DNBSEQ նախապես պատրաստված գրադարաններ
Առանձնահատկություններ
●Հարթակ:MGI-DNBSEQ-T7
●Հերթականության ռեժիմներ.PE150
●Illumina գրադարանների փոխանցում դեպիMGI:թույլ տալով ցածր գնով տվյալների բարձր ծավալների հաջորդականությունը:
●Գրադարանների որակի վերահսկում նախքան հաջորդականությունը:
●Տվյալների հաջորդականություն QC և առաքում.QC հաշվետվության և չմշակված տվյալների առաքում fastq ձևաչափով Q30 ընթերցումների դեմուլտիպլեքսավորումից և զտումից հետո:
Առավելությունները
●Հերթականության ծառայությունների բազմակողմանիություն.հաճախորդը կարող է ընտրել հաջորդականությունը ըստ գոտիների կամ տվյալների քանակի:
●Բարձր տվյալների թողարկում.1500 Գբ / նրբ
●Հերթական QC զեկույցի առաքում.որակի ցուցանիշներով, տվյալների ճշգրտությամբ և հաջորդականության նախագծի ընդհանուր կատարմամբ:
●Հասուն հաջորդականության գործընթացը.շրջադարձի կարճ ժամանակով:
●Որակի խիստ հսկողությունՄենք իրականացնում ենք QC-ի խիստ պահանջներ՝ հետևողականորեն բարձրորակ արդյունքների ապահովումը երաշխավորելու համար:
Նմուշի պահանջներ
| Տվյալների քանակը (X) | Համակենտրոնացում (qPCR/nM) | Ծավալը | |
| Մասնակի գոտի
| X ≤ 10 Գբ | ≥ 1nM | ≥ 25 մկլ |
| 10 Գբ < X ≤ 50 Գբ | ≥ 2 նմ | ≥ 25 մկլ | |
| 50 Գբ < X ≤ 100 Գբ | ≥ 3 նՄ | ≥ 25 մկլ | |
| X > 100 Գբ | ≥ 4 նՄ | ||
| Single Lane | Per Lane | ≥ 1,5 նՄ / Գրադարանի լողավազան | ≥ 25 μl / Գրադարանի լողավազան |
Բացի համակենտրոնացումից և ընդհանուր քանակից, պահանջվում է նաև համապատասխան գագաթնակետային օրինակ:
Ծանոթագրություն. Ցածր բազմազանության գրադարանների գծերի հաջորդականությունը պահանջում է PhiX spike-in՝ ապահովելու կայուն բազային զանգեր:
Խորհուրդ ենք տալիս որպես նմուշ ներկայացնել նախապես հավաքված գրադարանները: Եթե Ձեզ անհրաժեշտ է, որ BMKGENE-ը կատարի գրադարանների միավորում, խնդրում ենք դիմել
գրադարանի պահանջները մասնակի գծերի հաջորդականության համար:
Գրադարանի չափը (գագաթնակետային քարտեզ)
Հիմնական գագաթնակետը պետք է լինի 300-450 bp-ի սահմաններում:
Գրադարանները պետք է ունենան մեկ հիմնական գագաթ, առանց ադապտերների աղտոտման և առանց այբբենարանի դիմերների:
Ծառայությունների աշխատանքային հոսք
Գրադարանի QC հաշվետվություն
Գրադարանի որակի վերաբերյալ հաշվետվությունը տրվում է նախքան հաջորդականությունը, գրադարանի քանակությունը և մասնատումը գնահատելը:
QC զեկույցի հաջորդականություն
Աղյուսակ 1. Տվյալների հաջորդականության վերաբերյալ վիճակագրություն:
| Նմուշի ID | BMKID | Հում կարդում | Հում տվյալներ (bp) | Մաքուր ընթերցումներ (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93,89 | 37.08 |
Նկար 1. Որակի բաշխում յուրաքանչյուր նմուշի ընթերցումների երկայնքով
Նկար 2. Բազային բովանդակության բաշխում
Նկար 3. Ընթերցված բովանդակության բաշխումը հաջորդականության տվյալների մեջ
