Illumina նախապես պատրաստված գրադարաններ
Հատկություններ
●Պլատֆորմներ.Illumina Novaseq 6000 եւ Novaseq x Plus
●Կիսապայմանագրերի ռեժիմներ.PE150 եւ PE250
●Գրադարանների որակի վերահսկում նախքան հաջորդականությունը
●Կիսապաշտպանիչ տվյալների QC եւ առաքում.QC հաշվետվության եւ հումքի տվյալների առաքում Ամրապնդման ձեւաչափով Demultipleplexing եւ Filtering Raw- ը կարդում է
Ծառայության առավելություններ
●Հանգստացնող ծառայությունների բազմակողմանիություն.Հաճախորդը կարող է ընտրել հաջորդականությունը գծի, հոսքի բջիջի կամ պահանջվող տվյալների քանակի (մասնակի գոտու հաջորդականացում):
●Illumina Sequencing պլատֆորմի ընդարձակ փորձ.հազարավոր փակ նախագծերով տարբեր տեսակների հետ:
●QC- ի հերթական զեկույցի առաքում.Որակի չափիչներով, տվյալների ճշգրտությամբ եւ հաջորդականացված ծրագրի ընդհանուր կատարմամբ:
●Հասունացման հաջորդականացում.կարճ շրջադարձով:
●Կրիչ որակի վերահսկումՄենք իրականացնում ենք QC խիստ պահանջներ `երաշխավորելու հետեւողականորեն բարձրորակ արդյունքների առաքումը:
Նմուշային հարթակներ
| Պլատֆորմ | Հոսքի բջիջ | Կիսապայմանագրային ռեժիմ | Ստորաբաժանում | Մոտավոր ելք |
| Novaseq x | 10B (8 գոտի) | PE150 | Մեկ գոտի Մասնակի գոտի | 375 GB / Lane |
| 25 բ (8 գոտի) | PE150 | Մեկ գոտի Մասնակի գոտի | 1000 GB / Lane | |
| Novaseq 6000 | SP հոսքի բջիջ (2 գոտի) | PE250 | Հոսքի բջիջ Մեկ գոտի Մասնակի գոտի | 325-400 մ կարդում է / Lane |
| S4 հոսքի բջիջ (4 գոտի) | PE150 | Հոսքի բջիջ Մեկ գոտի Մասնակի գոտի | 800 GB / Lane |
Նմուշի պահանջներ
| Տվյալների գումարը (x) | Համակենտրոնացում (QPCR / NM) | Ծավալ | |
| Մասնակի գոտու հաջորդականացում
| X ≤ 10 ԳԲ | ≥ 1 նմ | ≥ 25 μL |
| 10 ԳԲ <x ≤ 50 ԳԲ | ≥ 2 նմ | ≥ 25 μL | |
| 50 ԳԲ <x ≤ 100 ԳԲ | ≥ 3 նմ | ≥ 25 μL | |
| X> 100 ԳԲ | ≥ 4 նմ | ≥ 25 μL | |
| Lane Sequencing | Մեկ գոտի | ≥ 1.5 NM / գրադարանային լողավազան | 25 ≥ 25 μl / գրադարանային լողավազան |
Բացի համակենտրոնացումից եւ ընդհանուր գումարից, պահանջվում է նաեւ համապատասխան գագաթնակետ:
Նշում. Low ածր բազմազանության գրադարանների նրբագեղության հաջորդականությունը պահանջում է ֆիքսերի բծախնդրություն `ամուր բազային զանգահարելու համար:
Առաջարկում ենք նախապես համախմբված գրադարաններ ներկայացնել որպես նմուշ: Եթե BMKGene- ը պահանջում է գրադարանային լողավազան կատարել, խնդրում ենք դիմել
Գրադարանի պահանջները մասնակի գոտու հաջորդականացման համար:
Գրադարանի չափը (գագաթնակետին)
Հիմնական գագաթը պետք է լինի 300-450 BP- ի սահմաններում:
Գրադարանները պետք է ունենան մեկ հիմնական գագաթ, ոչ ադապտեր աղտոտում եւ ոչ այբբենարան:
Խնդրում ենք հասնել մեզ, եթե ձեր նմուշները չեն բավարարում մեկնարկային նյութերի պահանջները:
Ծառայության աշխատանքային հոսք
Գրադարանի որակի վերահսկում
Հաջորդականացում
Տվյալների որակի վերահսկում
Ծրագրի առաքում
Գրադարան QC զեկույց
Գրադարանի որակի վերաբերյալ զեկույցը տրամադրվում է նախքան հաջորդականությունը, գնահատելով գրադարանի գումարը եւ մասնատումը:
QC- ի հաջորդականացում
Աղյուսակ 1. Վիճակագրությունը հաջորդող տվյալների վերաբերյալ:
| Նմուշի ID | Բթամիտ | Հում կարդում է | Հում տվյալներ (BP) | Մաքուր ընթերցում (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717.867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Նկար 1. Յուրաքանչյուր նմուշում կարդում է որակի բաշխումը
Գծապատկեր 2. Բազային բովանդակության բաշխում
Գծապատկեր 3. Կարդալ բովանդակության բաշխումը հաջորդականացմամբ
