CircRNS szekvenálás-Illumina
Jellemzők
● Az rRNS kimerülése, majd az irányított könyvtári előkészítés, lehetővé téve a szál-specifikus szekvenálási adatokat.
● A bioinformatikai munkafolyamat lehetővé teszi a circRNS előrejelzését és az expressziós számszerűsítést
Szolgáltatási előnyök
●Átfogóbb RNS könyvtárak:Az rRNS-kimerülést a lineáris RNS-kimerülés helyett a könyvtár előtti előkészítésünk során használjuk, biztosítva, hogy a szekvenálási adatok nemcsak a CircRNS-t, hanem az mRNS-t és az lncRNS-t is tartalmazzák, lehetővé téve ezen adatkészletek közös elemzését
●A verseny endogén RNS (CERNA) hálózatok opcionális elemzése: Mélyebb betekintést nyújtva a sejtes szabályozási mechanizmusokba
●Kiterjedt szakértelem: A több mint 20 000 minta feldolgozásának eredményeként a BMKGENE -nél, amely különféle mintatípusokat és LNCRNS projekteket ölel fel, csapatunk rengeteg tapasztalatot hoz minden projekthez.
●Szigorú minőség -ellenőrzés: Az alapvető vezérlési pontokat minden szakaszban, a minta- és könyvtári előkészítéstől a szekvenálásig és a bioinformatikáig valósítjuk meg. Ez a aprólékos megfigyelés biztosítja a következetesen jó minőségű eredmények szállítását.
● Az értékesítés utáni támogatás: Elkötelezettségünk a projekt befejezésén túlmutat, egy 3 hónapos értékesítés utáni szolgáltatási periódussal. Ez idő alatt a projekt nyomon követését, hibaelhárítási támogatást és Q & A üléseket kínálunk az eredményekkel kapcsolatos kérdések kezelésére.
Minta követelmények és szállítási követelmények
| Könyvtár | Platform | Ajánlott adatok | Data QC |
| rRNS kimerült irányú könyvtár | Illumina PE150 | 16-20 GB | Q30 ≥85% |
Minta követelmények:
Nukleotidok:
| Conc. (Ng/μL) | Összeg (μg) | Tisztaság | Integritás |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Korlátozott vagy egyáltalán nem látható fehérje vagy DNS -szennyeződés a gélen. | Rin ≥6,0; 5,0 ≥28s/18s ≥1.0; korlátozott vagy nincs kiindulási magasság |
● Növények:
Gyökér, szár vagy szirom: 450 mg
Levél vagy mag: 300 mg
Gyümölcs: 1,2 g
● Állat:
Szív vagy bél: 450 mg
Viscera vagy agy: 240 mg
Izom: 600 mg
Csontok, haj vagy bőr: 1,5 g
● ízeltlábúak:
Rovarok: 9G
Körög: 450 mg
● Teljes vér:2 cső
● Cellák: 106 sejtek
● Szérum és plazma: 6 ml
Ajánlott minta szállítás
Tartály: 2 ml centrifuga cső (az ónfólia nem ajánlott)
Minta címkézés: Csoport+replikáció EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Szállítás:
1. Száraz jég: A mintákat zsákokba kell csomagolni és száraz jégbe temetni.
2.
Szolgáltatási munka folyamat
Kísérleti tervezés
Minta szállítás
RNS -extrakció
Könyvtári felépítés
Szekvenálás
Adatelemzés
Értékesítés utáni szolgáltatások
Bioinformatika
Circrna előrejelzés: kromoszómális eloszlás
Differenciálisan expresszált circRNS - vulkángrafot
Differenciálisan expresszált circRNS - hierarchikus klaszterezés
A CircRNA gazdaszervezetének funkcionális dúsítása
Fedezze fel a Bmkgene circRNS szekvenálási szolgáltatásai által elősegített kutatási előrelépéseket egy publikációk kurátus gyűjteményén keresztül.
Wang, X. et al. (2021) „A CPSF4 szabályozza a CircRNS képződését és a mikroRNS -mediált géncsendesítést a hepatocellularis carcinomában”, Oncogene 2021 40:25, 40 (25), 4338–4351. doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al. (2023) 'x oo-reagáló transzkriptómát mutatja a körkörös RNA133 szerepét a betegség rezisztenciájában az Osarab expressziójának szabályozásával a rizsben ”, Phytopathology Research, 5 (1), 1–14. doi: 10.1186/s42483-023-00188-8/6. ábra.
Y, H. et al. (2023) „A CPSF3 modulálja a kör alakú és lineáris transzkripciók egyensúlyát a májsejtek carcinomájában”. doi: 10.21203/Rs.3.rs-2418311/v1.
Zhang, Y. et al. (2023) „A circRNS -ek átfogó értékelése cirrhotikus kardiomiopátia a májátültetés előtt és után”, International Immunopharmacology, 114, p. 109495. Doi: 10.1016/j.intimp.2022.109495.
