-
BMKMANU S3000_Spatial Transcriptome
Transcriptomics espasyal kanpe devan inovasyon syantifik, pèmèt chèchè yo fouye nan modèl ekspresyon jèn konplike nan tisi yo pandan y ap prezève kontèks espasyal yo. Nan mitan divès platfòm, BMKGene te devlope BMKManu S3000 Spatial Transcriptome Chip la, ki gen yon rezolisyon amelyore nan 3.5µm, rive nan seri subselilè, ak pèmèt anviwònman rezolisyon milti-nivo. Chip S3000 a, ki gen apeprè 4 milyon tach, anplwaye mikwo-puits kouch ak pèl ki chaje ak sond kaptire ki gen kòd bar. Yon bibliyotèk cDNA, ki anrichi ak kòd bar espasyal, prepare nan chip S3000 la epi answit sekans sou platfòm Illumina NovaSeq la. Konbinezon an nan echantiyon espasyal barcoded ak UMIs asire presizyon ak espesifik nan done yo pwodwi yo. Chip BMKManu S3000 a trè versatile, ofri anviwònman rezolisyon milti-nivo ki ka tise byen branche sou diferan tisi ak nivo detay yo vle. Adaptabilite sa a pozisyon chip la kòm yon chwa eksepsyonèl pou divès etid transcriptomics espasyal, asire gwoup egzak espasyal ak bri minim. Itilizasyon teknoloji segmantasyon selil ak BMKManu S3000 pèmèt delimitasyon done transkripsyon yo nan limit selil yo, sa ki lakòz yon analiz ki gen siyifikasyon dirèk byolojik. Anplis de sa, rezolisyon an amelyore nan S3000 rezilta nan pi gwo kantite jèn ak UMI yo detekte pou chak selil, sa ki pèmèt yon analiz pi egzak sou modèl yo transkripsyon espasyal ak gwoupman nan selil yo.
-
Sekans RNA sèl-nwayo
Devlopman nan yon sèl selil kaptire ak teknik konstriksyon bibliyotèk koutim, makonnen ak sekans gwo-debi, te revolusyone etid ekspresyon jèn nan nivo selil. Dekouvèt sa a pèmèt pou analiz pi pwofon ak pi konplè sou popilasyon selil konplèks, simonte limit ki asosye ak mwayèn ekspresyon jèn sou tout selil yo epi prezève vrè eterojenite nan popilasyon sa yo. Pandan ke sekans RNA yon sèl selil (scRNA-seq) gen avantaj ki pa ka nye, li rankontre defi nan sèten tisi kote kreyasyon yon sispansyon sèl selil pwouve difisil epi li mande echantiyon fre. Nan BMKGene, nou adrese obstak sa a lè nou ofri yon sèl-nwayo sekans RNA (snRNA-seq) lè l sèvi avèk dènye teknoloji 10X Genomics Chromium la. Apwòch sa a elaji spectre echantiyon ki kapab analize transcriptom nan nivo selil sèl.
Izolasyon nwayo yo reyalize atravè chip inovatè 10X Genomics Chromium, ki gen yon sistèm mikrofluidik uit kanal ak doub travèse. Nan sistèm sa a, pèl jèl ki enkòpore kòd bar, primè, anzim, ak yon nwayo sèl yo ankapsule nan gout lwil oliv ki menm gwosè ak nanolit, ki fòme Gel Bead-in-Emulsion (GEM). Apre fòmasyon GEM, liz selil ak lage kòd bar rive nan chak GEM. Imedyatman, molekil mRNA sibi transkripsyon ranvèse nan cDNAs, enkòpore kòd bar 10X ak Idantifyan molekilè inik (UMI). Lè sa a, cDNAs sa yo sibi konstriksyon bibliyotèk sekans estanda, fasilite yon eksplorasyon solid ak konplè nan pwofil ekspresyon jèn nan nivo selil sèl.
Platfòm: 10 × Genomics Chromium ak Illumina NovaSeq platfòm
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Transcriptomic espasyal se yon teknoloji dènye kri ki pèmèt chèchè yo mennen ankèt sou modèl ekspresyon jèn nan tisi yo pandan y ap prezève kontèks espasyal yo. Yon platfòm pwisan nan domèn sa a se 10x Genomics Visium makonnen ak sekans Illumina. Prensip 10X Visium la chita sou yon chip espesyalize ak yon zòn kaptire ki deziyen kote seksyon tisi yo mete. Zòn kaptire sa a gen tach ki gen kòd bar, chak korespondan ak yon kote espasyal inik nan tisi a. Lè sa a, molekil RNA yo te kaptire nan tisi a make ak idantifyan molekilè inik (UMI) pandan pwosesis transkripsyon ranvèse a. Tach kòd ak UMI sa yo pèmèt kat espasyal egzak ak quantifikasyon ekspresyon jèn nan yon rezolisyon sèl selil. Konbinezon an nan echantiyon espasyal barcoded ak UMIs asire presizyon ak espesifik nan done yo pwodwi yo. Lè yo itilize teknoloji Transcriptomics espasyal sa a, chèchè yo ka jwenn yon konpreyansyon pi pwofon sou òganizasyon espasyal selil yo ak entèraksyon molekilè konplèks ki fèt nan tisi yo, yo ofri apèsi anpil valè sou mekanis ki kache pwosesis byolojik yo nan plizyè domèn, tankou nkoloji, nerosyans, byoloji devlopman, iminoloji. , ak etid botanik.
Platfòm: 10X Genomics Visium ak Illumina NovaSeq
