Teljes genom bisulfe szekvenálás (WGBS)
A teljes genom biszulfit szekvenálás (WGBS) az arany-szabványos módszertanként szolgál a DNS-metilezés mélyreható feltárásához, különös tekintettel a citozin (5-MC) ötödik helyzetére, amely a gén expressziójának és a celluláris aktivitásának kulcsfontosságú szabályozója. A WGB -k alapelve a biszulfit -kezelést foglalja magában, indukálja a nem metilezett citozinok uracilré (C U) átalakulását, miközben a metilezett citozinok változatlanul maradnak. Ez a technika egybázisú felbontást kínál, lehetővé téve a kutatók számára, hogy átfogóan megvizsgálják a metilómát és feltárják a különféle állapotokkal, nevezetesen a rákkal kapcsolatos rendellenes metilezési mintákat. A WGB-k alkalmazásával a tudósok páratlan betekintést nyerhetnek a genomszintű metilezési tájakba, és árnyalt megértést nyújtanak az epigenetikus mechanizmusokról, amelyek a különféle biológiai folyamatok és betegségek alapját képezik.
Szolgáltatási szolgáltatások
● Szükség van referencia -genomra.
● A lambda DNS -t adunk hozzá a biszulfit konverziós hatékonyságának monitorozásához.
● Szekvenálás az Illumina Novaseq -en.
Szolgáltatási előnyök
●Arany standard a DNS -metilezési kutatáshoz: Ez az érett metilezési konverziós feldolgozási technológia nagy pontossággal és jó reprodukálhatósággal rendelkezik.
●Széles lefedettség és egybázisú felbontás:A metilezési helyek kimutatása genom szintű szinten.
●Teljes platform:Biztosítson egyablakos szolgáltatást a mintafeldolgozásból, a könyvtári felépítésből, a szekvenálás a bioinformatikai elemzésig.
●Kiterjedt szakértelem: Mivel a WGBS szekvenálási projektek sikeresen befejeződtek a fajok sokféleségében, a Bmkgene több mint egy évtizedes tapasztalat, magasan képzett elemzőcsoport, átfogó tartalom és kiváló értékesítés utáni támogatás.
●A transzkriptika elemzéshez való csatlakozás lehetősége: lehetővé teszi a WGB-k integrált elemzését más OMICS-adatokkal, például az RNS-SEQ-val.
Minta előírások
| Könyvtár | Szekvenálási stratégia | Ajánlott adatkimenet | Minőség -ellenőrzés |
| Biszulfit kezelt | Illumina PE150 | 30 -szoros mélység | Q30 ≥ 85% Bisulfit konverzió> 99% |
Minta követelmények
| Koncentráció (ng/µl) | Teljes összeg (µg) | További követelmények | |
| Genomiális DNS | ≥ 5 | ≥ 400 ng | Korlátozott lebomlás vagy szennyeződés |
Szolgáltatási munka folyamat
Minta szállítás
DNS -extrakció
Könyvtári felépítés
Szekvenálás
Adatelemzés
Adatszállítás
Tartalmazza a következő elemzést:
● nyers szekvenálás minőség -ellenőrzés;
● A referencia -genom feltérképezése;
● 5MC metilezett bázisok kimutatása;
● A metilezés eloszlásának és kommentárjának elemzése;
● a differenciálisan metilezett régiók (DMR) elemzése;
● A DMR -khez kapcsolódó gének funkcionális kommentálása.
5MC metilezés detektálása: metilezett helyek típusai
Metilezési térkép. 5mc metilezés genom széles eloszlás
Erősen metilezett régiók kommentálása
Differenciálisan metilezett régiók: kapcsolódó gének
Differenciálisan metilezett régiók: A kapcsolódó gének (gén -ontológia) kommentálása
Fedezze fel a Bmkgene teljes genom biszulfit szekvenálási szolgáltatásainak elősegített kutatási előrelépéseit a publikációk kurátus gyűjteményén keresztül.
Fan, Y. et al. (2020) „A DNS-metilezési profilok elemzése a juh-vázizom fejlődése során teljes genom biszulfit szekvenálással”,BMC genomika, 21 (1), 1–15. doi: 10.1186/s12864-020-6751-5.
Zhao, X. et al. (2022) „Új dezoxiribonukleinsav -metilezési perturbációk a vinil -kloridnak kitett munkavállalókban”,Toxikológia és ipari egészség, 38 (7), 377–388. doi: 10.1177/07482337221098600
Zuo, J. et al. (2020) „A genom-metilezés, a nem kódoló RNS-ek, az mRNS-ek és a metabolitok közötti kapcsolatok a paradicsom gyümölcs érlésében”,A Plant Journal, 103 (3), 980–994. doi: 10.1111/tpj.14778.
