Takagi et al.,Jounal plant lan, 2013
●Analiz bioenfòmatik konplè:pèmèt estimasyon divèsite jenetik, ki reflete potansyèl evolisyonè espès yo, epi revele relasyon filogenetik serye ant espès yo ak enfliyans minimize evolisyon konvèjan ak evolisyon paralèl.
●Si ou vle analiz Customized: tankou estimasyon tan divergence ak vitès ki baze sou varyasyon nan nivo nukleotid ak asid amine.
●Ekspètiz anpil ak dosye piblikasyon: BMKGene te akimile eksperyans masiv nan popilasyon ak pwojè jenetik evolisyonè pou plis pase 15 ane, ki kouvri plizyè milye espès, elatriye ak kontribye nan plis pase 1000 pwojè wo nivo pibliye nan Kominikasyon Lanati, Plant Molekilè, Plant Biotechnology Journal, elatriye.
● Ekip bioenfòmatik trè kalifye ak sik analiz kout: ak anpil eksperyans nan analiz jenomik avanse, ekip BMKGene a delivre analiz konplè ak yon tan rapid.
● Sipò apre lavant:Angajman nou an pwolonje pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis apre-sale 3 mwa. Pandan tan sa a, nou ofri swivi pwojè, asistans depanaj, ak sesyon Q&A pou adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Kalite sekans | Echèl popilasyon rekòmande | Estrateji sekans | Kondisyon pou nikleotid |
Sekans tout genòm | ≥ 30 moun, ak ≥ 10 moun nan chak sougwoup
| 10x | Konsantrasyon: ≥ 1 ng/µL Kantite total ≥ 30ng Limite oswa pa gen degradasyon oswa kontaminasyon |
Fragman anplifye lokal espesifik (SLAF) | Pwofondè tag: 10x Kantite Tags: <400 Mb: WGS rekòmande <1Gb: 100K Tags 1Gb > 2Gb: 300K Tags Maksimòm 500k tags | Konsantrasyon ≥ 5 ng/µL Kantite total ≥ 80 ng Nanodrop OD260/280 = 1.6-2.5 Jèl Agarose: pa gen oswa limite degradasyon oswa kontaminasyon
|
Sèvis gen ladan analiz estrikti popilasyon an (pye bwa filojenetik, PCA, tablo stratifikasyon popilasyon an), divèsite popilasyon, ak seleksyon popilasyon (dezekilib lyezon, seleksyon seleksyon bale sit avantaje yo). Sèvis la kapab tou enkli analiz Customized (egzanp tan divèjans, koule jèn).
*Rezilta Demo yo montre isit la se tout soti nan jenom pibliye ak BMKGENE
1.Evolisyon analiz gen konstriksyon pye bwa filogenetik, estrikti popilasyon ak PCA ki baze sou varyasyon jenetik.
Pye bwa filogenetik reprezante relasyon taksonomik ak evolisyonè nan mitan espès ki gen zansèt komen.
PCA gen pou objaktif pou wè pwoksimite ant sub-populasyon yo.
Estrikti popilasyon an montre prezans sub-popilasyon jenetikman diferan an tèm de frekans alèl.
Chen, et. al.,PNAS, 2020
2.Selektif bale
Bale selektif refere a yon pwosesis kote yo chwazi yon sit avantaje ak frekans sit net ki lye yo ogmante epi sa yo ki nan sit ki pa lye yo diminye, sa ki lakòz rediksyon nan rejyon an.
Deteksyon nan tout genòm nan rejyon bale selektif yo trete lè yo kalkile endèks jenetik popilasyon an (π,Fst, Tajima a D) nan tout SNP nan yon fenèt glisman (100 Ko) nan sèten etap (10 Kb).
Divèsite nikleotid (π)
Tajima a D
Endèks fiksasyon (Fst)
Wu, et. al.,Plant molekilè, 2018
3.Gene Flow
Wu, et. al.,Plant molekilè, 2018
4.Istwa demografik
Zhang, et. al.,Lanati Ekoloji & Evolisyon, 2021
5.Divergence tan
Zhang, et. al.,Lanati Ekoloji & Evolisyon, 2021
Eksplore pwogrè yo fasilite pa sèvis jenetik evolisyonè BMKGene a atravè yon koleksyon piblikasyon òganize:
Hassanyar, AK et al. (2023) 'Dekouvèt makè molekilè SNP ak jèn kandida ki asosye ak rezistans viris Sacbrood nan lav Apis cerana cerana pa resekans antye-genom',Jounal entènasyonal nan syans molekilè, 24(7). doi: 10.3390/IJMS24076238.
Chai, J. et al. (2022) "Dekouvèt yon salamandè jeyan sovaj, jenetikman pi bon kalite Chinwa kreye nouvo opòtinite konsèvasyon',Rechèch zoolojik, 2022, Vol. 43, Nimewo 3, Paj: 469-480, 43(3), paj 469–480. doi: 10.24272/J.ISSN.2095-8137.2022.101.
Han, M. et al. (2022) 'Modèl filojeografik ak Istwa Evolisyon Popilasyon Endijèn Elymus sibiricus L. sou Plato Qinghai-Tibetan',Fwontyè nan Syans Plant, 13, p. 882601. doi: 10.3389/FPLS.2022.882601/BIBTEX.
Wang, J. et al. (2022) 'Insights jenomik nan evolisyon longan soti nan yon asanble genomic nan nivo kwomozòm ak jenomik popilasyon nan asansyon longan',Rechèch ortikilti, 9. doi: 10.1093/HR/UHAC021.