Pacbio Full-length transcriptome

PacBio Full-Length Transcriptome Sequencing, Isoseq, pèmèt idantifikasyon egzat nan izoform transkripsyon, koule limyè sou poliadenilasyon altènatif ak splicing, ak mennen nan analiz ekspresyon jèn ki pi egzak. Tiyo transcriptom BMKCloud PacBio Full-Length la fèt pou analize bibliyotèk cDNA ki sekans nan mòd sekans konsansis sikilè (CCS) epi idantifye sekans tout longè ki pa chimerik (FLNC), ki answit gwoupe nan transkripsyon ki pa redondants. Yon analiz BUSCO ki vin apre evalye konplè asanble transcriptom la. Soti nan transcriptome reyini an, analiz miltip yo fèt: splicing altènatif, repetisyon sekans senp (SSR), prediksyon lncRNA ak jèn sib korespondan, prediksyon jèn nouvo, analiz fanmi jèn, analiz faktè transkripsyon, ak anotasyon fonksyonèl nan transkripsyon.