Metagenomics (NGS)

Metagenomics Shotgun ak Illumina se yon zouti popilè pou etidye mikrobyom pa dirèkteman sekans ADN soti nan echantiyon konplèks, ki pèmèt etid la nan tou de taksonomik ak divèsite fonksyonèl. Tiyo BMKCloud metagenomic (NGS) kòmanse ak kontwòl kalite ak asanble metagenom, ki soti nan ki prevwa jèn yo ak gwoupe nan seri done ki pa redondants ke yo anote pou fonksyon ak taksonomi lè l sèvi avèk baz done miltip. Yo itilize enfòmasyon sa a pou analize divèsite taksonomik nan echantiyon an (divèsite alfa) ak divèsite ant echantiyon (divèsite beta). Analiz diferans ant gwoup yo jwenn OTU ak fonksyon byolojik ki diferan ant de gwoup yo lè l sèvi avèk tès parametrik ak tès ki pa parametrik, pandan y ap analiz korelasyon gen rapò diferans sa yo ak faktè anviwònman an.