A transzkriptom a kapcsolat a genomi genetikai információk és a biológiai funkció proteomja között. A transzkripciós szintű szabályozás a legfontosabb és legszélesebb körben vizsgált szabályozási mód. A transzkriptome szekvenálás bármikor vagy bármilyen állapotban szekvenálhatja a transzkriptómát, egyetlen nukleotidra pontos felbontással. Dinamikusan tükrözi a gén -transzkripció szintjét, egyidejűleg azonosítja és számszerűsíti a ritka és normál transzkriptumokat, és megadja a szerkezeti információkat, és a szerkezeti információkat biztosítja Minta specifikus átiratok.
Jelenleg a transzkriptom szekvenálási technológiát széles körben alkalmazzák az agronómiában, az orvostudományban és más kutatási területeken, ideértve az állatok és növények fejlesztési szabályozását, a környezeti alkalmazkodást, az immun kölcsönhatást, a gén lokalizációját, a fajok genetikai evolúcióját és a tumor és a genetikai betegség kimutatását.