Exclusive Agency for Korea

条形banner-03

Jednostanični Omics

  • BMKMANU S3000_Prostorni transkriptom

    BMKMANU S3000_Prostorni transkriptom

    Prostorna transkriptomika prednjači u znanstvenim inovacijama, osnažujući istraživače da istražuju zamršene obrasce ekspresije gena unutar tkiva, a istovremeno čuvaju njihov prostorni kontekst. Usred raznih platformi, BMKGene je razvio BMKManu S3000 prostorni transkriptomski čip, koji se može pohvaliti poboljšanom rezolucijom od 3,5 µm, dosežući subcelularni raspon i omogućujući postavke rezolucije na više razina. Čip S3000, koji ima približno 4 milijuna točaka, koristi mikrojažice preslojene zrncima napunjenim prostorno barkodiranim sondama za hvatanje. Knjižnica cDNA, obogaćena prostornim bar kodovima, priprema se iz S3000 čipa i zatim sekvencira na platformi Illumina NovaSeq. Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava točnost i specifičnost generiranih podataka. BMKManu S3000 čip je izuzetno svestran, nudi višerazinske postavke razlučivosti koje se mogu fino prilagoditi različitim tkivima i željenim razinama detalja. Ova prilagodljivost pozicionira čip kao izvanredan izbor za različite studije prostorne transkriptomije, osiguravajući precizno prostorno grupiranje uz minimalan šum. Korištenje tehnologije segmentacije stanica s BMKManu S3000 omogućuje razgraničenje transkripcijskih podataka do granica stanica, što rezultira analizom koja ima izravno biološko značenje. Nadalje, poboljšana rezolucija S3000 rezultira većim brojem gena i UMI-ja otkrivenih po stanici, što omogućuje mnogo točniju analizu prostornih transkripcijskih obrazaca i grupiranja stanica.

  • Jednojezgreno sekvenciranje RNA

    Jednojezgreno sekvenciranje RNA

    Razvoj hvatanja jedne stanice i tehnika konstrukcije prilagođene biblioteke, zajedno s visokoproduktivnim sekvenciranjem, revolucionirao je studije ekspresije gena na razini stanice. Ovo otkriće omogućuje dublju i sveobuhvatniju analizu složenih staničnih populacija, nadilazeći ograničenja povezana s prosječnom ekspresijom gena u svim stanicama i čuvajući istinsku heterogenost unutar tih populacija. Dok sekvenciranje jednostanične RNA (scRNA-seq) ima neporecive prednosti, ono nailazi na izazove u određenim tkivima gdje se stvaranje suspenzije jedne stanice pokazuje teškim i zahtijeva svježe uzorke. U BMKGene-u rješavamo ovu prepreku nudeći sekvenciranje RNK s jednom jezgrom (snRNA-seq) koristeći najsuvremeniju tehnologiju 10X Genomics Chromium. Ovaj pristup proširuje spektar uzoraka podložnih analizi transkriptoma na razini jedne stanice.

    Izolacija jezgri postiže se pomoću inovativnog 10X Genomics Chromium čipa, koji sadrži osmokanalni mikrofluidički sustav s dvostrukim križanjima. Unutar ovog sustava, zrnca gela koja sadrže bar kodove, primere, enzime i jednu jezgru su inkapsulirana u kapi ulja veličine nanolitra, tvoreći zrnca gela u emulziji (GEM). Nakon formiranja GEM-a, unutar svakog GEM-a dolazi do lize stanica i otpuštanja crtičnog koda. Nakon toga, molekule mRNA prolaze reverznu transkripciju u cDNA, uključujući 10X bar kodove i jedinstvene molekularne identifikatore (UMI). Te se cDNA zatim podvrgavaju standardnoj konstrukciji knjižnice sekvenciranja, olakšavajući robusno i sveobuhvatno istraživanje profila ekspresije gena na razini jedne stanice.

    Platforma: 10× Genomics Chromium i Illumina NovaSeq platforma

  • 10x Genomics Visium prostorni transkriptom

    10x Genomics Visium prostorni transkriptom

    Prostorna transkriptomika vrhunska je tehnologija koja omogućuje istraživačima da istražuju obrasce ekspresije gena unutar tkiva uz očuvanje njihovog prostornog konteksta. Jedna moćna platforma u ovoj domeni je 10x Genomics Visium u kombinaciji s Illumina sekvenciranjem. Princip 10X Visiuma leži na specijaliziranom čipu s određenim područjem snimanja gdje se postavljaju dijelovi tkiva. Ovo područje snimanja sadrži točke s crtičnim kodom, od kojih svaka odgovara jedinstvenoj prostornoj lokaciji unutar tkiva. Uhvaćene molekule RNA iz tkiva zatim se obilježavaju jedinstvenim molekularnim identifikatorima (UMI) tijekom procesa obrnute transkripcije. Ove točke s crtičnim kodom i UMI omogućuju precizno prostorno mapiranje i kvantifikaciju ekspresije gena u rezoluciji jedne stanice. Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava točnost i specifičnost generiranih podataka. Korištenjem ove tehnologije Spatial Transcriptomics, istraživači mogu steći dublje razumijevanje prostorne organizacije stanica i složenih molekularnih interakcija koje se događaju unutar tkiva, nudeći neprocjenjiv uvid u mehanizme koji leže u osnovi bioloških procesa u više područja, uključujući onkologiju, neuroznanost, razvojnu biologiju, imunologiju , i botaničke studije.

    Platforma: 10X Genomics Visium i Illumina NovaSeq

Pošaljite nam svoju poruku: