Mala RNA sekvenciranje-ilumina
Značajke
● Priprema knjižnice uključuje korak odabira veličine
● Bioinformatička analiza usredotočena na predviđanje miRNA i njihovih ciljeva
Prednosti usluge
●Sveobuhvatna analiza bioinformatike:Omogućivanje identifikacije poznatih i novih miRNA, identifikacija ciljeva miRNA i odgovarajuće funkcionalne napomene i obogaćivanje s više baza podataka (KEGG, GO)
●Rigorozna kontrola kvalitete: Provodimo temeljne kontrolne točke u svim fazama, od uzoraka i pripreme knjižnice do sekvenciranja i bioinformatike. Ovo pažljivo praćenje osigurava davanje dosljedno visokokvalitetnih rezultata.
●Podrška nakon prodaje: Naša predanost proteže se izvan završetka projekta s 3-mjesečnom razdoblju nakon prodaje. Za to vrijeme nudimo praćenje projekta, pomoć u rješavanju problema i Q&A sjednice za rješavanje bilo kakvih upita vezanih za rezultate.
●Opsežna stručnost: S zapisnicima o uspješnom zatvaranju više projekata SRNA koji pokrivaju preko 300 vrsta u različitim istraživačkim domenama, naš tim donosi mnoštvo iskustava u svaki projekt.
Uzorak zahtjeva i isporuka
| Knjižnica | Platforma | Preporučeni podaci | Qc |
| Odabrana veličina | Illumina SE50 | 10m-20m čita | Q30≥85% |
Zahtjevi uzorka:
Nukleotidi:
| Conc. (Ng/μl) | Količina (μg) | Čistoća | Integritet |
| ≥ 80 | ≥ 0,8 | OD260/280 = 1,7-2,5 OD260/230 = 0,5-2,5 Ograničena ili bez kontaminacije proteina ili DNA prikazana na gelu. | Rin≥6.0; 5,0≥28S/18S≥1,0; Ograničeno ili nema osnovne visine |
● Biljke:
Korijen, stabljika ili latica: 450 mg
List ili sjeme: 300 mg
Voće: 1,2 g
● životinja:
Srce ili crijevo: 450 mg
Viscera ili mozak: 240 mg
Mišić: 600 mg
Kosti, kosa ili koža: 1,5 g
● Arthropods:
Insekti: 9G
Crustacea: 450 mg
● Cijela krv: 2 cijevi
● Stanice: 106 stanice
● Serum i plazma:6 ml
Preporučena isporuka uzorka
Kontejner: 2 ml cijev za centrifugu (limena folija se ne preporučuje)
Oznaka uzoraka: grupa+replicirati npr. A1, A2, A3; B1, B2, B3.
Pošiljka:
1. Suhi led: Uzorci se moraju spakirati u vrećice i zakopani u suhi led.
2. RNASTable Epruvete: Uzorci RNA mogu se sušiti u cijevi za stabilizaciju RNA (npr. RNastable®) i isporučuju se na sobnoj temperaturi.
Servisni rad protoka
Eksperiment dizajn
Dostava uzorka
Vađenje RNA
Konstrukcija knjižnice
Sekvenciranje
Analiza podataka
Usluge nakon prodaje
Bioinformatika
● Sirova kontrola kvalitete podataka
● SRNA klasifikacija
● Usklađivanje s referentnim genomom
● Identifikacija poznate i nove miRNA
● Diferencijalna analiza ekspresije miRNA
● Funkcionalna napomena ciljeva miRNA
Identifikacija miRNA: struktura i dubina
Diferencijalna ekspresija miRNA - hiearchical gruping
Funkcionalna napomena cilja različito izraženih miRNA
Istražite napredovanje istraživanja koje je omogućilo BMKGENE 'SRNA sekvencijske usluge putem kurirane zbirke publikacija.
Chen, H. i sur. (2023) 'Virusne infekcije inhibiraju biosintezu saponina i fotosintezu u Panax Notoginseng', Fiziologija biljaka i biokemija, 203, str. 108038. Doi: 10.1016/j.Plaphy.2023.108038.
Li, H. i sur. (2023) 'Protein koji sadrže biljku FYVE -a koji sadrže domenu1 povezuje se s mikroprocesorskim komponentama za potiskivanje biogeneze miRNA', izvještava Embo, 24 (1). doi: 10.15252/exm.202255037/suppl_file/exm202255037-sup-0004-SDataFig4.tif.
Yu, J. i sur. (2023.) 'MicroRNA AME-BANTAM-3P kontrolira razvoj larve zjenica ciljajući višestruke domene sličnih epidermalnom faktoru 8 gena (MEGF8) u medonosnoj ploči, APIS Mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24 (6), str . 5726. Doi: 10.3390/ijms24065726/s1.
Zhang, M. i sur. (2018) 'Integrirana analiza miRNA i gena povezanih s kvalitetom mesa otkriva da GGA-MIR-140-5P utječe na taloženje intramuskularnog masti u pilićima, staničnoj fiziologiji i biokemiji, 46 (6), str. 2421–2433. doi: 10.1159/000489649.
