Genom
Kromoszóma méretarányos összeszerelése és elemzése a biomassza növényi miscanthus lutarioriparius genom
Nanopórus szekvenálás | Illumina | HI-C | RNS-szekvenálás | Törzsfejlődés
Ebben a tanulmányban a Biomarker Technologies technikai támogatást nyújtott a nanopórus szekvenálás, a de novo genom összeszerelése, a Hi-C segített összeszerelés stb.
Absztrakt
Miscanthus, egy rizomatikus évelő növény, nagy potenciállal rendelkezik a bioenergia előállítására a magas biomassza és a stressztűrés szempontjából. Beszámolunk egy kromoszóma méretű szerelvénytMiscanthus lutarioripariusA genom az Oxford Nanopore szekvenálás és a HI-C technológiák kombinálásával. A 2,07 GB-os szerelvény a genom 96,64% -át fedi le, a Contig N50 1,71 MB. A centromer és a telomer szekvenciákat mind a 19 kromoszómára és a 10 kromoszómára összeállítják. Az M. lutarioriparius allotetraploid eredetét centromer műholdas ismétlések alkalmazásával konffiítják meg. A tetraploid genomszerkezetet és a cirokhoz viszonyított számos kromoszómális átrendeződést egyértelműen bebizonyítottuk. Tandem duplikátum génekM. lutarioripariusfunkcionális dúsítva nemcsak a stresszválaszhoz kapcsolódó, hanem a sejtfal bioszintézisével kapcsolatos szempontból. A betegség rezisztenciájával, a sejtfal bioszintézisével és a fémionok transzportjával kapcsolatos géncsaládok jelentősen kibővülnek és fejlődnek. Ezeknek a családoknak a kibővítése fontos genomi alap lehet a figyelemre méltó tulajdonságok javításáhozM. Lutarioriparius.
A genom összeszerelésének legfontosabb statisztikái
Ábra. Az M. lutarioriparius genomegységének áttekintése
Hírek és kiemelések Cél, hogy megosszák a legújabb sikeres eseteket a biomarker technológiákkal, új tudományos eredményeket, valamint a tanulmány során alkalmazott kiemelkedő technikákat.
A postai idő: január-05-2022