Složeni i varijabilni alternativni izoformi u organizmima važni su genetski mehanizmi za regulaciju ekspresije gena i raznolikosti proteina. Točna identifikacija struktura transkripta osnova je za dubinsko istraživanje obrazaca regulacije ekspresije gena. Platforma za sekvenciranje nanopora uspješno je donijela transkriptomsku studiju na razinu izoforme. Ova platforma za analizu osmišljena je za analizu podataka RNA-SEQ generirane na platformi Nanopore na bazi referentnog genoma, koja postiže kvalitativne i kvantitativne analize i na razini gena i na razini transkripata.
