Heatmap
Zouti Heatmap la aksepte yon dosye done matris kòm opinyon epi li pèmèt itilizatè yo filtre, nòmalize ak gwoup done. Ka itilizasyon prensipal pou heatmaps se analiz gwoup nivo ekspresyon jèn ant diferan echantiyon.
Gene Annotation
Zouti Gene Annotation la fè yon anotasyon jèn ki baze sou aliyman sekans dosye FASTA D 'kont baz done divès kalite.
Zouti rechèch aliyman lokal debaz (BLAST)
Zouti BLAST la se yon vèsyon entegre BMKCloud nan NCBI BLAST epi li ka itilize pou fè menm fonksyon yo lè l sèvi avèk done ki telechaje sou kont BMKCloud la.
CDS_UTR Prediksyon
Zouti CDS_UTR Prediksyon an fèt pou predi rejyon kodaj (CDS) ak rejyon ki pa kodaj (UTR) nan sekans transkripsyon bay yo ki baze sou rezilta BLAST kont baz done pwoteyin li te ye ak rezilta prediksyon ORF.
Konplo Manhattan
Zouti Manhattan Plot la pèmèt ekspozisyon echantiyon gwo eksperyans epi li souvan itilize nan etid asosyasyon genòm lajè (GWAS).
Dyagram Circos
Zouti Dyagram CIRCOS la bay vizyalizasyon efikas sou kouman karakteristik jenomik yo distribye atravè genòm nan. Karakteristik komen yo enkli loki quantitative, SNPs, InDels, varyant estriktirèl ak nimewo kopi.
Jenetik Ontoloji (GO) anrichisman
Zouti anrichisman GO bay analiz anrichisman fonksyonèl. Lojisyèl prensipal nan zouti sa a se pake TopGO-Bioconductor, ki gen ladan analiz ekspresyon diferans, analiz anrichisman GO ak vizyalizasyon rezilta yo.
Analiz rezo ko-ekspresyon jen pondéré (WGCNA)
WGCNA se yon metòd done min ki lajman itilize pou dekouvri modil ko-ekspresyon jèn yo. Li aplikab a divès kalite done ekspresyon ki gen ladan microarray ak done ekspresyon jèn NGS.
InterProScan
Zouti InterProScan a bay InterPro sekans pwoteyin analiz ak klasifikasyon.
GO KEGG anrichisman
Zouti anrichisman GO KEGG la se konsepsyon pou jenere yon istogram anrichisman GO, yon istogram anrichisman KEGG ak yon chemen anrichisman KEGG ki baze sou yon seri jèn yo bay ak anotasyon korespondan.