Illumina pre-fè bibliyotèk
Karakteristik
●Platfòm:Illumina NovaSeq 6000 ak NovaSeq X Plus
●Mòd sekans:PE150 ak PE250
●Kontwòl kalite bibliyotèk yo anvan sekans
●Sekans done QC ak livrezon:livrezon rapò QC ak done anvan tout koreksyon nan fòma fastq apre demultiplexing ak filtraj Q30 li
Avantaj sèvis yo
●Versatility nan sèvis sekans:kliyan an ka chwazi sekans pa liy, selil koule, oswa pa kantite done ki nesesè (sekans liy pasyèl).
●Eksperyans anpil sou platfòm sekans Illumina:ak dè milye de pwojè fèmen ak divès espès.
●Livrezon rapò QC sekans:ak mezi bon jan kalite, presizyon done ak pèfòmans jeneral nan pwojè a sekans.
●Pwosesis sekans ki gen matirite:ak tan kout vire.
●Kontwòl Kalite Rigour: nou aplike egzijans QC strik pou garanti akouchman an nan rezilta toujou-wo kalite.
Egzanp platfòm
| Platfòm | Selil koule | Mòd sekans | Inite | Pwodiksyon estime |
| NovaSeq X | 10B (8 liy) | PE150 | Single Lane Pasyèl Lane | 375Gb / Lane |
| 25B (8 liy) | PE150 | Single Lane Pasyèl Lane | 1000 Gb/Lane | |
| NovaSeq 6000 | SP Flow selil (2 liy) | PE250 | Selil koule Single Lane Pasyèl Lane | 325-400 M li / Lane |
| S4 Flow selil (4 liy) | PE150 | Selil koule Single Lane Pasyèl Lane | ~800 Gb / Lane |
Egzanp kondisyon yo
| Kantite Done (X) | Konsantrasyon (qPCR/nM) | Volim | |
| Sekans Lane Pasyèl
| X ≤ 10 Gb | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
| 10 Gb < X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 25 μl | |
| 50 Gb < X ≤ 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 25 μl | |
| X > 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 25 μl | |
| Sekans liy | Pa Lane | ≥ 1.5 nM / pisin bibliyotèk | ≥ 25 μl / pisin bibliyotèk |
Anplis konsantrasyon ak kantite total, yon modèl pik apwopriye tou obligatwa.
Remak: Sekans liy bibliyotèk divèsite ki ba yo mande pou PhiX pike-in pou asire apèl baz solid.
Nou rekòmande pou soumèt bibliyotèk pre-pool kòm echantiyon. Si ou bezwen BMKGENE pou fè regroupement bibliyotèk, tanpri al gade
kondisyon bibliyotèk yo pou sekans liy pasyèl.
Gwosè Bibliyotèk (Pak kat jeyografik)
Pik prensipal yo ta dwe nan 300-450 bp.
Bibliyotèk yo ta dwe gen yon sèl pik prensipal, pa gen okenn kontaminasyon adaptè ak pa gen okenn dimers primè.
Tanpri kontakte nou si echantiyon ou yo pa satisfè kondisyon materyèl yo kòmanse.
Workflow Sèvis
Kontwòl kalite bibliyotèk
Sekans
Kontwòl kalite done
Livrezon pwojè
Rapò QC bibliyotèk la
Yo bay yon rapò sou kalite bibliyotèk la anvan sekans, evalye kantite bibliyotèk la, ak fwagmantasyon.
Rapò QC sekans
Tablo 1. Estatistik sou done sekans.
| Egzanp ID | BMKID | Lekti kri | Done kri (bp) | Lekti pwòp (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
| C_01 | BMK_01 | 22,870,120 | 6,861,036,000 | 96.48 | 99.14 | 94.85 | 36.67 |
| C_02 | BMK_02 | 14,717,867 | 4,415,360,100 | 96.00 | 98.95 | 93.89 | 37.08 |
Figi 1. Distribisyon kalite ansanm lekti nan chak echantiyon
Figi 2. Distribisyon kontni baz
Figi 3. Distribisyon kontni li nan done sekans
