BMKCloud Մուտք գործեք
130

Ամպլիկոնի հաջորդականություն (16S/18S/ITS)

百迈客云网站-01 2

Ամպլիկոնի հաջորդականություն (16S/18S/ITS)

 

Amplicon (16S/18S/ITS) հաջորդականությունը Illumina-ով մանրէների բազմազանությունը վերլուծելու մեթոդ է՝ հայտնաբերելով մանրէների պրոֆիլները՝ ըստ դրանց հաջորդականության, այնուհետև փորձելով վերծանել համայնքի հարստությունն ու բազմազանությունը յուրաքանչյուր նմուշում և նմուշների միջև: BMKCloud Amplicon (NGS) խողովակաշարը թույլ է տալիս վերլուծել 16S, 18S, ITS և բազմաթիվ ֆունկցիոնալ գեներ: Այն սկսվում է ընթերցման կտրվածքով, զուգակցված ընթերցման հավաքմամբ և որակի գնահատմամբ, որին հաջորդում է նմանատիպ ընթերցումների խմբավորումը՝ վեց տարբեր վերլուծության բաժիններում օգտագործվող Գործառնական տաքսոնոմիկ միավորներ (OTUs) ստեղծելու համար: Տաքսոնոմիական ծանոթագրությունը տեղեկատվություն է տրամադրում յուրաքանչյուր նմուշի հարաբերական առատության և կազմի մասին, մինչդեռ ալֆա և բետա բազմազանության վերլուծությունները կենտրոնանում են մանրէների բազմազանության վրա, համապատասխանաբար, նմուշների ներսում և դրանց միջև: Խմբերի միջև դիֆերենցիալ վերլուծությունը հայտնաբերում է OTU-ներ, որոնք տարբերվում են ինչպես պարամետրային, այնպես էլ ոչ պարամետրական թեստերի միջոցով, մինչդեռ հարաբերակցության վերլուծությունը կապում է այդ տարբերությունները շրջակա միջավայրի գործոնների հետ: Ի վերջո, ֆունկցիոնալ գեների առատությունը կանխատեսվում է ելնելով մարկերային գեների առատությունից՝ յուրաքանչյուր նմուշում ապահովելով գործառույթների և էկոլոգիայի պատկերացում:

 

图片97

ստանալ մեջբերում

Գրեք ձեր հաղորդագրությունը այստեղ և ուղարկեք այն մեզ

Ուղարկեք ձեր հաղորդագրությունը մեզ.