● Preparasyon Bibliyotèk gen ladan yon etap seleksyon gwosè
● analiz bioinformatic santre sou prediksyon miRNA ak objektif yo
●Comprehensive analiz bioinformatics:Pèmèt idantifikasyon nan tou de li te ye ak roman miRNAs, idantifikasyon nan objektif miRNAs, ak korespondan anotasyon fonksyonèl ak anrichisman ak baz done miltip (KEGG, GO)
●Kontwòl kalite solid: Nou aplike pwen kontwòl debaz atravè tout etap, ki soti nan echantiyon ak preparasyon bibliyotèk nan sekans ak bioinformatics. Sa a siveyans metikuleu asire livrezon an nan toujou-wo kalite rezilta yo.
●Post-lavant sipò: Angajman nou an pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis 3-mwa apre-sale. Pandan tan sa a, nou ofri pwojè swiv-up, depanaj asistans, ak Q & Yon sesyon adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
●Anpil ekspètiz: Avèk yon dosye track nan fèmen avèk siksè sou pwojè sRNA miltip ki kouvri plis pase 300 espès nan domèn rechèch divès kalite, ekip nou an pote yon richès nan eksperyans nan chak pwojè.
Bibliotèk | Platfòm | Done rekòmande | Done QC |
Gwosè chwazi | Illumina SE50 | 10m-20m li | Q30≥85% |
Nukleotid:
Conc. (Ng/μl) | Kantite lajan (μg) | Pite | Entegrite |
≥ 80 | ≥ 0.8 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limite oswa pa gen pwoteyin oswa ADN kontaminasyon yo montre sou jèl. | Rin≥6.0; 5.0≥28s/18s≥1.0; Limite oswa pa gen okenn elevasyon debaz |
● Plant yo:
Rasin, tij oswa petal: 450 mg
Fèy oswa pitit pitit: 300 mg
Fwi: 1.2 g
● Animal:
Kè oswa trip: 450 mg
Viscera oswa sèvo: 240 mg
Misk: 600 mg
Zo, cheve oswa po: 1.5g
● Arthropods:
Ensèk: 9g
Crustacea: 450 mg
● san antye: 2 tib
● Selil yo: 106 selil
● Serik ak Plasma:6 ml
Veso: 2 ml tib santrifijez (papye fèblan pa rekòmande)
Etikèt Etikèt: Gwoup+replike EG A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Chajman:
1. sèk-glas: echantiyon yo dwe chaje nan sache ak antere l 'nan sèk-glas.
2. Tib rnastable: echantiyon RNA ka seche nan tib estabilizasyon RNA (egzanp RNASTABLE®) ak anbake nan tanperati chanm.
Bioinformatics
● Klasifikasyon sRNA
● Aliyman nan yon genomic referans
● Idantifikasyon li te ye ak roman miRNA
● Analiz ekspresyon miRNA diferans
● Anotasyon fonksyonèl nan objektif miRNA
Idantifikasyon nan miRNA: estrikti ak pwofondè
Ekspresyon diferans nan miRNA - hiearchical gwoupman
Anotasyon fonksyonèl nan sib nan diferansye miRNAs eksprime
Eksplore pwogrè rechèch yo fasilite pa sèvis sekans bmkgene 'sRNA nan yon koleksyon òganize nan piblikasyon.
Chen, H. et al. (2023) 'Enfeksyon viral anpeche biosentèz saponin ak fotosentèz nan Panax Notoginseng', Fizyoloji Plant ak byochimik, 203, p. 108038. DOI: 10.1016/j.plaphy.2023.108038.
Li, H. et al. (2023) 'Plant FYVE domèn - ki gen pwoteyin Free1 asosye ak konpozan mikro pou reprime miRNA biogenesis', EMBO rapò, 24 (1). doi: 10.15252/emb.202255037/suppl_file/ELB202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.tif.
Yu, J. et al. (2023) 'MicroRNA AME-BANTAM-3P kontwole devlopman larval pupal pa vize miltip epidèrmik kwasans faktè-tankou jèn yo 8 (MEGF8) nan abèy la, APIs Mellifera', Creole Journal of Molekilè Syans, 24 (6), p . 5726. DOI: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al. (2018) 'Analiz entegre nan miRNA ak jèn ki asosye ak bon jan kalite vyann revele ke GGA-MIR-140-5p afekte depozisyon grès miskilè nan poul', fizyoloji selilè ak byochimik, 46 (6), pp 2421-2433. doi: 10.1159/000489649.