Exclusive Agency for Korea

Bmkcloud ouvri sesyon an

Pwodwi

16s/18s/amplicon sekans-pacbio li yo

16s/18s/amplicon li yo sekans-pacbio chin an tap imaj

16S ak 18S rRNA jèn yo, ansanm ak entèn transkri spacer (ITS) rejyon an, sèvi kòm pivotal makè anprent molekilè akòz konbinezon yo nan rejyon trè konsève ak ipèr-varyab, fè yo zouti anpil valè pou karakterize òganis pwokaryotik ak ekaryotik. Anplifikasyon ak sekans nan rejyon sa yo ofri yon apwòch izolasyon-gratis pou envestige konpozisyon an microbes ak divèsite nan tout ekosistèm divès kalite. Pandan ke sekans Illumina tipikman vize rejyon kout hypervariable tankou V3-V4 nan 16S ak ITS1, li te demontre ke anotasyon siperyè taxonomik se possible pa sekans longè a plen nan 16s, 18s, ak ITS. Apwòch sa a konplè rezilta nan pi wo pousantaj nan sekans avèk presizyon klase, reyisi yon nivo nan rezolisyon ki fin idantifikasyon espès yo. Single-molekil Pacbio a an tan reyèl (SMRT) platfòm sekans kanpe soti nan bay trè egzat lontan li (HIFI) ki kouvri amplicons yo plen longè, rival li presizyon nan sekans Illumina. Kapasite sa a pèmèt chèchè yo atenn yon avantaj depaman - yon View panoramic nan jaden flè jenetik la. Pwoteksyon an pwolonje siyifikativman elve rezolisyon an nan anotasyon espès, patikilyèman nan kominote bakteri oswa chanpiyon, pèmèt yon konpreyansyon pi fon nan sibtilite yo nan popilasyon microbes.

Kontakte nou

Sèvis Detay

Bioinformatics

Rezilta Demo

Piblikasyon Anons Spesyal

Karakteristik Sèvis

● Platfòm sekans: Pacbio Revio

● Mode sekans: CCS (HIFI li)

● Anplifikasyon nan rejyon sib ki te swiv pa tandem ki lye ak amplicons anvan Hifi Smrt Bell Bibliyotèk Preparasyon

Avantaj Sèvis

●Pi wo rezolisyon taksonomik: tHan Kout-Amplicon sekans,Pèmèt pi wo pousantaj klasifikasyon OTU nan nivo espès la.

●Trè egzat baz rele: Pacbio CCS mòd sekans (HIFI li).

●Izolasyon-gratis: Idantifikasyon rapid nan konpozisyon microbes nan echantiyon anviwònman an.

●Lajman aplikab: Divès etid kominote microbes.

●Comprehensive analiz bioinformatic: Dènye pake a QIIME2 (quantitative insight nan ekoloji microbes) ak analyses divès an tèm de baz done, komantasyon, OTU/ASV.

●Anpil ekspètiz: Avèk dè milye de pwojè sekans amplicon fèt chak ane, BMKGENE pote sou yon dekad nan eksperyans, yon ekip analiz trè kalifye, kontni konplè, ak ekselan sipò pòs-lavant yo.

Espesifikasyon Sèvis

Bibliotèk	Estrateji sekans	Done rekòmande
Amplicon	Pacbio Revio	10/30/50 K Tags (CCS)

Egzanp kondisyon

Konsantrasyon (ng/µL)	Kantite lajan total (µg)	Volim (µl)
≥5	≥0.3	≥ 20

Rekòmande livrezon echantiyon

Glase echantiyon yo nan nitwojèn likid pou 3-4 èdtan ak magazen nan nitwojèn likid oswa -80 degre nan alontèm rezèvasyon. Echantiyon anbake ak sèk-glas obligatwa.

Sèvis koule travay

Livrezon echantiyon

Konstriksyon Bibliyotèk

Syen

Done analiz

Apre-sale sèvis yo

Previous: 16s/18s/amplicon sekans-NGS li yo

Next: Assay pou transpozaz-aksesib chromatin ak sekans segondè debi (ATAC-seq)

Gen ladan analiz sa a:

● Raw done kontwòl kalite

● OTU gwoupman/de-bri (ASV)

● Anotasyon OTU

● Alpha divèsite analiz: endis miltip, ki gen ladan Shannon, Simpson ak Ace.

● Beta analiz divèsite

● Inter-gwoup analiz

● Analiz korelasyon: ant faktè anviwònman ak konpozisyon soti ak divèsite

● 16s prediksyon jèn fonksyonèl

Istogram distribisyon taksonomik

Distribisyon Kominote Pye bwa filojenetik

Alpha Divèsite analiz: Ace

endeks

Beta Divèsite analiz: PCOA

Analiz entègroup: ANOVA

Eksplore pwogrè yo fasilite pa BMKGENE a Amplicon sekans sèvis ak Pacbio nan yon koleksyon òganize nan piblikasyon.

Gao, X. ak Wang, H. (2023) 'Analiz konparatif nan pwofil bakteri ak fonksyon pandan adaptasyon nan diferan fenoloji (Regrèt vs Grassy) nan mouton alpine merino ak de etap k ap grandi sou yon Meadow alpine', fèmantasyon, 9 ( 1), p. 16. doi: 10.3390/fèmantasyon9010016/s1.

Li, S. et al. (2023) 'kaptire matyè a fè nwa microbes nan tè dezè lè l sèvi avèk culturomics ki baze sou metagenomics ak segondè-rezolisyon analiz', NPJ biofilms ak mikrobiom 2023 9: 1, 9 (1), pp 1-14. doi: 10.1038/s41522-023-00439-8.

Mu, L. et al. (2022) 'Efè sèl asid gra sou karakteristik fèmantasyon, divèsite bakteri ak estabilite aerobic nan silaj melanje prepare ak Alfalfa, pay diri ak ble ble', Journal of the Science of Manje ak Agrikilti, 102 (4), pp. 1475– 1487. doi: 10.1002/jsfa.11482.

Yang, J. et al. (2023) 'entèraksyon ki genyen ant biomarketè estrès oksidatif ak mikrobiota nan zantray nan efè yo antioksidan nan Ekstrè soti nan Sonchus brachyotus DC. Nan oxazolone-pwovoke entesten estrès oksidatif nan granmoun zebrafish ', antioksidan 2023, vol. 12, paj 192, 12 (1), p. 192. doi: 10.3390/antiox12010192.