Illumina előre elkészített könyvtárak
Jellemzők
●Platformok:Illumina Novaseq 6000 és Novaseq X Plus
●Szekvenálási módok:PE150 és PE250
●A könyvtárak minőség -ellenőrzése a szekvenálás előtt
●Az adatok QC szekvenálása és a kézbesítés:A QC jelentés és a nyers adatok kézbesítése a FASTQ formátumban a Demultiplexing és a Q30 szűrése után
Szolgáltatási előnyök
●A szekvenálási szolgáltatások sokoldalúsága:Az ügyfél választhat szekvenciát sáv, áramlási cella vagy a szükséges adatok mennyiségével (részleges sávszekvenálás).
●Átfogó tapasztalat az Illumina szekvenálási platformon:több ezer zárt projektkel, különféle fajokkal.
●A szekvenálás QC jelentés kézbesítése:minőségi mutatókkal, adat pontossággal és a szekvenálási projekt általános teljesítményével.
●Érett szekvenálási folyamat:Rövid fordulási idővel.
●Szigorú minőség -ellenőrzés: Szigorú QC követelményeket hajtunk végre a következetesen jó minőségű eredmények kézbesítésének garantálására.
Minta platformok
| Platform | Áramlási cella | Szekvenálási mód | Egység | Becsült kimenet |
| Novaseq x | 10b (8 sáv) | PE150 | Egy sáv Részleges sáv | 375 GB / sáv |
| 25b (8 sáv) | PE150 | Egy sáv Részleges sáv | 1000 GB/sáv | |
| Novaseq 6000 | SP Flow Cell (2 sáv) | PE250 | Áramlási cella Egy sáv Részleges sáv | 325-400 m Reads / Lane |
| S4 áramlási cella (4 sáv) | PE150 | Áramlási cella Egy sáv Részleges sáv | ~ 800 GB / sáv |
Minta követelmények
| Adatösszeg (x) | Koncentráció (qPCR/nm) | Kötet | |
| Részleges sávszekvenálás
| X ≤ 10 GB | ≥ 1 nm | ≥ 25 μL |
| 10 GB <x ≤ 50 GB | ≥ 2 nm | ≥ 25 μL | |
| 50 GB <x ≤ 100 GB | ≥ 3 nm | ≥ 25 μL | |
| X> 100 GB | ≥ 4 nm | ≥ 25 μL | |
| Sávszekvenálás | Sávonként | ≥ 1,5 nm / könyvtárkészlet | ≥ 25 μL / könyvtári medence |
A koncentráció és a teljes mennyiség mellett megfelelő csúcsmintázatra is szükség van.
Megjegyzés: Az alacsony sokféleségű könyvtárak sávszekvenálásához a robusztus bázishívás biztosítása érdekében PHIX Spike-in.
Javasoljuk, hogy benyújtsuk az előre behajtott könyvtárakat mintákként. Ha a BMKGENE -nek szüksége van a könyvtári pooling végrehajtására, kérjük, olvassa el
A részleges sávszekvenálás könyvtári követelményei.
Könyvtár mérete (csúcstérkép)
A fő csúcsnak 300-450 bp-en belül kell lennie.
A könyvtáraknak egyetlen fő csúcsgal kell rendelkezniük, nincs adapter szennyeződés és nincs alapozó dimer.
Kérjük, vegye fel velünk a kapcsolatot, ha a mintái nem felelnek meg a kiindulási anyagkövetelményeknek.
Szolgáltató munkafolyamat
Könyvtári minőség -ellenőrzés
Szekvenálás
Adatminőség -ellenőrzés
Projekt kézbesítés
Könyvtári QC jelentés
A könyvtár szekvenálása, a könyvtár mennyiségének értékelése és a fragmentáció előtti jelentést a könyvtár minőségéről.
QC -jelentés szekvenálása
1. táblázat. Statisztikák az adatok szekvenálására.
| Minta azonosítója | BMKID | Nyers olvasmányok | Nyers adatok (BP) | Tiszta olvasmányok (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861 036 000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36,67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98,95 | 93.89 | 37.08 |
1. ábra. Minőség eloszlás az egyes mintákban az olvasások mentén
2. ábra. Alaptartalom eloszlása
3. ábra. Az olvasási tartalom eloszlása a szekvenálási adatokban
