
Մետագենոմիկա (NGS)
Shotgun metagenomics-ը Illumina-ով միկրոբիոմների ուսումնասիրման հանրաճանաչ գործիք է՝ բարդ նմուշներից ԴՆԹ-ի ուղղակի հաջորդականությամբ, ինչը հնարավորություն է տալիս ուսումնասիրել ինչպես տաքսոնոմիական, այնպես էլ ֆունկցիոնալ բազմազանությունը: BMKCloud մետագենոմիական (NGS) խողովակաշարը սկսվում է որակի վերահսկմամբ և մետագենոմի հավաքմամբ, որտեղից գեները կանխատեսվում և հավաքվում են ոչ ավելորդ տվյալների հավաքածուներում, որոնք նշում են գործառույթների և դասակարգման համար՝ օգտագործելով բազմաթիվ տվյալների բազաներ: Այս տեղեկատվությունը օգտագործվում է վերլուծելու ներսում ընտրանքային տաքսոնոմիկ բազմազանությունը (ալֆա բազմազանություն) և նմուշների միջև բազմազանությունը (բետա բազմազանություն): Խմբերի միջև դիֆերենցիալ վերլուծությունը հայտնաբերում է OTU-ներ և կենսաբանական ֆունկցիաներ, որոնք տարբերվում են երկու խմբերի միջև՝ օգտագործելով և՛ պարամետրային, և՛ ոչ պարամետրային թեստերը, մինչդեռ հարաբերակցության վերլուծությունը կապում է այդ տարբերությունները շրջակա միջավայրի գործոնների հետ:
Կենսաինֆորմատիկայի աշխատանքային հոսք
