Էվոլյուցիոն գենետիկա
Ծառայության առավելություններ
Takagi et al.,Գործարանի ամսագիրը2013 թ
●Համապարփակ բիոինֆորմատիկ վերլուծություն.Հնարավորություն տալով գենետիկ բազմազանության գնահատումը, որն արտացոլում է տեսակների էվոլյուցիոն ներուժը եւ բացահայտում է համակողմանի էվոլյուցիայի նվազագույն ազդեցությունը եւ զուգահեռ էվոլյուցիայի նվազագույն ազդեցությունը
●Ընտրովի հարմարեցված վերլուծությունԻնչպես, օրինակ, շեղման ժամանակի եւ արագության գնահատումը, հիմնվելով նապակե եւ ամինաթթուների մակարդակի տատանումների վրա:
●Ընդարձակ փորձաքննություն եւ հրապարակման գրառումներBMKGene- ը ավելի քան 15 տարի է, ինչ կուտակել է բնակչության եւ էվոլյուցիոն գենետիկայի նախագծերի զանգվածային փորձը, ընդգրկելով հազարավոր տեսակներ եւ այլն:
● Բարձրորակ բիոինֆորմատիկայի թիմ եւ վերլուծության կարճ ցիկլԳենոմիայի առաջադեմ վերլուծության մեծ փորձով Bmkgene- ի թիմը համապարփակ վերլուծություններ է մատուցում արագ շրջադարձային ժամանակով:
● Հետընտրական վաճառքի աջակցություն.Մեր հանձնառությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս 3 ամսվա վաճառքի ծառայության ժամանակահատվածով: Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք նախագծի հետեւում, խնդիրներ ցուցաբերել, եւ Q & A դասընթացներ `արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում անդրադառնալու համար:
Ծառայության բնութագրերը եւ պահանջները
| Շինության տեսակը | Առաջարկվող բնակչության մասշտաբը | Կիսապայմանագրային ռազմավարություն | Նուկլեոտիդային պահանջներ |
| Ամբողջ գենոմի հաջորդականությունը | ≥ 30 անձ, յուրաքանչյուր ենթախմբից 10 անձինք
| 10x | Համակենտրոնացում. ≥ 1 NG / μL Ընդհանուր գումարը 30ng Սահմանափակ կամ ոչ դեգրադացիա կամ աղտոտում |
| Հատուկ-տեղանոց ուժեղացված հատված (SLAF) | Պիտակների խորություն. 10x Թեմաների քանակը. <400 MB. WGS- ն առաջարկվում է <1GB: 100k Tags 1 ԳԲ > 2GB: 300K թեգեր MAX 500K Tags | Համակենտրոնացում ≥ 5 նգ / մկլ Ընդհանուր գումարը ≥ 80 NG Nanodrop OD260 / 280 = 1.6-2.5 Ագարոզ գել. Ոչ կամ սահմանափակ քայքայումը կամ աղտոտումը
|
Ծառայության աշխատանքի հոսքը
Փորձերի ձեւավորում
Նմուշի առաքում
Գրադարանների կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքի ծառայություններ
Ծառայությունը ներառում է բնակչության կառուցվածքի վերլուծություն (PHYLOSIC TREA, PCA, Բնակչության շերտավորման գծապատկեր), բնակչության բազմազանությունը եւ բնակչության ընտրությունը (կապի անհավասարակշռություն, շահեկան վայրերի ընտրություն): Ծառայությունը կարող է ներառել նաեւ հարմարեցված վերլուծություն (օրինակ, շեղման ժամանակը, գենի հոսքը):
*Այստեղ ցուցադրված ցուցադրական արդյունքները բոլորը BMKGene- ի հետ հրապարակված գեներից են
1. Լրացուցիչ վերլուծությունը պարունակում է դեղագործական ծառի, բնակչության կառուցվածքի եւ PCA- ի կառուցում `գենետիկ տատանումների հիման վրա:
Ֆիլոգենետիկ ծառը ներկայացնում է տաքսոնոմիական եւ էվոլյուցիոն հարաբերությունները ընդհանուր նախնիների տեսակների շրջանում:
PCA- ն նպատակ ունի պատկերացնել մոտավորությունը ենթախմբի միջեւ:
Բնակչության կառուցվածքը ցույց է տալիս գենետիկորեն հստակ ենթաբնակչության առկայությունը Ալելյան հաճախությունների առումով:
Չեն, et. ալ.,Պններ2020
2. Ընտրող մաքրում
Ընտրովի ավլումը վերաբերում է գործընթացին, որով ընտրվում է շահավետ տեղ, եւ կապված են կապված չեզոք վայրերի հաճախականությունները, եւ ապակողպված վայրերը նվազում են, ինչը նվազում է տարածաշրջանային կրճատման արդյունքում:
Ընտրովի ավլում շրջանների գենոմի լայն հայտնաբերումն իրականացվում է բնակչության գենետիկական ինդեքսը (π, FST, տաջիման) հաշվարկ `լոգարիթմական պատուհանի (100 կԲ) որոշակի քայլի մեջ (10 KB):
Նուկլեոտիդի բազմազանությունը (π)
Տաջիման դ
Ամրագրման ինդեքս (FST)
Ուու, et. ալ.,Մոլեկուլային գործարան, 2018
3.Gene հոսքը
Ուու, et. ալ.,Մոլեկուլային գործարան, 2018
4.Demographic պատմություն
Zhang, et. ալ.,Բնության էկոլոգիա եւ էվոլյուցիա2021
5.Դիմենտենս անգամ
Zhang, et. ալ.,Բնության էկոլոգիա եւ էվոլյուցիա2021
Ուսումնասիրեք BMKGene- ի էվոլյուցիոն գենետիկայի ծառայությունների նպաստող առաջխաղացումը հրապարակումների բուժման միջոցով.
Հասանյար, Ա. Et al. (2023) «SNP մոլեկուլային մարկերների եւ թեկնածուի գեների բացահայտում, կապված APIS Cerana Cerana Larvae- ում Socbrood վիրուսային դիմադրության հետ, ամբողջ գենոմի վերազինմամբ»,Մոլեկուլային գիտությունների միջազգային ամսագիր, 24 (7): DOI: 10.3390 / IJMS24076238:
Chai, and al. (2022) «Վայրի, գենետիկորեն մաքուր չինական հսկա Սալամանդերի բացահայտումը ստեղծում է պահպանման նոր հնարավորություններ»,Կենդանաբանական այգիներ, 2022, հատ: 43, Թող 3, Էջեր, 469-480, 43 (3), էջ 469-480: DOI: 10.24272 / J.ISSN.2095-8137.2022.101:
Հան, Մ. Et al. (2022) «Ֆիլոգրաֆիական օրինաչափություն եւ բնակչության էվոլյուցիայի պատմություն բնիկ Եղիմուս Սիբիրիկուս Լ. Քինգհայ-տիբեթական սարահարթում»,Սահմաններ բույսերի գիտության մեջ13, էջ. 882601: DOI: 10.3389 / FPLS.2022.882601 / BIBTEX:
Wang, J .. et al. (2022) «Գենոմիական պատկերացումները երկարատեւ մակարդակի գենոմի ժողովի եւ բնակչության հեռավորության գոտիների գենոմիկայից»,Այգեգործության ուսումնասիրություն9: DOI: 10.1093 / HR / UHAC021:
