Ekaryotik mRNA sekans-NGS
Karakteristik
● Kaptire poly mRNA anvan preparasyon bibliyotèk la
● Preparasyon pou Bibliyotèk Opsyonèl direksyon mRNA pou pèmèt jwenn done sekans Strand-espesifik
● Bioinformatic analiz de ekspresyon jèn ak estrikti transkripsyon
Avantaj
●Anpil ekspètiz: Te ekip nou an trete plis pase 600,000 echantiyon nan BMKGENE, spanning divès kalite echantiyon tankou kilti selil, tisi, ak likid kò. Nou pote yon richès nan eksperyans nan chak pwojè epi yo te konplete avèk siksè plis pase 100,000 pwojè mRNA-seq nan domèn rechèch divès kalite.
●Kontwòl kalite solid: Nou aplike pwen kontwòl debaz atravè tout etap, ki soti nan echantiyon ak preparasyon bibliyotèk nan sekans ak bioinformatics. Sa a siveyans metikuleu asire livrezon an nan toujou-wo kalite rezilta yo, asire ou ke pwojè ou a se nan men serye.
●Complète anotasyon: Nou itilize baz done miltip pou anote fonksyonèl jèn yo eksprime diferans (DEG) ak fè korespondan analyses anrichisman. Apwòch sa a konplè bay Sur nan pwosesis yo selilè ak molekilè kache repons lan transkriptòm, asire ou yo konplètman enfòme sou rezilta pwojè ou a.
●Post-lavant sipò: Angajman nou an pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis 3-mwa apre-sale. Pandan tan sa a, nou ofri pwojè swiv-up, depanaj asistans, ak Q & Yon sesyon adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
Egzanp kondisyon ak livrezon
| Bibliotèk | Estrateji sekans | Done rekòmande | Kontwòl kalite |
| Poly yon rich | Illumina PE150 Dnbseq-t7 | 6 -10 GB | Q30≥85% |
Egzijans Egzanp:
Nukleotid:
| Conc. (Ng/μl) | Kantite lajan (μg) | Pite | Entegrite | |
| Bibliyotèk Creole | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limite oswa pa gen pwoteyin oswa ADN kontaminasyon yo montre sou jèl. | Pou plant: Rin≥4.0; Pou bèt: Rin≥4.5; 5.0≥28s/18s≥1.0; Limite oswa pa gen okenn elevasyon debaz |
| Bibliyotèk direksyon | ≥ 10 | ≥ 0.2 | OD260/280 = 1.7-2.5 OD260/230 = 0.5-2.5 Limite oswa pa gen pwoteyin oswa ADN kontaminasyon yo montre sou jèl. | Pou plant: Rin≥4.0; Pou bèt: Rin≥4.5; 5.0≥28s/18s≥1.0; Limite oswa pa gen okenn elevasyon debaz |
● Plant yo:
Rasin, tij oswa petal: 450 mg
Fèy oswa pitit pitit: 300 mg
Fwi: 1.2 g
●Animal:
Kè oswa trip: 300 mg
Viscera oswa sèvo: 240 mg
Misk: 450 mg
Zo, cheve oswa po: 1g
● Arthropods:
Ensèk: 6g
Crustacea: 300 mg
● san antye: 1 tib
● Selil yo: 106 selil
Rekòmande livrezon echantiyon
Veso: 2 ml tib santrifijez (papye fèblan pa rekòmande)
Etikèt Etikèt: Gwoup+replike EG A1, A2, A3; B1, B2, B3 ... ...
Chajman:
1. sèk-glas: echantiyon yo dwe chaje nan sache ak antere l 'nan sèk-glas.
2. Tab Tab RNAs: echantiyon RNA ka seche nan tib estabilizasyon RNA (egzanp RNASTABLE®) ak anbake nan tanperati chanm.
Sèvis koule travay
Eksperyans Design
Livrezon echantiyon
Ekstraksyon RNA
Konstriksyon Bibliyotèk
Syen
Done analiz
Apre-sale sèvis yo
Bioinformatics
Ekaryotik mRNA sekans analiz workflow
Bioinformatics
ØKontwòl bon jan kalite anvan tout koreksyon kontwòl kalite
ØReferans aliyman genomic
ØAnaliz estrikti transkripsyon
ØEkspresyon quantification
ØAnaliz ekspresyon diferansyèl
ØFonksyon anotasyon ak anrichisman
Referans aliyman genomic
Done saturation
Egzanp korelasyon ak evalyasyon repwodiksyon byolojik
Diferansyèlman eksprime jèn (DEG)
Anotasyon fonksyonèl nan DEGs
Fonksyonèl anrichisman nan DEGs
Eksplore pwogrè yo fasilite pa BMKGENE a ekaryotik NGS sèvis sekans mRNA nan yon koleksyon òganize nan piblikasyon.
Huang, L. et al. (2023) 'Triclosan ak Triclocarban febli kapasite nan olfactif nan pwason wouj pa kontrent rekonesans odoran, deranje transduction siyal olfactif, ak twoublan olfactif enfòmasyon pwosesis', rechèch dlo, 233, p. 119736. DOI: 10.1016/j.watres.2023.119736.
Jia, LJ et al. (2023) 'Aspergillus fumigatus detounen moun P11 pou redireksyon fagosom ki gen chanpiyon ki pa nan chemen ki pa degradatif', lame selil & mikwòb, 31 (3), pp 373-388.E10. doi: 10.1016/j.chom.2023.02.002.
Jin, K. et al. (2022) 'TCP faktè transkripsyon ki enplike nan devlopman tire nan MA Banbou (Dendrocalamus latiflorus Munro)', Frontiers nan Syans Plant, 13, p. 884443. DOI: 10.3389/fpls.2022.884443/BIBTEX.
Wen, X. et al. (2022) 'genomic la krizantèm lavandulifolium ak mekanis nan molekilè kache divès kalite capitulum', rechèch ortikol, 9. doi: 10.1093/hr/uhab022.
Zhang, Yujie et al. (2023) 'Yon Cascade nanoreactor pou amelyore terapi sonodinamik sou kansè nan kolon via sinèrjetik ROS ogmante ak blokaj autophagy', Nano jodi a, 49, p. 101798. DOI: 10.1016/j.nantod.2023.101798.
