայի վերլուծությունը փորձարկված պայմանների մեջ գտնում է դիֆերենցիալ արտահայտված գեներ (DEGs), որին հաջորդում է ֆունկցիոնալ անոտացիա և DEG-ների հարստացում՝ կենսաբանական պատկերացումներ հանելու համար: