Համեմատական գենոմիկա
Ծառայության առավելություններ
●Ընդարձակ փորձաքննություն եւ հրապարակման գրառումներԿուտակված, BMKGene- ը ավարտել է ավելի քան 90 համեմատական գենոմիկայի նախագծեր, որոնց կուտակային ազդեցության գործոնը հասավ 900-ի:
●Բիոինֆորմատիկայի համապարփակ վերլուծությունՎերլուծությունների փաթեթը պարունակում է ամենատարածված պահանջվող վերլուծությունները, ապահովելով լավ մշակված պատրաստի հրատարակիչ թվեր եւ թույլ տալով հեշտությամբ մեկնաբանել արդյունքների մասին
●Բարձրորակ բիոինֆորմատիկայի թիմի եւ վերլուծության կարճ ցիկլՀամեմատական գենոմիական վերլուծության մեծ փորձով BMKGene- ի թիմը կատարում է բազմազան անհատականացված վերլուծության պահանջներ կարճ շրջադարձային ժամանակի ընթացքում
●Հետընտրական վաճառքի աջակցություն.Մեր հանձնառությունը տարածվում է ծրագրի ավարտից դուրս 3 ամսվա վաճառքի ծառայության ժամանակահատվածով: Այս ընթացքում մենք առաջարկում ենք նախագծի հետեւում, խնդիրներ ցուցաբերել, եւ Q & A դասընթացներ `արդյունքների հետ կապված ցանկացած հարցում անդրադառնալու համար:
Ծառայության բնութագրերը
| Մոտավոր շրջադարձային ժամանակ | Տեսակների քանակը | Վերլուծություններ |
| 30 աշխատանքային օր | 6 - 12 | Գեն Ընտանեկան կլաստեր Գեների ընտանիքի ընդլայնում եւ կծկում Ֆիլոգենետիկ ծառի կառուցում Տարբերության ժամանակի գնահատում (պահանջվում է հանածոների տրամաչափում) LTR տեղադրման ժամանակը (բույսերի համար) Ամբողջ գենոմի կրկնօրինակումը (բույսերի համար) Ընտրովի ճնշում Սինենսիի վերլուծություն |
Bioinformatics վերլուծություններ
● Գեն ընտանիք
● Phylogenetics
● Տարեկանության ժամանակը
● Ընտրովի ճնշում
● Սինսիի վերլուծություն
Նմուշի պահանջներ եւ առաքում
Նմուշի պահանջներ.
Հյուսվածք կամ ԴՆԹ գենոմի հաջորդականության եւ հավաքների համար
Հյուսվածքի համար
| Տեսակ | Հյուսվածք | Հետազոտություն | PacBio CCS |
| Կենդանի | Visceral հյուսվածքը | 0,5 ~ 1 գ | ≥ 3.5 գ |
| Մկանային հյուսվածք | |||
| ≥ 5.0 գ | |||
| ≥ 5.0 մլ | |||
| Մամալիյան արյուն | |||
| ≥ 0.5 մլ | |||
| Թռչնաբուծություն / ձուկ արյուն | |||
| Տնկել | Թարմ տերեւ | 1 ~ 2 գ | ≥ 5.0 գ |
| Petal / stem | 1 ~ 2 գ | ≥ 10.0 գ | |
| Արմատ / սերմ | 1 ~ 2 գ | ≥ 20.0 գ | |
| Բջիջներ | Մշակված բջիջ | - | ≥ 1 x 108 |
Տվյալներ
Գենոմային հաջորդականության ֆայլեր (.Առաջին) եւ ծանոթագրման ֆայլեր (.gff3) սերտ առնչվող տեսակների համար
Ծառայության աշխատանքի հոսքը
Փորձերի ձեւավորում
Նմուշի առաքում
Գրադարանների կառուցում
Հաջորդականացում
Տվյալների վերլուծություն
Վաճառքի ծառայություններ
*Այստեղ ցուցադրված ցուցադրական արդյունքները բոլորը BioMarker Technologies- ի հետ հրապարակված գեներից են
1.LTR Տեղադրեք ժամանակի գնահատումը. Գծապատկերն ցուցաբերեց եզակի բաշխում LTR-RTS տեղադրման ժամանակներում Weininy Rye Genome- ում `համեմատած այլ տեսակների հետ: Ամենավերջին գագաթնակետը հայտնվեց շուրջ 0,5 միլիոն տարի առաջ:
Li guang et al.,Բնության գենետիկա2021
2. Թիլոգեն եւ գեների ընտանեկան վերլուծություն Chayote- ի (SECHIM- ի EDULE). Չայոտը եւ մյուս 13 հարակից տեսակը `գեների ընտանիքում, Չայոտը ամենից սերտորեն կապված է օձի (Trichosanthes Anguina): Օձի չափից բխող chayote- ը, 27-45-ին եւ ամբողջ գենոմի կրկնօրինակումը (WGD), որը տեղի է ունեցել Չայոտում 25 ± 4-ին, 4-րդ Մյա քաղաքում, որը Cucuibitaceae- ում երրորդ WGD միջոցառումն է:
