De novo asanble genomic bakteri
Nou bay yon konplè sèvis asanble genomic bakteri, garanti 0 twou vid ki genyen. Sa a se posib pa entegre long-li teknoloji sekans, tankou nanopore ak Pacbio pou asanble ak kout-li sekans ak Illumina pou validasyon asanble ak koreksyon erè nan ONT li. Sèvis nou an bay konplè workflow la bioinformatic soti nan asanble, anotasyon fonksyonèl, ak avanse analiz bioinformatic, ranpli objektif rechèch espesifik. Sèvis sa a pèmèt devlopman nan jnom referans egzak pou divès kalite syans jenetik ak jenomik. Anplis de sa, li fòme baz la pou aplikasyon pou tankou optimize souch, jeni jenetik, ak devlopman teknoloji microbes, asire serye ak diferans-gratis done jenomik kritik pou avanse Sur syantifik ak inovasyon biotechnologie.
Karakteristik Sèvis
● Avèk de opsyon posib yo chwazi nan depann sou degre a vle nan genomic konplè.
● Opsyon Genomic Draft: Kout-li sekans ak Illumina Novaseq PE150.
● Ranpli 0 genomic Gap.
● Long-li sekans sou nanopore Promethion 48 oswa Pacbio Revio pou asanble genomic.
● Kout-li sekans sou Illumina Novaseq pou validasyon genomic ak koreksyon erè (nanopore) oswa jenere yon genomic bouyon.
Avantaj Sèvis
●Zewo-Gap genomic garanti: Sa a se akòz entegrasyon an nan sekans Illumina ak lontan li sekans (Nanopore oswa Pacbio).
●Ranpli workflow bioinformatics:Sa gen ladan asanble genomic ak prediksyon nan eleman jenomik miltip, anotasyon jèn fonksyonèl, ak vizyalizasyon genomic tankou trase Circos.
●Anpil ekspètiz: Avèk plis pase 20,000 jnom microbes reyini, BMKGENE pote sou yon dekad nan eksperyans, yon ekip analiz trè kalifye, kontni konplè, ak ekselan pòs-lavant sipò.
●Post-lavant sipò:Angajman nou an pi lwen pase fini pwojè ak yon peryòd sèvis 3-mwa apre-sale. Pandan tan sa a, nou ofri pwojè swiv-up, depanaj asistans, ak Q & Yon sesyon adrese nenpòt kesyon ki gen rapò ak rezilta yo.
●Estrateji sekans miltip ki disponib:Pou objektif rechèch diferan ak kondisyon nan konplè genomic.
Espesifikasyon Sèvis
| Lanmès | Estrateji sekans |
| Bouyon genomic | Illumina PE150 100x |
| 0 Gap genomic | Nanopore 100x + Illumina PE150 100x Or Pacbio Hifi 30x + Illumina PE150 100x (Si ou vle) |
Egzijans Egzanp:
| Konsantrasyon (ng/µL) | Kantite lajan total (µg) | Volim (µl) | OD260/280 | OD260/230 | |
| Pacbio | ≥ 20 | ≥1.2 | ≥ 20 | 1.7-2.2 | ≥1.0 |
| Nanopore | ≥40 | ≥2 | ≥ 20 | 1.7-2.2 | 1.0-3.0 |
| Ilistrasyon | ≥1 | ≥0.06 | ≥ 20 | - | - |
· Bakteri: ≥3.5x1010 selil
Sèvis koule travay
Livrezon echantiyon
Konstriksyon Bibliyotèk
Syen
Done analiz
Apre-sale sèvis yo
Gen ladan analiz sa a:
● Sekans kontwòl kalite done
● Asanble genomic
● analiz eleman genomic: prediksyon CD ak plizyè eleman jenomik
● Anotasyon fonksyonèl ak plizyè baz done jeneral (GO, KEGG, elatriye) ak baz done avanse (kat, VFDB, elatriye)
● Vizyalizasyon genomic
Nou bay genomic la nan yon fòma FASTA fasilman aksesib ak dosye a anotasyon genomic (GFF).
Anotasyon Gene - Ale
Anotasyon Gene - idrat kabòn Cazy
Vizyalizasyon genomic - trase Circos
Eksplore pwogrè yo fasilite pa sèvis asanble bakteri BMKGENE a nan yon koleksyon òganize nan piblikasyon.
Dai, W. et al. (2023) 'Dekouvèt nan Bacteroides Uniformis F18-22 kòm yon bakteri probyotik ki an sekirite ak roman pou tretman kolit emorajik ki soti nan kolon an sante imen',Creole Journal of Molecular Sciences, 24 (19), p. 14669. DOI: 10.3390/IJMS241914669/S1.
Kang, K. et al. (2021) 'Multidrug ki reziste proteus mirabilis izole pote blaoxa-1 ak blandm-1 soti nan bèt sovaj nan peyi Lachin: ogmante risk sante piblik',Zooloji entegre, 16 (6), pp 798-809. doi: 10.1111/1749-4877.12510.
Wang, TT et al. (2017) 'Ranpli sekans genomic nan fenofit Bacillus Flexus KLBMP 4941 revele mekanis plant pwomosyon kwasans li yo ak baz jenetik pou tolerans sèl',Journal of Biotechnology, 260, pp. 38-41. doi: 10.1016/j.jbiotec.2017.09.001.
Wang, X. et al. (2021) 'miltip-replicon plasmid rezistans nan Klebsiella medyasyon difizyon vaste nan jèn antibiotics',Frontiers nan mikrobyoloji, 12, p. 754931. DOI: 10.3389/fmicb.2021.754931/Bibtex.
