Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Termékek

Genom-szerte asszociációs elemzés

A Genome-Wide Association Studies (GWAS) célja a meghatározott tulajdonságokhoz (fenotípusokhoz) kapcsolódó genetikai változatok (genotípusok) azonosítása. Azáltal, hogy nagyszámú egyedben megvizsgálja a genetikai markereket a teljes genomban, a GWAS populációs szintű statisztikai elemzésekkel extrapolálja a genotípus-fenotípus asszociációkat. Ez a módszertan kiterjedt alkalmazásokat talál az emberi betegségek kutatásában, valamint az állatok vagy növények összetett tulajdonságaival kapcsolatos funkcionális gének feltárásában.

A BMKGENE-nél két lehetőséget kínálunk a GWAS nagy populációkon történő lebonyolítására: teljes genom szekvenálás (WGS) vagy csökkentett reprezentációjú genom szekvenálási módszer, a házon belül kifejlesztett Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF) választása. Míg a WGS megfelel a kisebb genomoknak, az SLAF költséghatékony alternatívaként jelenik meg a nagyobb populációk hosszabb genomokkal történő tanulmányozására, hatékonyan minimalizálva a szekvenálási költségeket, miközben garantálja a magas genetikai markerek felfedezésének hatékonyságát.


Szolgáltatás részletei

Bioinformatika

Demo Eredmény

Kiemelt kiadványok

Munkafolyamat

图片13

Szolgáltatás előnyei

Széleskörű szakértelem és publikációs nyilvántartás: a GWAS-ban felhalmozott tapasztalattal a BMKGene több száz fajprojektet hajtott végre a populációs GWAS-kutatásban, segített a kutatóknak több mint 100 cikk publikálásában, és a kumulált impakt faktor elérte az 500-at.

● Átfogó bioinformatikai elemzés: a munkafolyamat magában foglalja az SNP-jellemzők asszociációs elemzését, amely egy sor jelölt gént és a megfelelő funkcionális annotációt szolgáltat.

Magasan képzett bioinformatikai csapat és rövid elemzési ciklus: a fejlett genomikai elemzés terén nagy tapasztalattal rendelkező BMKGene csapata átfogó elemzéseket készít, gyors átfutási idővel.

Értékesítés utáni támogatás:Elkötelezettségünk a projekt befejezésén túl is 3 hónapos értékesítés utáni szolgáltatási időszakkal terjed ki. Ez idő alatt projektkövetést, hibaelhárítási segítséget és kérdés-feleleteket kínálunk az eredményekkel kapcsolatos kérdések megválaszolásához.

Szolgáltatási előírások és követelmények

A szekvenálás típusa

Javasolt populációs skála

Szekvenálási stratégia

Nukleotid követelmények

Teljes genom szekvenálás

200 minta

10x

Koncentráció: ≥ 1 ng/µL

Teljes mennyiség ≥ 30 ng

Korlátozott vagy nincs bomlás vagy szennyeződés

Specific-Locus Amplified Fragment (SLAF)

Címkemélység: 10x

Címkék száma:

< 400 Mb: WGS ajánlott

< 1 Gb: 100 000 címke

1 Gb

> 2 Gb: 300 000 címke

Max 500 ezer címke

Koncentráció ≥ 5 ng/µL

Teljes mennyiség ≥ 80 ng

Nanodrop OD260/280=1,6-2,5

Agaróz gél: nincs bomlás vagy szennyeződés, vagy csak korlátozott mértékben

 

Anyag kiválasztása

动物1
动物2
kép7

Különböző fajták, alfajok, tájfajták/génbankok/vegyes családok/vad erőforrások

Különböző fajták, alfajok, tájfajták

Féltestvér család/teljes testvércsalád/vad erőforrások

Szerviz munkafolyamat

Minta minőségellenőrzés

Kísérleti tervezés

minta szállítás

Mintaszállítás

Kísérleti kísérlet

RNS extrakció

Könyvtár előkészítése

Könyvtárépítés

Sorrendezés

Sorrendezés

Adatelemzés

Adatelemzés

Értékesítés utáni szolgáltatások

Értékesítés utáni szolgáltatások


  • Előző:
  • Következő:

  • 图片119

    A következő elemzést tartalmazza:

    • Genom-szerte asszociációs elemzés: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM modell
    • A jelölt gének funkcionális annotációja

    SNP-vonás asszociációs elemzés – Manhattan plot

     

    图片14

     

    SNP-vonás asszociációs elemzés – QQ diagram

     

    图片15

     

     

    Fedezze fel a BMKGene de GWAS szolgáltatásai által elősegített fejlesztéseket egy válogatott kiadványgyűjtemény segítségével:

    Lv, L. et al. (2023) „Betekintés a Sinonovacula constricta borotvakagyló ammóniatoleranciájának genetikai alapjába genomszintű asszociációs vizsgálattal”,Akvakultúra, 569, p. 739351. doi: 10.1016/J.AQUACULTURE.2023.739351.

    Li, X. et al. (2022) „398 rókafarkköles-származék multi-omikai elemzése a háziasítással, metabolitjellemzőkkel és gyulladáscsökkentő hatásokkal kapcsolatos genomiális régiókat tár fel”Molekuláris növény, 15(8), 1367–1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.

    Li, J. et al. (2022) „Genome-Wide Association Mapping of Hulles Barely Phenotypes in Drought Environment”,A növénytudomány határai, 13. o. 924892. doi: 10.3389/FPLS.2022.924892/BIBTEX.

    Zhao, X. et al. (2021) „A szulfotranszferázt kódoló GmST1 rezisztenciát biztosít a szójabab mozaikvírus G2 és G3 törzseivel szemben”,Növény, sejt és környezet, 44(8), 2777–2792. doi: 10.1111/PCE.14066.

    kérjen árajánlatot

    Írja ide üzenetét és küldje el nekünk

    Küldje el nekünk üzenetét: