Genom
Sastavljanje kromosoma i analiza biomase usjeva Miscanthus lutarioriparius genom
Sekvenciranje nanopora | Illumina | Hi-c | RNA-sekvenciranje | Filogenija
U ovom istraživanju, Biomarker Technologies pružio je tehničku podršku za sekvenciranje nanopora, de novo sastavljanje genoma, montažu potpomognutog hi-c, itd.
Sažetak
Micnthus, rizomatozna višegodišnja biljka, ima veliki potencijal za proizvodnju bioenergije zbog svoje visoke biomase i tolerancije na stres. Izvještavamo o sklopu kromosomaMiscanthus LutarioripariusGenom kombinirajući Oxford Nanopore sekvenciranje i Hi-C tehnologije. Sklop 2,07-GB pokriva 96,64% genoma, s kontig N50 od 1,71 MB. Sekvence centromera i telomera sastavljaju se za svih 19 kromosoma i kromosoma 10. Alotetraploidno podrijetlo M. lutarioriparius je pomiješano pomoću centromernih satelitskih ponavljanja. Jasno su prikazana struktura tetraploidnog genoma i nekoliko kromosomskih preuređenja u odnosu na sireve. Tandem duplicirani geniM. Lutarioripariusfunkcionalno su obogaćeni ne samo u izrazima povezanim s reakcijom na stres, već i biosintezi stanične stijenke. Obitelji gena povezane s otpornošću na bolest, biosinteza stanične stijenke i transport iona metala uvelike se proširuju i evoluiraju. Širenje ovih obitelji može biti važna genomska osnova za poboljšanje izvanrednih osobinaM. Lutarioriparius.
Ključna statistika sastavljanja genoma
Lik. Pregled Skupštine genoma M. lutarioriparius
Vijesti i istaknuti dijelovi Cilj je dijeliti najnovije uspješne slučajeve s tehnologijama Biomarker, snimajući nova znanstvena dostignuća kao i istaknute tehnike primijenjene tijekom studije.
Post Vrijeme: siječanj-05-2022