-
BMKMANU S3000_Prostorni transkriptom
Prostorna transkriptomika prednjači u znanstvenim inovacijama, osnažujući istraživače da istražuju zamršene obrasce ekspresije gena unutar tkiva, a istovremeno čuvaju njihov prostorni kontekst. Usred raznih platformi, BMKGene je razvio BMKManu S3000 prostorni transkriptomski čip, koji se može pohvaliti poboljšanom rezolucijom od 3,5 µm, dosežući subcelularni raspon i omogućujući postavke rezolucije na više razina. Čip S3000, koji ima približno 4 milijuna točaka, koristi mikrojažice preslojene zrncima napunjenim prostorno barkodiranim sondama za hvatanje. Knjižnica cDNA, obogaćena prostornim bar kodovima, priprema se iz S3000 čipa i zatim sekvencira na platformi Illumina NovaSeq. Kombinacija prostorno barkodiranih uzoraka i UMI-ja osigurava točnost i specifičnost generiranih podataka. BMKManu S3000 čip je izuzetno svestran, nudi višerazinske postavke razlučivosti koje se mogu fino prilagoditi različitim tkivima i željenim razinama detalja. Ova prilagodljivost pozicionira čip kao izvanredan izbor za različite studije prostorne transkriptomije, osiguravajući precizno prostorno grupiranje uz minimalan šum. Korištenje tehnologije segmentacije stanica s BMKManu S3000 omogućuje razgraničenje transkripcijskih podataka do granica stanica, što rezultira analizom koja ima izravno biološko značenje. Nadalje, poboljšana rezolucija S3000 rezultira većim brojem gena i UMI-ja otkrivenih po stanici, što omogućuje mnogo točniju analizu prostornih transkripcijskih obrazaca i grupiranja stanica.
-
DNBSEQ unaprijed napravljene biblioteke
DNBSEQ, koju je razvio MGI, inovativna je NGS tehnologija koja je uspjela dodatno smanjiti troškove sekvenciranja i povećati propusnost. Priprema DNBSEQ biblioteka uključuje fragmentaciju DNK, pripremu ssDNK i amplifikaciju kotrljajućeg kruga kako bi se dobile DNK nano kuglice (DNB). Oni se zatim učitavaju na čvrstu površinu i potom sekvenciraju kombinatornom sintezom sonde-sidra (cPAS). DNBSEQ tehnologija kombinira prednosti niske stope pogreške pojačanja s korištenjem uzoraka pogreške visoke gustoće s nanokuglicama, što rezultira sekvenciranjem s većom propusnošću i preciznošću.
Naša unaprijed napravljena usluga sekvenciranja knjižnice omogućuje korisnicima da pripreme Illumina knjižnice sekvenciranja iz različitih izvora (mRNA, cijeli genom, amplikon, 10x knjižnice, među ostalim), koje se pretvaraju u MGI knjižnice u našim laboratorijima da se sekvenciraju u DNBSEQ-T7, omogućujući velike količine podataka uz niže troškove.
-
Interakcija kromatina temeljena na Hi-C
Hi-C je metoda dizajnirana za hvatanje genomske konfiguracije kombiniranjem sondiranja interakcija temeljenih na blizini i sekvenciranja visoke propusnosti. Metoda se temelji na umrežavanju kromatina s formaldehidom, nakon čega slijedi digestija i ponovna ligacija na način da samo fragmenti koji su kovalentno povezani stvaraju produkte ligacije. Sekvenciranjem ovih ligacijskih proizvoda moguće je proučavati 3D organizaciju genoma. Hi-C omogućuje proučavanje distribucije dijelova genoma koji su slabo zbijeni (odjeljci A, eukromatin) i za koje je vjerojatnije da su transkripcijski aktivni, te regija koje su čvršće zbijene (odjeljci B, heterokromatin). Hi-C se također može koristiti za precizno određivanje topološki povezanih domena (TAD), regija genoma koje imaju naboranu strukturu i vjerojatno imaju slične obrasce ekspresije, te za identifikaciju kromatinskih petlji, regija DNK koje su zajedno usidrene proteinima i koje su često obogaćen regulatornim elementima. Hi-C usluga sekvenciranja BMKGene omogućuje istraživačima da istražuju prostorne dimenzije genomike, otvarajući nove puteve za razumijevanje regulacije genoma i njezinih implikacija na zdravlje i bolesti.
-
TGuide Smart Magnetic Plant RNA komplet
TGuide Smart Magnetic Plant RNA komplet
Pročistite visokokvalitetnu ukupnu RNA iz biljnih tkiva
-
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA komplet
TGuide Smart Blood/Cell/Tissue RNA komplet
Prethodno napunjeni komplet reagensa za uložak/pločicu za pročišćavanje ukupne RNK visokog prinosa, visoke čistoće, visoke kvalitete, bez inhibitora, iz životinjskog tkiva/stanice/svježe pune krvi
-
TGuide Pametni magnetni komplet DNK biljaka
TGuide Pametni magnetni komplet DNK biljaka
Pročistite visokokvalitetnu genomsku DNK iz različitih biljnih tkiva
-
TGuide Smart Soil/stool DNA Kit
TGuide Smart Soil/stool DNA Kit
Pročišćava DNK bez inhibitora visoke čistoće i kvalitete iz uzoraka tla i stolice
-
TGuide Pametni komplet za pročišćavanje DNK
Oporavlja DNK visoke kvalitete iz PCR proizvoda ili agaroznih gelova.
-
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
TGuide Smart Blood Genomic DNA Kit
Prethodno napunjeni komplet reagensa uloška/pločice za pročišćavanje genomske DNK iz krvi i buffy coata
-
TGuide Pametni komplet DNK magnetskog tkiva
Prethodno napunjeni komplet reagensa uloška/pločice za ekstrakciju genomske DNK iz životinjskih tkiva
-
TGuide Smart Universal DNA Kit
Prethodno napunjeni komplet reagensa za uložak/pločicu za pročišćavanje genomske DNK iz krvi, osušene krvne mrlje, bakterija, stanica, sline, oralnih briseva, životinjskih tkiva itd.
-
TGuide S16 Ekstraktor nukleinskih kiselina
TGuide S16 Ekstraktor nukleinskih kiselina
Stolni instrument jednostavan za korištenje, 1-8 ili 16 uzoraka u isto vrijeme
Kataloški broj / pakiranje
Mačka. Ne
ID
Broj priprema
OSE-S16-AM
1 set
-
PacBio 2+3 mRNA otopina pune duljine
Dok je sekvenciranje mRNA temeljeno na NGS-u svestran alat za kvantificiranje ekspresije gena, njegovo oslanjanje na kratka čitanja ograničava njegovu učinkovitost u složenim transkriptomskim analizama. S druge strane, PacBio sekvenciranje (Iso-Seq) koristi tehnologiju dugog čitanja, omogućujući sekvenciranje mRNA transkripata pune duljine. Ovaj pristup olakšava sveobuhvatno istraživanje alternativnog spajanja, spajanja gena i poliadenilacije, iako nije primarni izbor za kvantifikaciju ekspresije gena. Kombinacija 2+3 premošćuje jaz između Illumina i PacBio oslanjajući se na očitavanja PacBio HiFi za identifikaciju kompletnog skupa izoformi transkripta i NGS sekvenciranje za kvantificiranje identičnih izoformi.
Platforme: PacBio Sequel II/ PacBio Revio i Illumina NovaSeq;
