Analiz asosyasyon genomic-lajè
Wo nivo
Avantaj Sèvis
●Anpil ekspètiz ak dosye piblikasyon: Avèk eksperyans akimile nan GWAS, BMKGENE te konplete dè santèn de pwojè espès nan rechèch popilasyon GWAS, chèchè ede yo pibliye plis pase 100 atik, ak faktè a enpak kimilatif rive 500.
● analiz complète bioinformatics: Workflow gen ladan analiz asosyasyon SNP-TRAIT, fournir yon seri jèn kandida ak korespondan anotasyon fonksyonèl yo.
●Trè kalifye ekip bioinformatics ak sik analiz kout: Avèk gwo eksperyans nan analiz jenomik avanse, ekip BMKGENE a delivre analyses konplè ak yon tan rotation rapid.
●Post-lavant sipò:Angajman nou an pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis 3-mwa apre-sale. Pandan tan sa a, nou ofri pwojè swiv-up, depanaj asistans, ak Q & Yon sesyon adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Espesifikasyon sèvis ak kondisyon
| Kalite sekans | Rekòmande echèl popilasyon an | Estrateji sekans | Kondisyon Nucleotide |
| Tout sekans genomic | 200 echantiyon | 10x | Konsantrasyon: ≥ 1 ng/ µl Total kantite lajan ≥ 30ng Limite oswa pa gen degradasyon oswa kontaminasyon |
| Espesifik-locus amplifye fragman (SLAF) | Tag pwofondè: 10x Kantite Tags: <400 MB: WGS rekòmande <1GB: 100k Tags 1GB > 2GB: 300k tags Max 500k Tags | Konsantrasyon ≥ 5 ng/µl Kantite lajan total ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 Agarose jèl: Non oswa limite degradasyon oswa kontaminasyon
|
Seleksyon materyèl
Varyete diferan, subspecies, landraces/Genebanks/fanmi melanje/resous sovaj
Varyete diferan, subspecies, landraces
Mwatye-sib fanmi/plen-sib fanmi/sovaj resous yo
Sèvis koule travay
Eksperyans Design
Livrezon echantiyon
Ekstraksyon RNA
Konstriksyon Bibliyotèk
Syen
Done analiz
Apre-sale sèvis yo
Gen ladan analiz sa a:
- Genomic-lajè analiz Asosyasyon: LM, LMM, EMMAX, FASTLMM MODÈL
- Anotasyon fonksyonèl nan jèn kandida
SNP-TRAIT Association Analysis-Manhattan Trase
SNP-TRAIT Association Analysis-QQ trase
Eksplore pwogrè yo fasilite pa sèvis de Gwas Bmkgene a nan yon koleksyon òganize nan piblikasyon:
LV, L. et al. (2023) 'insight nan baz jenetik tolerans amonyak nan razwa palis sinonovacula constricta pa etid asosyasyon genomic-lajè',Akakilti, 569, p. 739351. DOI: 10.1016/j.aquaculture.2023.739351.
Li, X. et al. (2022) 'Multi-omics analyses de 398 Foxtail pitimi accessions revele rejyon jenomik ki asosye ak domestik, karakteristik metabolit, ak efè anti-enflamatwa',Plant molekilè, 15 (8), pp 1367-1383. doi: 10.1016/j.molp.2022.07.003.
Li, J. et al. (2022) 'Genomic-lajè Asosyasyon Transfòmasyon nan Hulless apèn fenotip nan anviwònman sechrès',Frontiers nan syans plant, 13, p. 924892. DOI: 10.3389/fpls.2022.924892/BIBTEX.
Zhao, X. et al. (2021) 'GMST1, ki kodifye yon sulfotransferase, konfèr rezistans nan viris soya mozayik tansyon G2 ak G3',Plant, selil & anviwònman, 44 (8), pp 2777-2792. doi: 10.1111/pce.14066.
