Լրիվ երկարությամբ MRNA Sequencing -pacbio
Հատկություններ
● CDNA սինթեզը Poly-a Mrna- ից, որին հաջորդում է գրադարանի պատրաստումը
● CCS ռեժիմում հաջորդականացում, HIFI- ի ստեղծում
● Ամբողջ երկարության պատճենների հաջորդականացում
● Վերլուծությունը չի պահանջում տեղեկատու գենոմ; Այնուամենայնիվ, դա կարող է օգտագործվել
● Bioinformatical- ի վերլուծությունը հնարավորություն է տալիս պատճենների վերլուծություն Isoform Lncrna, Gene Fusions, Poly-adenylation եւ Gene կառուցվածքի
Ծառայության առավելություններ
●Բարձր ճշգրտությունHifi- ն ճշգրտությամբ կարդում է 99.9% (Q30), համեմատելի է NGS- ի հետ
● Այլընտրանքային պառակտման վերլուծությունԱմբողջ տառերի հաջորդականությունը հնարավորություն է տալիս ISOFORFORFORM- ի նույնականացում եւ բնութագրում
●Ընդարձակ փորձաքննություն1100 PacBio ավելի քան 1100-ից ավելի տարածված պրոցեսորային նախագծերի ավարտի հետքերով եւ ավելի քան 2300 նմուշ մշակելով, մեր թիմը հարուստ փորձ է բերում յուրաքանչյուր նախագծի:
●Հետադարձ կապի աջակցությունՄեր հանձնառությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս 3 ամսվա վաճառքի ծառայության ժամանակահատվածով: Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք նախագծի հետեւում, խնդիրներ ցուցաբերել, եւ Q & A դասընթացներ `արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում անդրադառնալու համար:
Նմուշի պահանջներ եւ առաքում
| Գրադարան | Կիսապայմանագրային ռազմավարություն | Առաջարկվող տվյալները | Որակի հսկողություն |
| Պոլյան հարստացված MRNA CCS գրադարան | PacBio Sequel II Pacbio Revio | 20/40 ԳԲ 5/10 մ CCS | Q30≥85% |
Նմուշի պահանջներ.
Նուկլեոտիդներ.
● Բույսեր.
Արմատ, ցողուն կամ ծաղկաթերթ, 450 մգ
Տերեւ կամ սերմ. 300 մգ
Մրգեր, 1.2 գ
● Կենդանիներ:
Սիրտ կամ աղիք, 300 մգ
Viscera կամ Brain: 240 մգ
Մկան, 450 մգ
Ոսկորներ, մազեր կամ մաշկ, 1 գ
● arthropods:
Միջատներ, 6 գ
Crustacea: 300 մգ
● Ամբողջ արյունը: 1 խողովակ
● Բջիջներ. 106 բջիջներ
| Conc. (NG / μL) | Գումարը (մկգ) | Մաքրություն | Ամբողջություն |
| 100 | ≥ 1.0 | OD260 / 280 = 1.7-2.5 OD260 / 230 = 0.5-2.5 Սահմանափակ կամ ոչ սպիտակուցային կամ ԴՆԹ-ի աղտոտում, որը ցուցադրվում է գելի վրա: | Բույսերի համար. Rin≥7.5; Կենդանիների համար. Rin≥8.0; 5.0≥ 28s / 18S≥1.0; սահմանափակ կամ առանց ելակետային բարձրություն |
Առաջարկվող նմուշի առաքում
Բեռնարկղ. 2 ML Centrifuge խողովակ (անագի փայլաթիթեղը խորհուրդ չի տրվում)
Նմուշի պիտակավորում. Խումբ + վերարտադրող, օրինակ, A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Առաքում.
1. Չոր սառույց. Նմուշները պետք է փաթեթավորվեն պայուսակների մեջ եւ թաղվեն չոր սառույցի մեջ:
2: Rnastable Tubes. RNA նմուշները կարող են չորանալ RNA կայունացման խողովակի մեջ (օրինակ, rnastable®) եւ առաքվել սենյակային ջերմաստիճանում:
Ծառայության աշխատանքի հոսքը
Փորձերի ձեւավորում
Նմուշի առաքում
RNA արդյունահանում
Գրադարանների կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքի ծառայություններ
Ներառում է հետեւյալ վերլուծությունը.
● Հումքի որակի հսկողություն
● Այլընտրանքային պոլիեդիայի վերլուծություն (APA)
● FUSION տառադարձման վերլուծություն
● Այլընտրանքային պառակտման վերլուծություն
● Հիասքանչ ունիվերսալ մեկանգամյա օրհներգեր (Busco) վերլուծություն
● Վեպի տառադարձման վերլուծություն. Կոդավորման հաջորդականությունների կանխատեսում (CD) եւ ֆունկցիոնալ ծանոթագրություն
● LNCRNA վերլուծություն. Lncrna- ի եւ թիրախների կանխատեսում
● MicrosateLite նույնականացում (SSR)
Busco վերլուծություն
Այլընտրանքային պղտորման վերլուծություն
Այլընտրանքային պոլիադիայի վերլուծություն (APA)
Նոր տառերի ֆունկցիոնալ ծանոթագրություն
Ուսումնասիրեք BMKGene- ի Nanopore- ի ամբողջ երկարությամբ MRNNA- ի հաջորդ երկար երկարության ծառայություններից, այս ցուցադրված հրապարակման մեջ:
MA, Y. et al. (2023) «Pacbio» եւ Ont RNA հաջորդականության մեթոդների համեմատական վերլուծություն Nemopilema Nomurai Venom նույնականացման համար, գենոմիկա, 115 (6), էջ. 110709: DOI: 10.1016 / J.Ygeno.2023.110709:
Chao, Q. et al. (2019) «Պոպուլուսի ցողունային ճնշման դինամիկան», բույսերի կենսատեխնոլոգիական հանդես, 17 (1), էջ 206-219: DOI: 10.1111 / PBI.12958:
Deng, H. et al. (2022) «Ացինդիա թթու պարունակության դինամիկ փոփոխությունները պտղի զարգացման եւ ակտինիդիա Լատիֆոլիայի (ասկորբատ հարուստ մրգերի բերքը) եւ հարակից մոլեկուլային մեխանիզմների հասունացմանը, մոլեկուլային գիտությունների միջազգային ամսագիր, 23 (10), փ. 5808: DOI: 10.3390 / IJMS23105808 / S1:
Hua, X. et al. (2022) «Բիոսինթետիկ ուղու գեների արդյունավետ կանխատեսում Փարիզի պոլիֆիլլայում», հաղորդակցման կենսաբանություն 2022 5: 1, 5 (1), էջ 1-10: DOI: 10.1038 / S42003-022-03000-Z:
Լյու, Մ. Et al. (2023) «Համակցված PacBio ISO-SEQ եւ Illumina RNA-SEQ վերլուծություն Tuta Absoluta (MEYRICK) Transcriptome եւ Cytochrome P450 գեների, միջատների, 14 (4), էջ. 363: DOI: 10.3390 / Insects14040363 / S1.
Wang, Lijun et al. (2019) «Գրանսագրիչ բարդության ուսումնասիրություն, օգտագործելով PacBio Singlecule իրական ժամանակի վերլուծություն, որը համակցված է Illumina RNA- ի հետ, Ricinus Communis- ի, BMC- ի գենոմիկայի համար ռիչինոլաթթվի բիոսինթեզի ավելի լավ հասկանալու համար: 1-17: DOI: 10.1186 / S12864-019-5832-9:
