mRNA-seq (NGS) ak referans genomic
RNA-seq se yon zouti estanda atravè lavi ak syans rekòt, pon an diferans ki genyen ant jnom ak pwoteom. Fòs li bay manti nan dekouvri nouvo relve nòt ak quantification ekspresyon yo nan yon sèl tès. Li nan lajman itilize pou etid transcriptomic konparatif, koule limyè sou jèn ki gen rapò ak karakteristik divès kalite oswa fenotip, tankou konpare mutan ak kalite sovaj oswa revele ekspresyon jèn nan kondisyon espesifik. BMKCloud mRNA (referans) app entegre quantification ekspresyon, analiz ekspresyon diferans (DEG), ak sekans estrikti analyses nan mRNA-seq a (NGS) bioinformatics tiyo ak amalgamates fòs yo nan lojisyèl menm jan an, asire konvenyans ak itilizatè-amitye. Itilizatè yo ka Upload done RNA-seq yo nan nwaj la, kote app a ofri yon konplè, yon sèl-sispann solisyon analiz bioinformatic. Anplis de sa, li priyorite eksperyans kliyan, ofri operasyon pèsonalize pwepare a bezwen espesifik itilizatè yo. Itilizatè yo ka mete paramèt epi soumèt misyon an tiyo pa tèt yo, tcheke rapò a entèaktif, gade done/dyagram ak ranpli done min, tankou: sib seleksyon jèn, gwoupman fonksyonèl, dyagram, elatriye.
Platfòm:Illumina, MGI
Estrateji:RNA-seq
Plan: Pari, pwòp-done.
Kalite Bibliyotèk:fr-unstranded, fr-firststrand oswa fr-secondstrand
Li longè:150 bp
Kalite dosye:*.fastq, *.fq, *.fastq.gz oswa *.fq.gz. Sistèm lan pralotomatikman pè dosye yo .fastq dapre non dosye yo,egzanp *_1.fastq pè ak *._ 2.fastq.
Kantite echantiyon:Pa gen okenn restriksyon sou nimewo anan echantiyon yo, men tan an analiz ap ogmante kòm nimewo a nanSamples ap grandi.
Rekòmande Done Kantite lajan:6g pou chak echantiyon