-
Sekans metagenomik -NGS
Yon metagenom se yon koleksyon total de materyèl jenetik yon kominote melanje òganis, tankou metagenom anviwònman ak imen. Li genyen ladan li genomics mikwo-òganis tou de cultivable ak uncultivatable. Sekans metagenomik Shotgun ak NGS pèmèt etid la nan jaden flè sa yo konplike jenomik entegre nan echantiyon anviwònman an nan bay plis pase pwofil taksonomik, bay tou apèsi granulaire sou divèsite espès, dinamik abondans, ak estrikti popilasyon konplèks. Pi lwen pase syans taksonomik, metagenomics gè ofri tou yon pèspektiv jenomik fonksyonèl, ki pèmèt eksplorasyon jèn kode ak wòl yo sipoze nan pwosesis ekolojik. Finalman, etablisman rezo korelasyon ant eleman jenetik ak faktè anviwònman an kontribye nan yon konpreyansyon holistic nan entèraksyon konplike ant kominote mikwòb yo ak background ekolojik yo. An konklizyon, sekans metagenomik kanpe kòm yon enstriman esansyèl pou debouche sibtilite jenomik divès kominote mikwòb yo, eklere relasyon ki genyen plizyè aspè ant jenetik ak ekoloji nan ekosistèm konplèks sa yo.
Platfòm: Illumina NovaSeq ak DNBSEQ-T7
-
Sekans metagenomik-TGS
Yon metagenom se yon koleksyon materyèl jenetik nan yon kominote melanje òganis, tankou metagenom anviwònman ak imen. Li genyen ladan li genomics mikwo-òganis tou de cultivable ak uncultivatable. Sekans metagenomik pèmèt etid la nan jaden flè sa yo konplike jenomik entegre nan echantiyon ekolojik lè yo bay plis pase pwofil taksonomik. Li ofri tou yon pèspektiv jenomik fonksyonèl nan eksplore jèn yo kode ak wòl yo sipoze nan pwosesis anviwònman an. Pandan ke apwòch tradisyonèl fizi ak sekans Illumina yo te lajman itilize nan syans metagenomic, avenman nan sekans Nanopore ak PacBio ki long li te chanje jaden an. Teknoloji Nanopore ak PacBio amelyore analiz bioenfòmatik en, sitou asanble metagenom, asire asanble plis kontinyèl. Rapò yo endike ke metagenomics ki baze sou Nanopore ak PacBio te jenere avèk siksè jenom bakteri konplè ak fèmen nan mikrobyom konplèks (Moss, EL, et al., Nature Biotech, 2020). Entegre lekti Nanopore ak lekti Illumina bay yon apwòch estratejik pou koreksyon erè, diminye presizyon ki ba nannan Nanopore a. Konbinezon sinèrji sa a ogmante fòs chak platfòm sekans yo, ki ofri yon solisyon solid pou simonte limit potansyèl yo ak avanse presizyon ak fyab nan analiz metagenomic.
Platfòm: Nanopore PromethION 48, Illumia ak PacBio Revio
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Jèn rRNA 16S ak 18S yo, ansanm ak rejyon Internal Transcribed Spacer (ITS), sèvi kòm makè anprent molekilè esansyèl akòz konbinezon yo nan rejyon trè konsève ak hyper-varyab, ki fè yo zouti anpil valè pou karakterize òganis prokaryotic ak ekaryotik. Anplifikasyon ak sekans rejyon sa yo ofri yon apwòch san izolasyon pou envestige konpozisyon mikwòb ak divèsite atravè divès ekosistèm. Pandan ke sekans Illumina anjeneral vize rejyon ipèrvaryab kout tankou V3-V4 nan 16S ak ITS1, li te demontre ke siperyè anotasyon taksonomik yo ka reyalize pa sekans tout longè 16S, 18S, ak ITS. Apwòch konplè sa a rezilta nan pi gwo pousantaj nan sekans klase avèk presizyon, reyalize yon nivo rezolisyon ki pwolonje nan idantifikasyon espès yo. Platfòm sekans Single-Molecule Real-Time (SMRT) PacBio a kanpe deyò lè li bay lekti long ki trè egzak (HiFi) ki kouvri anplikon yo plen longè, rivalize ak presizyon nan sekans Illumina. Kapasite sa a pèmèt chèchè yo atenn yon avantaj inegal - yon gade panoramique nan jaden flè jenetik la. Kouvèti pwolonje a siyifikativman elve rezolisyon an nan anotasyon espès yo, patikilyèman nan kominote bakteri oswa chanpiyon, sa ki pèmèt yon konpreyansyon pi pwofon sou sibtilite yo nan popilasyon mikwòb yo.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Sekans anplikon ak teknoloji Illumina, ki vize espesyalman makè jenetik 16S, 18S, ak ITS yo, se yon metòd pwisan pou debouche filojeni, taksonomi, ak abondans espès nan kominote mikwòb yo. Apwòch sa a enplike nan sekans rejyon hypervariable makè jenetik antretyen yo. Orijinèlman prezante kòm yon anprent molekilè paWoeses et alan 1977, teknik sa a te revolusyone pwofil mikrobyom pa pèmèt analiz izolasyon-gratis. Atravè sekans 16S (bakteri), 18S (chanpiyon), ak Internal Transcribed Spacer (ITS, fongis), chèchè yo ka idantifye non sèlman espès abondan, men tou espès ki ra epi yo pa idantifye. Lajman adopte kòm yon zouti esansyèl, sekans anplikon te vin enstrimantal nan disène konpozisyon mikwòb diferans nan divès anviwònman, ki gen ladan bouch moun, trip, poupou, ak pi lwen.
-
Bakteri ak chanpiyon Whole Genome Re-sekans
Pwojè re-sekans tout-genom bakteri ak chanpiyon yo esansyèl pou avanse jenomik mikwòb lè yo pèmèt fini ak konparezon jenom mikwòb yo. Sa a fasilite jeni fèmantasyon, optimize pwosesis endistriyèl yo, ak eksplorasyon wout metabolis segondè yo. Anplis de sa, chanpiyon ak bakteri re-sekans enpòtan anpil pou konprann adaptasyon anviwònman an, optimize tansyon, ak revele dinamik evolisyon jenetik, ak gwo enplikasyon nan medikaman, agrikilti, ak syans anviwònman an.
-
Sekans prokaryotik RNA
Sekans RNA pèmèt pwofil konplè tout transkripsyon RNA nan selil yo nan kondisyon espesifik. Teknoloji dènye kri sa a sèvi kòm yon zouti ki pisan, revele pwofil ekspresyon jèn konplike, estrikti jèn, ak mekanis molekilè ki asosye ak divès pwosesis byolojik. Lajman adopte nan rechèch fondamantal, dyagnostik klinik, ak devlopman dwòg, sekans RNA ofri apèsi sou konplisite nan dinamik selilè ak règleman jenetik. Pwosesis echantiyon RNA prokaryotik nou an adapte pou transkriptòm prokaryotik, ki enplike rediksyon rRNA ak preparasyon bibliyotèk direksyon.
Platfòm: Illumina NovaSeq
-
Sekans metatranskriptòm
Swiv teknoloji sekans Illumina, sèvis sekans metatranscriptome BMKGENE a devwale ekspresyon jèn dinamik divès kalite mikwòb, ki kouvri ekaryot rive pwokaryot ak viris, nan anviwònman natirèl tankou tè, dlo, lanmè, poupou, ak zantray la. Sèvis konplè nou an pèmèt chèchè yo fouye nan pwofil ekspresyon jèn konplè kominote mikwòb konplèks yo. Pi lwen pase analiz taksonomik, sèvis sekans metatranskriptòm nou an fasilite eksplorasyon nan anrichisman fonksyonèl, bay limyè sou jèn ki eksprime diferan ak wòl yo. Dekouvri yon richès nan konesans byolojik pandan w ap navige nan jaden flè konplèks ekspresyon jèn, divèsite taksonomik, ak dinamik fonksyonèl nan divès nich anviwònman sa yo.
-
De novo Chanpiyon Genome Asanble
BMKGENE ofri solisyon versatile pou genomic chanpiyon, pou satisfè bezwen divès rechèch ak konplè genòm vle. Sèvi ak sekans Illumina ki kout pou kont li pèmèt jenerasyon yon genomic bouyon. Kout lekti ak sekans lekti long lè l sèvi avèk Nanopore oswa Pacbio yo konbine pou yon genomic chanpiyon pi rafine ak kontig pi long. Anplis, entegre Hi-C sekans plis amelyore kapasite yo, sa ki pèmèt reyalizasyon yon genòm konplè nan nivo kwomozòm.
-
De novo Bakteri Genome Asanble
Nou bay yon sèvis konplè asanble genomic bakteri, garanti 0 twou vid ki genyen. Sa a se posib lè w entegre teknoloji sekans lekti long, tankou Nanopore ak PacBio pou asanble ak sekans lekti kout ak Illumina pou validation asanble ak koreksyon erè nan lekti ONT. Sèvis nou an bay workflow bioenfòmatik konplè soti nan asanble, anotasyon fonksyonèl, ak analiz bioenfòmatik avanse, satisfè objektif rechèch espesifik. Sèvis sa a pèmèt devlopman jenom referans presi pou divès etid jenetik ak jenomik. Anplis de sa, li fòme baz pou aplikasyon pou tankou optimize souch, jeni jenetik, ak devlopman teknoloji mikwòb, asire done jenomik serye ak san espas ki enpòtan anpil pou avanse konesans syantifik ak inovasyon bioteknolojik.
