Bibliyotèk pre-fè DNBSEQ
Karakteristik
●Platfòm:MGI-DNBSEQ-T7
●Mòd sekans:PE150
●Transfè nan bibliyotèk Illumina nanMGI:pèmèt sekans gwo volim done a pri ki ba.
●Kontwòl kalite bibliyotèk yo anvan sekans.
●Sekans done QC ak livrezon:livrezon rapò QC ak done anvan tout koreksyon nan fòma fastq apre demultiplexing ak filtraj Q30 li.
Avantaj
●Versatility nan sèvis sekans:kliyan an ka chwazi sekans pa liy oswa kantite done.
●Segondè pwodiksyon done:1500 Gb/liy
●Livrezon rapò QC sekans:ak mezi bon jan kalite, presizyon done ak pèfòmans jeneral nan pwojè a sekans.
●Pwosesis sekans ki gen matirite:ak tan kout vire.
●Kontwòl Kalite Rigour: nou aplike egzijans QC strik pou garanti akouchman an nan rezilta toujou-wo kalite.
Egzanp kondisyon yo
| Kantite Done (X) | Konsantrasyon (qPCR/nM) | Volim | |
| Pasyèl Lane
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ||
| Single Lane | Pa Lane | ≥ 1.5 nM / pisin bibliyotèk | ≥ 25 μl / pisin bibliyotèk |
Anplis konsantrasyon ak kantite total, yon modèl pik apwopriye tou obligatwa.
Remak: Sekans liy bibliyotèk divèsite ki ba yo mande pou PhiX pike-in pou asire apèl baz solid.
Nou rekòmande pou soumèt bibliyotèk pre-pool kòm echantiyon. Si w bezwen BMKGENE pou fè regroupement bibliyotèk, tanpri al gade nan
kondisyon bibliyotèk pou sekans liy pasyèl.
Gwosè Bibliyotèk (Pak kat jeyografik)
Pik prensipal yo ta dwe nan 300-450 bp.
Bibliyotèk yo ta dwe gen yon sèl pik prensipal, pa gen okenn kontaminasyon adaptè ak pa gen okenn dimers primè.
Workflow Sèvis
Rapò QC bibliyotèk la
Yo bay yon rapò sou kalite bibliyotèk la anvan sekans, evalye kantite bibliyotèk la, ak fwagmantasyon.
Rapò QC sekans
Tablo 1. Estatistik sou done sekans.
| Egzanp ID | BMKID | Lekti kri | Done kri (bp) | Lekti pwòp (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figi 1. Distribisyon kalite ansanm lekti nan chak echantiyon
Figi 2. Distribisyon kontni baz
Figi 3. Distribisyon kontni li nan done sekans
