Genmis
Asanble kwomozòm-echèl ak analiz de Biomass rekòt miscanthus lutarioriparius genomic
Nanopore sekans | Illumina | Hi-C | RNA-sekans | Filojèn
Nan etid sa a, teknoloji biomarqueur bay sipò teknik sou sekans nanopore, de novo asanble genomic, Hi-C asanble asanble, elatriye.
Abstrè
Miscanthus, yon plant kontinuèl rizomatous, gen gwo potansyèl pou pwodiksyon bioenergie pou segondè Biomass li yo ak tolerans estrès. Nou rapòte yon asanble kwomozòm-echèl nanMiscanthus lutarioripariusGenomic pa konbine Oxford nanopore sekans ak Hi-C teknoloji. Asanble a 2.07-GB kouvri 96.64% nan genomic la, ak contig N50 nan 1.71 MB. Sekans yo santromè ak telomè yo reyini pou tout 19 kwomozòm ak kwomozòm 10, respektivman. Orijin Allotetraploid nan M. lutarioriparius a se konfimasyon lè l sèvi avèk centromeric satelit repete. Estrikti a genomic tetraploid ak plizyè reyaranj kwomozomik ki gen rapò ak sorgo yo klèman demontre. Tandem kopi jèn nanM. Lutarioripariusyo fonksyonèl anrichi pa sèlman an tèm ki gen rapò ak repons estrès, men biosentèz selil miray la. Fanmi jèn ki gen rapò ak rezistans maladi, biosentèz miray selil ak transpò ion metal yo anpil elaji ak evolye. Ekspansyon fanmi sa yo ka yon baz jenomik enpòtan pou amelyorasyon karakteristik remakab nanM. Lutarioriparius.
Statistik kle nan asanble genomic
Figi. Apèsi sou lekòl la nan M. Lutarioriparius Asanble a genomic
Nouvèl ak En Vize nan pataje dènye ka yo siksè ak teknoloji biomarqueur, kaptire roman reyalizasyon syantifik kòm byen ke teknik enpòtan aplike pandan etid la.
Post tan: Jan-05-2022