Mala RNA

Male RNA su kratke nekodirajuće RNA s prosječnom dužinom od 18-30 NT, uključujući miRNA, siRNA i piRNA, koje igraju važnu ulogu u regulatornim procesima. BMKCloud SRNA cjevovod pruža i standardnu ​​i prilagođenu analizu za identifikaciju miRNA. Nakon čitanja obrezivanja i kontrole kvalitete, čitanja se usklađuju s više baza podataka za klasificiranje SRNA i odabir miRNA i mapiranih u referentni genom. MiRNA se identificiraju na temelju poznatih baza podataka miRNA, pružajući informacije o sekundarnoj strukturi, miRNA obitelji i ciljnim genima. Analiza diferencijalne ekspresije identificira različito eksprimirane miRNA, a odgovarajući ciljni geni funkcionalno su označeni kako bi se pronašli obogaćene kategorije.