DNBSEQ előre elkészített könyvtárak
Jellemzők
●Platform:MGI-DNBSEQ-T7
●Szekvenálási módok:PE150
●Illumina könyvtárak átvitele ideMGI:lehetővé teszi a nagy adatmennyiségek szekvenálását alacsony költséggel.
●A könyvtárak minőségellenőrzése szekvenálás előtt.
●Sorozati adatok minőségellenőrzése és szállítása:QC jelentés és nyers adatok kézbesítése fastq formátumban demultiplexelés és szűrés után Q30 olvas.
Előnyök
●A szekvenálási szolgáltatások sokoldalúsága:az ügyfél választhat, hogy sáv vagy adatmennyiség szerinti sorrendet kíván-e rendezni.
●Magas adatkimenet:1500 Gb/sáv
●A szekvenálási minőségellenőrzési jelentés kézbesítése:a minőségi mérőszámokkal, az adatok pontosságával és a szekvenálási projekt általános teljesítményével.
●Érett szekvenálási folyamat:rövid átfutási idővel.
●Szigorú minőségellenőrzés: szigorú minőségellenőrzési követelményeket vezetünk be, hogy garantáljuk a folyamatosan jó minőségű eredményeket.
Mintakövetelmények
| Adatmennyiség (X) | Koncentráció (qPCR/nM) | Kötet | |
| Részleges sáv
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Egysávos | Per Lane | ≥ 1,5 nM / Library pool | ≥ 25 μl / Könyvtári medence |
A koncentráció és az összmennyiség mellett megfelelő csúcsmintázat is szükséges.
Megjegyzés: Az alacsony diverzitású könyvtárak sávsorrendjéhez PhiX spike-in szükséges a robusztus alaphívás biztosítása érdekében.
Javasoljuk, hogy mintaként küldje be az előre összegyűjtött könyvtárakat. Ha a BMKGENE-re van szüksége a könyvtári összevonás végrehajtásához, kérjük, tekintse meg a
könyvtári követelmények a részleges sávsorrendhez.
Könyvtár mérete (csúcs térkép)
A fő csúcsnak 300-450 bp között kell lennie.
A könyvtáraknak egyetlen főcsúccsal kell rendelkezniük, az adapterek szennyeződése és a primer dimerek nélkül.
Szolgáltatási munkafolyamat
Könyvtári minőségellenőrzési jelentés
A szekvenálás, a könyvtár mennyiségének és a töredezettség felmérése előtt jelentést készítünk a könyvtár minőségéről.
Sorozati minőségellenőrzési jelentés
1. táblázat: A szekvenálási adatok statisztikái.
| Mintaazonosító | BMKID | Nyers olvasmányok | Nyers adatok (bp) | tiszta olvasmányok (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96,48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
1. ábra Minőségi eloszlás a leolvasások mentén az egyes mintákban
2. ábra Alaptartalom-eloszlás
3. ábra Az olvasott tartalmak megoszlása a szekvenálási adatokban
