Redwi reprezantasyon bisulfite sekans (RRBS)
Redwi reprezantasyon Bisulfite sekans (RRBS) te parèt kòm yon altènatif pri-efikas ak efikas nan tout genomic bisulfite sekans (WGBS) nan rechèch metilasyon ADN. Pandan ke WGBS bay Sur konplè pa ekzamine genomic a tout antye nan rezolisyon baz sèl, pri segondè li yo kapab yon faktè limite. RRBs estratejik diminye defi sa a pa oaza analize yon pòsyon reprezantan nan genomic la. Metodoloji sa a depann sou anrichisman nan rejyon CpG zile ki rich pa klivaj MSPI ki te swiv pa seleksyon gwosè nan 200-500/600 fragman bps. Kontinwe, sèlman rejyon yo ki pi pre zile CpG yo sekans, pandan y ap moun ki gen byen lwen zile CpG yo eskli nan analiz la. Pwosesis sa a, konbine avèk sekans bisulfit, pèmèt pou deteksyon wo-rezolisyon nan metilasyon ADN, ak apwòch la sekans, PE150, konsantre espesyalman sou bout yo nan foure yo olye ke nan mitan an, ogmante efikasite nan metilasyon profile. RRBS a se yon zouti anpil valè ki pèmèt pri-efikas rechèch metilasyon ADN ak avans konesans nan mekanis epigenetik.
Karakteristik Sèvis
● Mande pou yon genomic referans.
● Lambda ADN yo itilize pou kontwole efikasite konvèsyon bisulfit.
● MSPI dijesyon efikasite tou kontwole.
● Double dijesyon anzim pou echantiyon plant yo.
● Sekans sou Illumina Novaseq.
Avantaj Sèvis
●Pri-efikas ak efikas altènatif a WGBS: Pèmèt analiz la dwe te pote soti nan yon pri ki pi ba ak ak kondisyon ki pi ba echantiyon.
●Ranpli platfòm:Bay yon sèl-sispann sèvis ekselan soti nan pwosesis echantiyon, konstriksyon bibliyotèk, ak sekans nan analiz bioinformatics.
●Anpil ekspètiz: Avèk pwojè sekans RRBS avèk siksè ranpli atravè yon seri divès nan espès, BMKGENE pote sou yon dekad nan eksperyans, yon ekip analiz trè kalifye, kontni konplè, ak ekselan sipò pòs-lavant yo.
Espesifikasyon Sèvis
| Bibliotèk | Estrateji sekans | Rekòmande pwodiksyon done | Kontwòl kalite |
| MSPI dijere ak bisulfit Bibliyotèk trete | Illumina PE150 | 8 GB | Q30 ≥ 85% Konvèsyon bisulfit> 99% MSPI koupe efikasite> 95% |
Egzanp kondisyon
| Konsantrasyon (ng/µL) | Kantite lajan total (µg) |
| |
| ADN jenomik | ≥ 30 | ≥ 1 | Degradasyon limite oswa kontaminasyon |
Sèvis koule travay
Livrezon echantiyon
Konstriksyon Bibliyotèk
Syen
Done analiz
Apre-sale sèvis yo
Gen ladan analiz sa a:
● Raw sekans kontwòl kalite;
● Transfòmasyon pou referans genomic;
● Deteksyon 5MC baz methylated ak motif idantifikasyon;
● Analiz distribisyon metilasyon ak konparezon echantiyon;
● Analiz de rejyon diferansye methylated (DMRs);
● Anotasyon fonksyonèl nan jèn ki asosye ak DMRs.
Kontwòl Kalite: efikasite dijesyon (nan kat genomic)
Kontwòl Kalite: konvèsyon bisulfit (nan ekstraksyon enfòmasyon metilasyon)
Kat Metilasyon: 5mc Distribisyon Metilasyon genomic-lajè
Egzanp Konparezon: analiz eleman direktè
Diferansyèlman methylated rejyon (DMRS) analiz: Heatmap
Eksplore pwogrè rechèch yo fasilite pa tout BMKGENE a genomic BISULFITE sekans sèvis nan yon koleksyon òganize nan piblikasyon.
Li, Z. et al. (2022) 'segondè-fidelite reprogramasyon nan Leydig ki tankou selil pa CRISPR aktivasyon ak faktè paracrine',PNAS lyen, 1 (4). doi: 10.1093/pnasnexus/pgac179.
Tian, H. et al. (2023) 'Genomic-lajè analiz metilasyon ADN nan konpozisyon kò nan marasa monozygotik Chinwa',Jounal Ewopeyen an nan Envestigasyon nan klinik, 53 (11), p. E14055. doi: 10.1111/eci.14055.
Wu, Y. et al. (2022) 'metilasyon ADN ak rapò ren-a-anch: yon etid asosyasyon epigenome-lajè nan marasa monozygotik Chinwa',Journal of Endocrinological Envestigasyon, 45 (12), pp. 2365-2376. doi: 10.1007/s40618-022-01878-4.
