Լրիվ երկարությամբ MRNA Sequencing-Nanopore
Հատկություններ
● Poly-a MRNA գրավում, որին հաջորդում են CDNA սինթեզը եւ գրադարանի պատրաստումը
● Ամբողջ երկարության պատճենների հաջորդականացում
● Bioinformatical վերլուծություն `հիմնված հղման գենոմի հավասարեցման վրա
● Bioinformatical- ը ներառում է ոչ միայն Gene եւ Isoform- ի մակարդակով ոչ միայն արտահայտություն, այլեւ LNCRNA- ի, Gene Fusions, Poly-adenylation- ի եւ Gene կառուցվածքի մասին
Ծառայության առավելություններ
●Expression- ի քանակականացումը իզոֆորմի մակարդակումՀատկացնելով մանրամասն եւ ճշգրիտ արտահայտման վերլուծություն, վերացման փոփոխություն, որը կարող է դիմակավորված լինել ամբողջ գեների արտահայտությունը վերլուծելիս
●Նվազեցված տվյալների պահանջները.Հաջորդ սերնդի հաջորդականության (NGS) համեմատ, Nanopore Sequencing- ը ցուցադրում է տվյալների ավելի ցածր պահանջներ, թույլ տալով, որ գեների արտահայտման քանակական քանակության ճշգրտության համարժեք մակարդակները փոքր տվյալներով:
●Արտահայտման քանակի ավելի բարձր ճշգրտություն. Թե գեն եւ իզոֆորմի մակարդակում
●Լրացուցիչ տառափոխման տեղեկատվության նույնականացումԱյլընտրանքային պոլիոդենիլացիա, FUSION GENES եւ LCNRNA եւ դրանց թիրախային գեները
●Ընդարձակ փորձաքննությունՄեր թիմը հարուստ փորձ է բերում յուրաքանչյուր նախագծի, ավարտելով ավելի քան 850 նանոպոր ամբողջ երկարությամբ տառադարձող նախագծեր եւ վերամշակել ավելի քան 8000 նմուշ:
●Հետադարձ կապի աջակցությունՄեր հանձնառությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս 3 ամսվա վաճառքի ծառայության ժամանակահատվածով: Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք նախագծի հետեւում, խնդիրներ ցուցաբերել, եւ Q & A դասընթացներ `արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում անդրադառնալու համար:
Նմուշի պահանջներ եւ առաքում
| Գրադարան | Կիսապայմանագրային ռազմավարություն | Առաջարկվող տվյալները | Որակի հսկողություն |
| Պոլի հարստացված | Illumina PE150 | 6/12 ԳԲ | Միջին որակի միավոր. Q10 |
Նմուշի պահանջներ.
Նուկլեոտիդներ.
| Conc. (NG / μL) | Գումարը (մկգ) | Մաքրություն | Ամբողջություն |
| 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Սահմանափակ կամ ոչ սպիտակուցային կամ ԴՆԹ-ի աղտոտում, որը ցուցադրվում է գելի վրա: | Բույսերի համար. Rin≥7.0; Կենդանիների համար. Rin≥7.5; 5.0≥28S / 18S≥1.0; սահմանափակ կամ առանց ելակետային բարձրություն |
● Բույսեր.
Արմատ, ցողուն կամ ծաղկաթերթ, 450 մգ
Տերեւ կամ սերմ. 300 մգ
Մրգեր, 1.2 գ
● Կենդանիներ:
Սիրտ կամ աղիք, 300 մգ
Viscera կամ Brain: 240 մգ
Մկան, 450 մգ
Ոսկորներ, մազեր կամ մաշկ, 1 գ
● arthropods:
Միջատներ, 6 գ
Crustacea: 300 մգ
● Ամբողջ արյունը: 1 խողովակ
● բջիջներ: 106 բջիջներ
Առաջարկվող նմուշի առաքում
Բեռնարկղ. 2 ML կենտրոնացվող խողովակ (անագի փայլաթիթեղը խորհուրդ չի տրվում)
Նմուշի պիտակավորում. Խումբ + վերարտադրող, օրինակ, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Առաքում.
1. Չոր սառույց. Նմուշները պետք է փաթեթավորվեն պայուսակների մեջ եւ թաղվեն չոր սառույցի մեջ:
2: Rnastable Tubes. RNA նմուշները կարող են չորանալ RNA կայունացման խողովակի մեջ (օրինակ, rnastable®) եւ առաքվել սենյակային ջերմաստիճանում:
Ծառայության աշխատանքի հոսքը
Նուկլեոտիդներ.
Նմուշի առաքում
Գրադարանների կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքի ծառայություններ
Ծառայության աշխատանքի հոսքը
Հյուսվածքներ
Փորձերի ձեւավորում
Նմուշի առաքում
RNA արդյունահանում
Գրադարանների կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքի ծառայություններ
● Հումքի տվյալների մշակում
● Դրվագի նույնականացում
● Այլընտրանքային պառակտում
● Արտահայտման քանակականացում գենի մակարդակի եւ իզոֆորմի մակարդակում
● Դիֆերենցիալ արտահայտության վերլուծություն
● Գործառույթ Ծանոթագրություն եւ հարստացում (DEGS եւ DETS)
Այլընտրանքային պղտորման վերլուծություն
Այլընտրանքային պոլիադիայի վերլուծություն (APA)
Lncrna կանխատեսում
Նոր գեների ծանոթագրություն
Կլաստերի հավաքում
Սպիտակուցային սպիտակուցային ցանցեր DEGS- ում
Ուսումնասիրեք BMKGene- ի Nanopore Full-Leftwary Mrna Sequencing Services- ի կողմից հրատարակությունների բուժման միջոցով:
Gong, B. et al. (2023) «Գաղտնիության կինազեկության ֆիքսե ֆամը x20c- ի էպիգենետիկ եւ տարածման ակտիվացումը, որպես ուռուցքային, գենետիկայի եւ գենոմիկայի ամսագիր, 50 (6), էջ 422-433: DOI: 10.1016 / J.JGG.2023.01.008.
Նա, Զ. Եւ Ալ. (2023) «Լիմֆոցիտների ամբողջ երկարությամբ տառադարձող հաջորդականությունը պատասխանում է IFN- γ- ին. 108636: DOI: 10.1016 / J.FSI.2023.108636.
MA, Y. et al. (2023) «Pacbio» եւ Ont RNA հաջորդականության մեթոդների համեմատական վերլուծություն Nemopilema Nomurai Venom նույնականացման համար, գենոմիկա, 115 (6), էջ. 110709: DOI: 10.1016 / J.Ygeno.2023.110709:
Յու, Դ. Et al. (2023) «Նանո-ՍքԵՔ» վերլուծությունը բացահայտում է տարբեր ֆունկցիոնալ հակումներ «Exosomes» - ի եւ մանրէների միջեւ, որը բխում է հումճարի, ցողունային բջիջների հետազոտությունից եւ թերապությունից, 14 (1), էջ: 1-13: DOI: 10.1186 / S13287-023-03491-5 / սեղաններ / 6.