Fu et al.,Այգեգործության հետազոտություն2021
3.Սինթենյան վերլուծություն. Մրգերի մշակման ֆիտոհորմոնների հետ կապված որոշ գեներ հայտնաբերվել են Չայոտում, օձի գորդում եւ դդմիկ: Չայոտի եւ դդմիկի միջեւ հարաբերակցությունը մի փոքր ավելի բարձր է, քան Chayote եւ Snake Gourd- ի միջեւ:
Fu et al.,Այգեգործության հետազոտություն2021
4.Գեն ընտանիքի վերլուծություն. Գեժգերի ընտանեկան ընդլայնումը եւ կծկումը Գ.Թուրբերսիում եւ Գ.Դավիդսոնիի գոտիները ցույց են տվել, որ ընդլայնվել են ստերոիդ բիոսինթեզի եւ Brassinsteroid- ի հետ կապված գեները:
Yang z et al.,BMC կենսաբանություն2021
5. Ողջույն գենոմի կրկնօրինակման վերլուծություն. 4DTV եւ KS բաշխման վերլուծությունը ցույց է տվել ամբողջ գենոմի կրկնօրինակման իրադարձությունը: Ներքին հատվածների գագաթները ցույց են տվել կրկնօրինակների իրադարձություններ: Interspecies- ի գագաթները ցույց են տվել մասնագիտական միջոցառումներ: Վերլուծությունը նշեց, որ համեմատած մյուս երեք սերտ կապի հետ, O. Europaea- ն վերջերս անցավ լայնածավալ գենի կրկնօրինակման:
Rao g et al.,Այգեգործության հետազոտություն2021
BMK գործ
Rose առանց փորի. Գենոմիկական պատկերացումներ, որոնք կապված են խոնավության հարմարվելու հետ
Հրապարակված է. Գիտության ազգային ակնարկ2021
Կիսապաշտպանության ռազմավարություն.
'Basye'sԱննպատակ'(R.Մարինաան) Գենոմ.
Մոտավոր: 93 x Pacbio + մոտավոր: 90 x nanopore + 267 x Illumina
Հիմնական արդյունքները
1. Բարձր որակի R.Wichuraiana Genome- ը կառուցվել է երկար ընթերցվող հաջորդականության տեխնիկայի միջոցով, ինչը 530.07 MB հավաքույթ է բերում (գնահատված գենոմի չափը գենոմի հետազոտության միջոցով կազմել է մոտավորապես 525.9 MB): Busco- ի գնահատված գնահատականը կազմել է 93.9%: Համեմատելով «հին կարմրության» հետ (Հին), այս գենոմի որակը եւ ամբողջականությունը հաստատվել է բազային բազային ճշգրտության եւ LAI = 20.03): R.Wichuraiana Genome- ը պարունակում է 32,674 սպիտակուցային կոդավորման գեներ:
2. Մուլթի-օմետիկայի համատեղ վերլուծություն, որը բաղկացած է համեմատական գենոմիկայից, գրացուցակից, գենետիկական բնակչության QTL վերլուծությունից, բացահայտեց R. Wichuraiana- ի եւ Rosa Chinenis- ի միջեւ վճռական մասնագիտությունը: Նաեւ QTL- ում առնչվող գեների արտահայտման տատանումները, ամենայն հավանականությամբ, կապված էին ցողունային փխրուն ձեւավորման հետ:
Համեմատական գենոմիկաներ ANAYSIS բասյե; նփերի եւ Rosa Chinensis- ի միջեւ, ներառյալ սինսիի վերլուծությունը, գեների ընտանեկան կլաստերը, ընդլայնում եւ կծկման վերլուծություն, բացահայտեց մեծ թվով տատանումներ, որոնք առնչվում են վարդերի մեծ թվով: NAC- ի եւ FAR1 / FRS գեների ընտանիքում եզակի ընդլայնումը շատ հավանական է, որ կապված է սեւ կետի դիմադրության հետ:
Համեմատական գենոմիկայի վերլուծություն BT- ի եւ HAPLOOB գենոմների միջեւ:
Zhong, M., et al. «Վարդը առանց փորի. Գենոմիկական պատկերացումներ, որոնք կապված են խոնավության հարմարվելու հետ»Գիտության ազգային ակնարկ, 2021;, NWAB092:
