Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Pwodwi yo

Jenetik evolisyonè

Evolisyonè Jenetik se yon sèvis sekans konplè ki fèt pou ofri yon entèpretasyon apwofondi sou evolisyon nan yon gwo gwoup moun, ki baze sou varyasyon jenetik, ki gen ladan SNPs, InDels, SVs, ak CNVs. Sèvis sa a anglobe tout analiz esansyèl ki nesesè pou elicide chanjman evolisyonè yo ak karakteristik jenetik popilasyon yo, tankou evalyasyon estrikti popilasyon, divèsite jenetik, ak relasyon filojenetik. Anplis, li fouye nan etid sou koule jèn, ki pèmèt estimasyon gwosè popilasyon efikas ak tan divergence. Etid jenetik evolisyonè yo bay bonjan enfòmasyon sou orijin ak adaptasyon espès yo.

Nan BMKGENE, nou ofri de avni pou fè etid jenetik evolisyonè sou gwo popilasyon: anplwaye sekans genòm antye (WGS) oswa chwazi yon metòd sekans jenom reprezantasyon redwi, Fragman anplifye nan lokal espesifik (SLAF) ki devlope nan kay la. Pandan ke WGS adapte pi piti jenom, SLAF parèt kòm yon altènatif pri-efikas pou etidye pi gwo popilasyon ki gen pi long jenom, efektivman minimize depans sekans.


Detay Sèvis

Bioenfòmatik

Rezilta Demo

Piblikasyon prezante yo

Avantaj sèvis yo

1 Jenetik evolisyonè

Takagi et al.,Jounal plant lan, 2013

Analiz bioenfòmatik konplè:pèmèt estimasyon divèsite jenetik, ki reflete potansyèl evolisyonè espès yo, epi revele relasyon filogenetik serye ant espès yo ak enfliyans minimize evolisyon konvèjan ak evolisyon paralèl.

Si ou vle analiz Customized: tankou estimasyon tan divergence ak vitès ki baze sou varyasyon nan nivo nukleotid ak asid amine.

Ekspètiz anpil ak dosye piblikasyon: BMKGene te akimile eksperyans masiv nan popilasyon ak pwojè jenetik evolisyonè pou plis pase 15 ane, ki kouvri plizyè milye espès, elatriye ak kontribye nan plis pase 1000 pwojè wo nivo pibliye nan Kominikasyon Lanati, Plant Molekilè, Plant Biotechnology Journal, elatriye.

● Ekip bioenfòmatik trè kalifye ak sik analiz kout: ak anpil eksperyans nan analiz jenomik avanse, ekip BMKGene a delivre analiz konplè ak yon tan rapid.

● Sipò apre lavant:Angajman nou an pwolonje pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis apre-sale 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans depanaj, ak sesyon Q&A pou adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.

Espesifikasyon sèvis ak kondisyon

Kalite sekans

Echèl popilasyon rekòmande

Estrateji sekans

Kondisyon pou nikleotid

Sekans tout genòm

≥ 30 moun, ak ≥ 10 moun nan chak sougwoup

 

10x

Konsantrasyon: ≥ 1 ng/µL

Kantite total ≥ 30ng

Limite oswa pa gen degradasyon oswa kontaminasyon

Fragman anplifye lokal espesifik (SLAF)

Pwofondè tag:

10x

Kantite Tags:

<400 Mb: WGS rekòmande

<1Gb: 100K Tags

1Gb

> 2Gb: 300K Tags

Maksimòm 500k tags

Konsantrasyon ≥ 5 ng/µL

Kantite total ≥ 80 ng

Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5

Jèl Agarose: pa gen oswa limite degradasyon oswa kontaminasyon

 

Koule Travay Sèvis

Egzanp QC

Eksperyans konsepsyon

livrezon echantiyon

Livrezon echantiyon

Preparasyon bibliyotèk

Konstriksyon bibliyotèk

Sekans

Sekans

Analiz done

Analiz done

Sèvis apre vant

Sèvis apre-sale


  • Previous:
  • Pwochen:

  • SLAF流程图 -8.4改-01

    Sèvis gen ladan analiz estrikti popilasyon an (pye bwa filojenetik, PCA, tablo stratifikasyon popilasyon an), divèsite popilasyon, ak seleksyon popilasyon (dezekilib lyezon, seleksyon seleksyon bale sit avantaje yo). Sèvis la kapab tou enkli analiz Customized (egzanp tan divèjans, koule jèn).

    *Rezilta Demo yo montre isit la se tout soti nan jenom pibliye ak BMKGENE

    1.Evolisyon analiz gen konstriksyon pye bwa filogenetik, estrikti popilasyon ak PCA ki baze sou varyasyon jenetik.

    Pye bwa filogenetik reprezante relasyon taksonomik ak evolisyonè nan mitan espès ki gen zansèt komen.
    PCA gen pou objaktif pou wè pwoksimite ant sub-populasyon yo.
    Estrikti popilasyon an montre prezans sub-popilasyon jenetikman diferan an tèm de frekans alèl.

    3-1Pyebwa filogenetik 3-2PCA 3-3 Popilasyon-estrikti

    Chen, et. al.,PNAS, 2020

    2.Selektif bale

    Bale selektif refere a yon pwosesis kote yo chwazi yon sit avantaje ak frekans sit net ki lye yo ogmante epi sa yo ki nan sit ki pa lye yo diminye, sa ki lakòz rediksyon nan rejyon an.

    Deteksyon nan tout genòm nan rejyon bale selektif yo trete lè yo kalkile endèks jenetik popilasyon an (π,Fst, Tajima a D) nan tout SNP nan yon fenèt glisman (100 Ko) nan sèten etap (10 Kb).

    Divèsite nikleotid (π)
    4Nukleotid-divèsite (π)

    Tajima a D
    5Tajima's-D

    Endèks fiksasyon (Fst)

    6Fixasyon-endèks (Fst)

    Wu, et. al.,Plant molekilè, 2018

    3.Gene Flow

    7Gene-koule

    Wu, et. al.,Plant molekilè, 2018

    4.Istwa demografik

    8Demografik-istwa

    Zhang, et. al.,Lanati Ekoloji & Evolisyon, 2021

    5.Divergence tan

    9Divèjans-tan

    Zhang, et. al.,Lanati Ekoloji & Evolisyon, 2021

    Eksplore pwogrè yo fasilite pa sèvis jenetik evolisyonè BMKGene a atravè yon koleksyon piblikasyon òganize:

    Hassanyar, AK et al. (2023) 'Dekouvèt makè molekilè SNP ak jèn kandida ki asosye ak rezistans viris Sacbrood nan lav Apis cerana cerana pa resekans antye-genom',Jounal entènasyonal nan syans molekilè, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.

    Chai, J. et al. (2022) "Dekouvèt yon salamandè jeyan sovaj, jenetikman pi bon kalite Chinwa kreye nouvo opòtinite konsèvasyon',Rechèch zoolojik, 2022, Vol. 43, Nimewo 3, Paj: 469-480, 43(3), paj 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.

    Han, M. et al. (2022) 'Modèl filojeografik ak Istwa Evolisyon Popilasyon Endijèn Elymus sibiricus L. sou Plato Qinghai-Tibetan',Fwontyè nan Syans Plant, 13, p. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.

    Wang, J. et al. (2022) 'Insights jenomik nan evolisyon longan soti nan yon asanble genomic nan nivo kwomozòm ak jenomik popilasyon nan asansyon longan',Rechèch ortikilti, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.

    jwenn yon quote

    Ekri mesaj ou la a epi voye l ba nou

    Voye mesaj ou a ban nou: