Էուկարիոտիկ mRNA վերլուծություն (հղման վրա հիմնված և նոր տարբերակները մատչելի են)
Այս խողովակաշարն օգտագործում է NGS RNA-Seq տվյալները որպես մուտքագրում և արդյունք է տալիս մի քանի ներքևի վերլուծություններից, ներառյալ, բայց չսահմանափակվելով հետևյալով.de novoտառադարձման տեղամասի անոտացիա, փոփոխական զուգավորման վերլուծություն, դիֆերենցիալ արտահայտման վերլուծություն, ֆունկցիայի անոտացիա և հարստացման վերլուծություն:
Երկար չկոդավորող ՌՆԹ վերլուծություն
Երկար չկոդավորող ՌՆԹ-ները (lncRNA) 200 նտ-ից ավելի երկարությամբ չկոդավորող տառադարձումներ են և հայտնի են, որ դեր ունեն քրոմատինի կազմակերպման և կարգավորման մեջ: Բարձր թողունակության հաջորդականության տեխնոլոգիաները և բիոինֆորմատիկան մեզ հնարավորություն են տվել հասկանալու lncRNA հաջորդականությունները և դիրքորոշման տեղեկատվությունը` նույնականացնելու lncRNA-ները կարևոր կարգավորիչ գործառույթներով: Այս խողովակաշարը տրամադրում է lncRNA վերլուծություն՝ ի լրումն Էուկարիոտիկ mRNA վերլուծության խողովակաշարում նշված վերլուծությունների:
16S/18S/ITS ամպլիկոնի հաջորդականություն
Amplicon Sequencing մանրէաբանական բազմազանության վերլուծության խողովակաշարը մշակվել է մանրէների բազմազանության նախագծերի վերլուծության տարիների փորձի հիման վրա: Խողովակաշարը պարունակում է ստանդարտացված հիմնական վերլուծություն, որն ընդգրկում է ընթացիկ մանրէաբանական հետազոտության և անհատականացված վերլուծության հիմնական վերլուծության բովանդակությունը: Վերլուծության զեկույցը հարուստ է և համապարփակ՝ անհատական բազմազան վերլուծություններ կատարելու հնարավորությամբ: Բացի այդ, նմուշները և խմբերը կարող են փոփոխվել անմիջապես՝ լրացուցիչ հարմարեցման և վերահսկման համար:
Shotgun Metagenomics վերլուծություն
Shotgun Metagenomic Analysis խողովակաշարն օգտագործում է NGS տվյալներ խառը գենոմային նյութերից, որոնք արդյունահանվել են շրջակա միջավայրի նմուշներից: Ներառված վերլուծությունները մանրամասն տեղեկություններ են տալիս տեսակների բազմազանության և առատության, պոպուլյացիայի կառուցվածքի, ֆիլոգենետիկ հարաբերությունների, ֆունկցիոնալ գեների և շրջակա միջավայրի գործոնների հետ փոխկապակցված ցանցերի մասին:
NGS-WGS տարբերակի վերլուծություն
NGS-WGS Variant Analysis-ը ինտեգրված տարբերակի հայտնաբերման խողովակաշար է, որն իրականացնում է տվյալների որակի վերահսկում, հաջորդականության հավասարեցում, ծանոթագրում և գենային մուտացիաների վերլուծություն: Խողովակաշարը հետևում է GATK-ի լավագույն փորձին SNP-ի և InDel-ի հայտնաբերման համար և օգտագործում է Manta-ն կառուցվածքային տարբերակների զանգերի համար:
Գենոմի լայն ասոցիացիայի ուսումնասիրություն (GWAS)
GWAS խողովակաշարը ներքևում գտնվող վերլուծություն է, որը որպես մուտք է վերցնում նախկինում ստեղծված VCF ֆայլերը և համապատասխան ֆենոտիպային տվյալները մի խումբ անհատների համար: Օգտագործելով հատուկ վիճակագրական մեթոդոլոգիաներ, GWAS-ը նպատակ ունի բացահայտելու գենոմի ամբողջ նուկլեոտիդային տատանումները՝ կապված ֆենոտիպային տարբերությունների հետ: Այն վճռորոշ դեր է խաղում մարդու բարդ հիվանդությունների և բույսերի և կենդանիների բարդ հատկությունների հետ կապված ֆունկցիոնալ գեների ուսումնասիրության մեջ:
Զանգվածային տարանջատման վերլուծություն (BSA)
BSA-ի վերլուծությունը ներառում է ծայրահեղ ֆենոտիպային գծեր ունեցող անհատների միավորումը տարանջատվող պոպուլյացիայից: Համեմատելով դիֆերենցիալ վայրերը համախմբված նմուշների միջև՝ այս մոտեցումը արագորեն բացահայտում է թիրախ գեների հետ կապված սերտորեն կապված մոլեկուլային մարկերները: Լայնորեն օգտագործվում է բույսերի և կենդանիների գենետիկ քարտեզագրման մեջ, այն արժեքավոր գործիք է մարկերների օգնությամբ բուծման համար:
Էվոլյուցիոն գենետիկական վերլուծություն
Էվոլյուցիոն գենետիկական վերլուծության աշխատանքային հոսքը օգտագործում է BMKGENE-ի մեծ փորձը գենետիկ էվոլյուցիայի նախագծերում և ներառում է ֆիլոգենետիկ ծառի կառուցում, կապի անհավասարակշռության վերլուծություն, գենետիկ բազմազանության գնահատում, ընտրովի մաքրման նույնականացում, ազգակցական վերլուծություն, հիմնական բաղադրիչի վերլուծություն և բնակչության կառուցվածքի բնութագրում:
