Sekvenciranje transkripta u cijeloj dužini temeljen na nanopori
Sekvenciranje nanopora razlikuje se od ostalih platformi za sekvenciranje, jer se nukleotidi čitaju izravno bez sinteze DNK i stvaraju dugo čitanje na desecima kilobaza. To osnažuje izravno očitavanje transkripta cjelovitih i rješavanje izazova u transkriptomskim studijama.
√ Niska pristranost specifična
√ Pročitavanje cDNA cijele duljine za studije strukture gena
√ Manje podataka potrebnih za pokrivanje istog broja transkripata
√ Identifikacija više izoformi po genu
√ Kvantifikacija izraza na razini izoforme
Tipični cjevovod za bioinformatiku
Najnoviji uspješni slučajevi s tehnologijama biomarker
1. Usporedne analize transkripta pune duljine otkrivaju dinamiku razvoja Gnetum Luofuense STEM
Časopis: Frontiers in Genetics
Objavljeno: ožujka 2021
Ključne riječi: Minion | Alternativno spajanje | Apa | lncRNA | Različito izraženi transkripti
Pročitajte cijeli tekst
2. Jednosmjerno kretanje malih RNA s izdanka do korijena u interspecifičnim heterograftima
Časopis: Biljke prirode
Objavljeno: siječnja 2021
Ključne riječi: Nanopore | Illumina | Otkrivanje mobilne mRNA pune duljine
3. Analiza transkripta pune duljine korijena šparoga otkriva molekularni mehanizam tolerancije soli izazvanog arbuskularnim mikoriznim gljivicama
Časopis: okolišna i eksperimentalna botanika
Objavljeno: siječnja 2021
Ključne riječi: Minion | Različito izraženi transkripti | Transkripcijski faktori | Alternativno spajanje
4. Fiziološke karakteristične promjene i transkript pune duljine korijena i lišća Rosa Chinensis kao odgovor na stres na suši
Časopis: Fiziologija biljaka i stanica
Objavljeno: listopad 2020
Ključne riječi: Promethion | Različito izraženi transkripti | Funkcionalno predviđanje | Spojeni izoformi | Tf i lncRNA
5. Analiza i sveobuhvatna usporedba PACBIO i RNA sekvenciranja RNA temeljenog na nanoporu Arabidopsis transkripta
Časopis: Metoda biljaka
Objavljeno: travanj 2020
Ključne riječi: Gridion | Promethion | PACBIO SEDJEĆE | Illumina Novaseq | Poravnavanje genoma | Identifikacija transkripta | Alternativno spajanje | SSR | LncRNA | Kvantifikacija izoforme
Vijesti i istaknuti dijelovi Cilj je dijeliti najnovije uspješne slučajeve s tehnologijama Biomarker, snimajući nova znanstvena dostignuća kao i istaknute tehnike primijenjene tijekom studije.
Post Vrijeme: siječanj-08-2022