Teljes transzkriptom szekvenálás - Illumina
Jellemzők
● Kettős könyvtár a teljes transzkriptom szekvenciájához: rRNS -kimerülés, majd a PE150 könyvtár előkészítését és méretválasztását, majd a SE50 könyvtár készítését követi
● Az mRNS, lncRNS, circRNS és miRNS teljes bioinformatikai elemzése külön bioinformatikai jelentésekben
● Az összes RNS expresszió együttes elemzése egy kombinált jelentésben, beleértve a Cerna Networks elemzést.
Szolgáltatási előnyök
●A szabályozó hálózatok mélyreható elemzése: A CERNA hálózati elemzést az mRNS, az lncRNS, a CircRNS és a miRNS közös szekvenálása lehetővé teszi, valamint egy kimerítő bioinformatikus munkafolyamat.
●Átfogó kommentár: Több adatbázist használunk a differenciálisan expresszált gének (DEG) funkcionális kommentálására és a megfelelő dúsítási elemzés elvégzésére, betekintést nyújtva a transzkriptom válasz alapjául szolgáló celluláris és molekuláris folyamatokba.
●Kiterjedt szakértelem: A több mint 2100 teljes transzkriptomprojekt sikeres bezárásának eredményeivel a különféle kutatási területeken, csapatunk rengeteg tapasztalatot hoz minden projekthez.
●Szigorú minőség -ellenőrzés: Az alapvető vezérlési pontokat minden szakaszban, a minta- és könyvtári előkészítéstől a szekvenálásig és a bioinformatikáig valósítjuk meg. Ez a aprólékos megfigyelés biztosítja a következetesen jó minőségű eredmények szállítását.
●Az értékesítés utáni támogatás: Elkötelezettségünk a projekt befejezésén túlmutat, egy 3 hónapos értékesítés utáni szolgáltatási periódussal. Ez idő alatt a projekt nyomon követését, hibaelhárítási támogatást és Q & A foglalkozásokat kínálunk az eredményekkel kapcsolatos kérdések kezelésére
Minta követelmények és szállítási követelmények
| Könyvtár | Szekvenálási stratégia | Az ajánlott adatok | Minőség -ellenőrzés |
| rRNS kimerült | Illumina PE150 | 16 GB | Q30 ≥85% |
| Kiválasztott méret | Illumina SE50 | 10-20m olvasható |
Minta követelmények:
Nukleotidok:
| Conc. (Ng/μL) | Összeg (μg) | Tisztaság | Integritás |
| ≥ 80 | ≥ 1,6 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Korlátozott vagy egyáltalán nem látható fehérje vagy DNS -szennyeződés a gélen. | Rin≥6.0 5,0 ≥28s/18s ≥1.0; korlátozott vagy nincs kiindulási magasság |
Ajánlott minta szállítás
Tartály: 2 ml centrifuga cső (az ónfólia nem ajánlott)
Minta címkézés: Csoport+replikáció EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Szállítás:
1. Száraz jég: A mintákat zsákokba kell csomagolni és száraz jégbe temetni.
2.
Szolgáltatási munka folyamat
Kísérleti tervezés
Minta szállítás
RNS -extrakció
Könyvtári felépítés
Szekvenálás
Adatelemzés
Értékesítés utáni szolgáltatások
Bioinformatika
RNS expressziós áttekintés
Differenciálisan expresszált gének
cerna elemzés
Differenciálisan expresszált miRNS -ek és kapcsolódó RNS -ek
Fedezze fel a Bmkgene teljes transzkriptom szekvenálási szolgáltatásai által elősegített kutatási előrelépéseket a publikációk kurátus gyűjteményén keresztül.
Dai, Y. et al. (2022) „Az mRNS-ek, lncRNS-ek és miRNS-ek átfogó expressziós profilja a kashin-be-bck betegségben, amelyet RNS-szekvenálással azonosítottak”, Molecular omics, 18 (2), 154–166. doi: 10.1039/d1mo00370d.
Liu, N. Nan et al. (2022) „Az API-k cerana hidegállóságának teljes hossza átírása a Changbai-hegységben a teljes téli időszakban.”, Gene, 830, 146503–146503. doi: 10.1016/j.gene.2022.146503.
Wang, XJ et al. (2022) „A versengő endogén RNS-szabályozási hálózatok multi-oMICS integráció-alapú prioritása a kissejtes tüdőrákban: molekuláris jellemzők és gyógyszerjelöltek”, Frontiers in Oncology, 12, p. 904865. DOI: 10.3389/FONC.2022.904865/BIBTEX.
Xu, P. et al. (2022) „Az lncRNS/circRNS-miRNA-mRNS expressziós profilok integrált elemzése új betekintést mutat a potenciális mechanizmusokba a mogyoró gyökér-kis fonálférgeire adott válaszként”, BMC Genomics, 23 (1), 1–12. doi: 10.1186/s12864-022-08470-3/7. ábra.
Yan, Z. et al. (2022) „A teljes-transzkripciós RNS-szekvenálás kiemeli a molekuláris mechanizmusokat, amelyek a brokkoliban a betörés utáni minőség fenntartásához kapcsolódnak a vörös LED-es besugárzással”, a betörés utáni biológia és technológia, 188, p. 111878. Doi: 10.1016/j.postharvbio.2022.11878.
