PACBIO transkript pune dužine

PACBIO sekvenciranje transkripta pune duljine, ISOSEQ, omogućava točnu identifikaciju izoforma transkripta, bacajući svjetlost na alternativnu poliadenilaciju i spajanje, te dovodi do preciznije analize ekspresije gena. BMKCloud PACBIO transkript cjevovoda pune duljine dizajniran je za analizu CDNA knjižnica sekvenciranih u načinu sekvenciranja kružnog konsenzusa (CCS) i identificira ne-himerne (FLNC) sekvence pune duljine, koje se zatim skupljaju u ne-smanjujuće transkripte. Naknadna BUSCO analiza procjenjuje cjelovitost sklopa transkripta. Iz okupljenog transkripta provodi se višestruke analize: alternativno spajanje, jednostavno ponavljanje slijeda (SSR), predviđanje lncRNA i odgovarajućih ciljnih gena, predviđanje novih gena, analize obitelji gena, analiza faktora transkripcije i funkcionalna napomena transkripta.